92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1999 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1999  phage major capsid protein, HK97  100 
 
 		 380 aa  757    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431544 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  57.7 
 
 		 380 aa  442  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0867  HK97 family phage major capsid protein  48.07 
 
 		 407 aa  348  1e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.887226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1655  phage major capsid protein, HK97 family  47.27 
 
 		 406 aa  330  3e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0906  HK97 family phage major capsid protein  47.7 
 
 		 435 aa  326  5e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.225289  normal  0.497938 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  47.98 
 
 		 417 aa  325  8.000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  47.41 
 
 		 430 aa  323  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2266  phage major capsid protein, HK97 family  45.89 
 
 		 401 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000739522 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2263  phage major capsid protein, HK97 family  45.89 
 
 		 401 aa  322  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0574985 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  48.92 
 
 		 428 aa  322  7e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  47.03 
 
 		 421 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1190  HK97 family phage major capsid protein  48.31 
 
 		 401 aa  319  5e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012399 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  47.99 
 
 		 431 aa  319  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1167  Phage major capsid protein, HK97  47.17 
 
 		 417 aa  317  2e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  47.51 
 
 		 403 aa  312  6.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  45.31 
 
 		 421 aa  311  9e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1431  HK97 family phage major capsid protein  46.25 
 
 		 421 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  45.99 
 
 		 416 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3913  HK97 family phage major capsid protein  44.96 
 
 		 408 aa  303  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511324  normal  0.0176262 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2096  phage major capsid protein, HK97 family  48.79 
 
 		 418 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0589  HK97 family major capsid protein  48.08 
 
 		 424 aa  301  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3481  Phage major capsid protein, HK97  46.92 
 
 		 417 aa  292  8e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1338  phage major capsid protein HK97 family  49.06 
 
 		 420 aa  286  5e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  46.84 
 
 		 405 aa  285  8e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  41.94 
 
 		 441 aa  281  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  40.27 
 
 		 425 aa  279  6e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6186  phage major capsid protein HK97 family  38.96 
 
 		 471 aa  277  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423125  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  44.96 
 
 		 398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1635  phage major capsid protein, HK97  48.29 
 
 		 393 aa  268  1e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.304591  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2898  HK97 family phage major capsid protein  42.12 
 
 		 388 aa  267  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593833  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1542  Phage major capsid protein, HK97  41.13 
 
 		 419 aa  265  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2500  phage major capsid protein, HK97 family  39.78 
 
 		 416 aa  261  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00454127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1078  HK97 family phage major capsid protein  46.86 
 
 		 387 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.506947 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0540  putative major capsid protein  42.95 
 
 		 388 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1133  HK97 family phage major capsid protein  45.28 
 
 		 387 aa  248  8e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2471  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  45.28 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3709  HK97 family phage major capsid protein  38.11 
 
 		 450 aa  242  9e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0458  HK97 family phage major capsid protein  31.81 
 
 		 399 aa  204  1e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.830326  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  34.04 
 
 		 389 aa  199  9e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0644  HK97 family phage major capsid protein  36.99 
 
 		 379 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146587 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0795  HK97 family phage major capsid protein  36.05 
 
 		 379 aa  196  6e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  36.27 
 
 		 389 aa  193  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  33.69 
 
 		 403 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  36.79 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  36.79 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0466  HK97 family phage major capsid protein  30.25 
 
 		 369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0256  HK97 family phage major capsid protein  30.89 
 
 		 382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0170854  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1334  HK97 family phage major capsid protein  35.39 
 
 		 424 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.280266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  33.07 
 
 		 382 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  34.66 
 
 		 386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  34.21 
 
 		 385 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  33.16 
 
 		 384 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  29.52 
 
 		 383 aa  171  3e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  31.77 
 
 		 385 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  33.44 
 
 		 385 aa  157  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  33.44 
 
 		 385 aa  157  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  33.22 
 
 		 400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  34.84 
 
 		 420 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  31.62 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  31.86 
 
 		 390 aa  143  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  33.11 
 
 		 392 aa  142  7e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  31.67 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  31.33 
 
 		 397 aa  140  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  28.19 
 
 		 405 aa  139  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3970  HK97 family phage major capsid protein  29.39 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33538 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  27.85 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  29.65 
 
 		 411 aa  109  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  28.39 
 
 		 417 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  27.6 
 
 		 312 aa  96.7  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  23.57 
 
 		 315 aa  90.5  4e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  25.71 
 
 		 427 aa  88.2  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  25.71 
 
 		 427 aa  88.2  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3486  HK97 family phage major capsid protein  25.77 
 
 		 394 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168874  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  25.71 
 
 		 427 aa  88.2  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  22.86 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  26.45 
 
 		 562 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4361  phage major capsid protein, HK97  28.43 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455164  normal  0.407566 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1970  major capsid-like protein  27.79 
 
 		 425 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2179  phage major capsid protein, HK97 family  27.54 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  24.81 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2598  HK97 family phage major capsid protein  25.36 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2995  phage major capsid protein, gp36  25.66 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12666  phiRv2 prophage protein  27.01 
 
 		 479 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.5272e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4253  phage major capsid protein, HK97 family  21.39 
 
 		 440 aa  53.9  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5360  HK97 family phage major capsid protein  21.01 
 
 		 346 aa  53.1  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4981  HK97 family phage major capsid protein  21.12 
 
 		 359 aa  53.1  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  23.11 
 
 		 438 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  22.11 
 
 		 514 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1684  phage phi-C31 GP36-like protein  22.39 
 
 		 412 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0627  phage major capsid protein, HK97 family  21.9 
 
 		 368 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2593  HK97 family phage major capsid protein  18.85 
 
 		 391 aa  44.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3898  major capsid protein HK97  26.74 
 
 		 279 aa  44.3  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>