34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2028 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2028  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  716    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0314361 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2918  hypothetical protein  51.73 
 
 		 353 aa  319  5e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0858  hypothetical protein  41.62 
 
 		 373 aa  215  9e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7454  hypothetical protein  43.1 
 
 		 347 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.774061  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4153  hypothetical protein  36.89 
 
 		 363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.989771  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3766  hypothetical protein  36.42 
 
 		 349 aa  189  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1263  hypothetical protein  36.6 
 
 		 350 aa  176  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2746  hypothetical protein  34.78 
 
 		 355 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3591  hypothetical protein  34.29 
 
 		 356 aa  159  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10704  hypothetical protein  33.33 
 
 		 349 aa  144  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6238  hypothetical protein  35.16 
 
 		 358 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0814  hypothetical protein  30.33 
 
 		 362 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4596  hypothetical protein  31.23 
 
 		 274 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316655  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07770  uncharacterized conserved protein (DUF2332)  33.51 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0887642 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0177  hypothetical protein  29.18 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.607974  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0324  protein of unknown function UCP012608  30.43 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00596462  normal  0.0240651 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1412  hypothetical protein  33.33 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127467  hitchhiker  0.0000136786 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2974  hypothetical protein  21.5 
 
 		 348 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3393  hypothetical protein  31.63 
 
 		 339 aa  65.9  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1455  hypothetical protein  34.63 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2767  hypothetical protein  24.03 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2269  hypothetical protein  22.03 
 
 		 241 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0672878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0817  hypothetical protein  31.02 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3010  hypothetical protein  22.78 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0357086  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01400  uncharacterized conserved protein (DUF2332)  31.07 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2761  hypothetical protein  22.46 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0637564  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2969  hypothetical protein  22.46 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000226097 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2973  hypothetical protein  22.46 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121649  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2711  hypothetical protein  22.46 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00787314  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2691  hypothetical protein  22.46 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3010  hypothetical protein  21.94 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.253861  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1968  protein of unknown function UCP012608  30.36 
 
 		 328 aa  50.8  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000182349  unclonable  0.0000000414728 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06550  hypothetical protein  26.72 
 
 		 391 aa  49.7  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1037  hypothetical protein  31.74 
 
 		 371 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314959  normal  0.0209911 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>