13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1816 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



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Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1816  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  188  3e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0040301  normal  0.186382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0665  hypothetical protein  93.48 
 
 
92 aa  174  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00921375  normal  0.286468 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1724  hypothetical protein  93.33 
 
 
104 aa  169  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.814003  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2869  hypothetical protein  97.65 
 
 
85 aa  168  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2757  hypothetical protein  96.47 
 
 
88 aa  166  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.185764  normal  0.771179 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3126  hypothetical protein  96.47 
 
 
85 aa  166  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3100  hypothetical protein  97.59 
 
 
83 aa  164  3e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.466356  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3065  hypothetical protein  95.29 
 
 
85 aa  164  5e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277532  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1665  hypothetical protein  95.29 
 
 
85 aa  163  6e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.704705  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1937  hypothetical protein  94.12 
 
 
85 aa  161  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0996  hypothetical protein  95.18 
 
 
83 aa  160  7e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216755  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1824  hypothetical protein  92.77 
 
 
83 aa  157  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.725883  normal  0.175308 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1452  hypothetical protein  93.98 
 
 
83 aa  156  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
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