109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1791 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1791  methyltransferase type 12  100 
 
 
260 aa  502  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0560  methyltransferase type 11  46.77 
 
 
305 aa  196  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160345  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3533  putative methyltransferase protein  40.98 
 
 
294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2511  hypothetical protein  37.78 
 
 
299 aa  152  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.282001 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3971  methyltransferase  41.73 
 
 
289 aa  152  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3824  putative methyltransferase protein  40.23 
 
 
294 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563135  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0366  hypothetical protein  36.47 
 
 
296 aa  152  8e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1879  hypothetical protein  39.02 
 
 
297 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2109  hypothetical protein  39.74 
 
 
263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0900704  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2265  methyltransferase type 11  38.87 
 
 
305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45825  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1809  hypothetical protein  39.02 
 
 
297 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4813  methyltransferase type 11  41.6 
 
 
292 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000890432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0385  Methyltransferase type 11  42.21 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.576997  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3007  methyltransferase type 11  39.47 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1027  methyltransferase type 11  39.02 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1735  methyltransferase type 11  38.95 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0309  methyltransferase type 11  43.35 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1710  Methyltransferase type 11  41.22 
 
 
295 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281828  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0353  Methyltransferase type 11  42.97 
 
 
297 aa  145  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0522  methyltransferase  41.89 
 
 
279 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.255454 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0109  methyltransferase type 11  40.23 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2677  methyltransferase type 11  39.92 
 
 
296 aa  132  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3105  methyltransferase type 11  41.54 
 
 
311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344458  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0481  methyltransferase  40.15 
 
 
312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0386  methyltransferase  39.77 
 
 
289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.559124  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2968  Methyltransferase type 11  40.84 
 
 
299 aa  125  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0599  Methyltransferase type 11  39.85 
 
 
274 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7593  hypothetical protein  39.92 
 
 
281 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0427601 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1136  methyltransferase type 11  37.78 
 
 
298 aa  124  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577473  normal  0.78298 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0125  Methyltransferase type 11  38.95 
 
 
289 aa  124  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.478416  normal  0.0344418 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0938  methyltransferase type 11  37.08 
 
 
304 aa  123  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0736  hypothetical protein  36.36 
 
 
308 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.3398  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0028  hypothetical protein  45.88 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2901  hypothetical protein  35.61 
 
 
279 aa  115  8.999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.525619  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0294  hypothetical protein  38.34 
 
 
293 aa  102  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01100  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
348 aa  97.8  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.336203  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1494  methyltransferase type 11  36.91 
 
 
257 aa  97.1  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2584  SAM-dependent methyltransferase  35.63 
 
 
279 aa  96.7  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58842  predicted protein  25.32 
 
 
354 aa  96.3  4e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.040839  decreased coverage  0.00802664 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89745  predicted protein  31.18 
 
 
274 aa  96.3  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.588911 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3499  SAM-dependent methyltransferase  34.67 
 
 
289 aa  95.1  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2634  hypothetical protein  39.5 
 
 
272 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1196  SAM-dependent methyltransferase  38.19 
 
 
270 aa  90.1  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2857  SAM-dependent methyltransferase  38.19 
 
 
270 aa  90.1  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11990  predicted protein  27.66 
 
 
330 aa  90.1  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04918  conserved hypothetical protein  33.67 
 
 
376 aa  87.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0365995  normal  0.289567 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0725  hypothetical protein  27.51 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  30.15 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0339  hypothetical protein  31.68 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  31.09 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  32.57 
 
 
291 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  31.45 
 
 
291 aa  75.5  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  30.33 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  30.23 
 
 
307 aa  72.4  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  35.96 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  32.56 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  31.91 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  31.91 
 
 
295 aa  68.9  0.00000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  27.69 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0668  hypothetical protein  27.08 
 
 
240 aa  68.2  0.0000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  28.14 
 
 
291 aa  67  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  26.16 
 
 
281 aa  65.9  0.0000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 
320 aa  65.9  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  26.16 
 
 
281 aa  65.5  0.0000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  32.22 
 
 
297 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  29.63 
 
 
292 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  29.63 
 
 
292 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.32 
 
 
321 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0424  hypothetical protein  29.41 
 
 
338 aa  52.8  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2904  methyltransferase type 11  29.26 
 
 
321 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2766  methyltransferase type 11  29.26 
 
 
321 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  28.98 
 
 
319 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2235  methyltransferase type 11  28.88 
 
 
321 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  28.88 
 
 
321 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2860  methyltransferase type 11  27.62 
 
 
279 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1400  methyltransferase type 11  26.77 
 
 
301 aa  52  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0216  Methyltransferase type 11  29.12 
 
 
313 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.320783 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  26.14 
 
 
309 aa  51.6  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0360  putative biotin synthesis protein (methyltransferase)  25.83 
 
 
367 aa  50.1  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.591727 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  24.58 
 
 
312 aa  50.1  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3817  biotin synthesis protein BioC  28.67 
 
 
310 aa  50.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  28.41 
 
 
321 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  28.99 
 
 
338 aa  49.3  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0235  Methyltransferase type 11  29.12 
 
 
313 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3539  biotin synthesis protein BioC  28.14 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.662235  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2862  biotin synthesis protein BioC  28.14 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.41686  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0454  methyltransferase type 11  27.81 
 
 
321 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  28.57 
 
 
333 aa  45.8  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0876  biotin synthesis protein BioC  31.39 
 
 
300 aa  45.4  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4394  biotin synthesis protein BioC  29.34 
 
 
304 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  28.81 
 
 
300 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3908  biotin synthesis protein BioC  30.41 
 
 
305 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3183  biotin synthesis protein BioC  30.71 
 
 
310 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 
267 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0670  hypothetical protein  30.85 
 
 
338 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562342  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0172  hypothetical protein  30.85 
 
 
338 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1420  hypothetical protein  30.85 
 
 
321 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0487  putative biotin biosynthesis protein BioC  30.85 
 
 
321 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0505  putative biotin biosynthesis protein BioC  30.85 
 
 
321 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2847  hypothetical protein  30.85 
 
 
321 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>