More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1792 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  100 
 
 
142 aa  278  2e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  76.74 
 
 
135 aa  198  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  59.09 
 
 
137 aa  159  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  59.09 
 
 
142 aa  159  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  60.94 
 
 
136 aa  157  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  62.7 
 
 
138 aa  157  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  60.8 
 
 
135 aa  157  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  60.61 
 
 
134 aa  155  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  61.72 
 
 
137 aa  155  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  60.8 
 
 
138 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  60.8 
 
 
132 aa  152  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  60.8 
 
 
133 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  59.09 
 
 
347 aa  152  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  60.47 
 
 
144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  57.58 
 
 
138 aa  150  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  65.52 
 
 
138 aa  150  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  57.58 
 
 
138 aa  150  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  60.48 
 
 
128 aa  150  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  61.48 
 
 
133 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  58.4 
 
 
132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  63.41 
 
 
136 aa  150  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  59.2 
 
 
132 aa  149  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  59.2 
 
 
132 aa  149  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  57.58 
 
 
135 aa  149  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  59.5 
 
 
129 aa  148  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  60.32 
 
 
151 aa  148  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  59.2 
 
 
132 aa  148  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  60.66 
 
 
133 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  56.3 
 
 
150 aa  147  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  59.84 
 
 
137 aa  147  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  65.49 
 
 
138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  65.49 
 
 
138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  59.84 
 
 
133 aa  142  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  55.81 
 
 
334 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  62.83 
 
 
146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  58.62 
 
 
135 aa  138  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  62.73 
 
 
138 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  61.82 
 
 
138 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  50 
 
 
137 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  49.62 
 
 
138 aa  127  8.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  46.21 
 
 
318 aa  108  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  53.04 
 
 
149 aa  107  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
153 aa  101  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  37.6 
 
 
134 aa  95.9  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.6 
 
 
128 aa  95.5  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.6 
 
 
128 aa  95.5  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.64 
 
 
131 aa  95.5  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.6 
 
 
128 aa  95.5  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  36.8 
 
 
134 aa  94.7  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  42.86 
 
 
322 aa  94.4  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.64 
 
 
131 aa  94.4  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  43.9 
 
 
310 aa  94  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.84 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  40 
 
 
142 aa  92  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  43.8 
 
 
302 aa  92  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  45.74 
 
 
320 aa  92  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  41.13 
 
 
317 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.35 
 
 
132 aa  90.5  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  44.96 
 
 
320 aa  90.1  8e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  41.8 
 
 
321 aa  90.1  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  42.24 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  43.8 
 
 
329 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  43.8 
 
 
329 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  40 
 
 
314 aa  87.4  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  41.32 
 
 
312 aa  87  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  42.97 
 
 
316 aa  87.4  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  41.67 
 
 
315 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36 
 
 
134 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  40 
 
 
141 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  34.88 
 
 
128 aa  85.1  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  41.67 
 
 
315 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  41.01 
 
 
383 aa  84.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 
138 aa  84.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00100  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase, marked preference for dGTP  34.11 
 
 
129 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.126012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3501  mutator MutT protein  34.11 
 
 
129 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.21 
 
 
128 aa  84.3  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.21 
 
 
128 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.21 
 
 
128 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3558  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.11 
 
 
129 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.016637  hitchhiker  0.00136766 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00099  hypothetical protein  34.11 
 
 
129 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  40.83 
 
 
316 aa  84  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.88 
 
 
131 aa  84  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  hitchhiker  0.00538151 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0093  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.11 
 
 
129 aa  84  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000316081  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  42.5 
 
 
313 aa  84  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  40.83 
 
 
306 aa  84  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  34.4 
 
 
329 aa  84  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0146  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.88 
 
 
131 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0105  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.11 
 
 
129 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000458525  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.9 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0101  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.11 
 
 
129 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708829  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.53 
 
 
135 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2154  NUDIX hydrolase  44.36 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114898  hitchhiker  0.00867781 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  41.88 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  42.45 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.09 
 
 
138 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  43.31 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.09 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0107  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.86 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000992989  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  41.84 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  34.85 
 
 
131 aa  80.9  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>