More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1784 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1784  secretion protein HlyD  100 
 
 		 524 aa  1031    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0136066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0293  secretion protein HlyD  35.68 
 
 		 514 aa  249  7e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287992  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4095  RND family efflux transporter MFP subunit  35.56 
 
 		 525 aa  223  9e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4388  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.18 
 
 		 551 aa  194  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.420196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2097  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.47 
 
 		 553 aa  140  6e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1583  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.16 
 
 		 564 aa  137  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.936512  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3399  RND family efflux transporter MFP subunit  28.72 
 
 		 582 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0065  RND family efflux transporter MFP subunit  29.84 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  29.66 
 
 		 386 aa  98.2  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  28.77 
 
 		 379 aa  94.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0994  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.61 
 
 		 583 aa  90.9  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0596631 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0182  RND family efflux transporter MFP subunit  28.22 
 
 		 583 aa  90.1  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.833766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4683  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.63 
 
 		 406 aa  89  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0376338  normal  0.281701 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3606  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.63 
 
 		 406 aa  89  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.676056 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0503  secretion protein HlyD  25.98 
 
 		 390 aa  86.7  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2010  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.7 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2279  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  28.3 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_003296  RS00408  putative cation efflux protein  26.95 
 
 		 344 aa  83.2  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000967818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2950  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.36 
 
 		 569 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0514  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.5 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.770818  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0205  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.24 
 
 		 378 aa  81.6  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.130265  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0772  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.84 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000602446  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0686  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.63 
 
 		 380 aa  80.5  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268178 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  27.75 
 
 		 399 aa  79.7  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4121  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmyB  28.01 
 
 		 384 aa  79.3  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  27.85 
 
 		 405 aa  79.3  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0953346  normal  0.423915 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3561  secretion protein HlyD  28.05 
 
 		 413 aa  77  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.398677 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1330  hypothetical protein  28.38 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.060147  normal  0.335287 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1766  heavy metal efflux system protein, putative  32.05 
 
 		 376 aa  76.3  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2383  hypothetical protein  29.4 
 
 		 370 aa  76.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0037846  normal  0.0270218 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2096  hypothetical protein  29.4 
 
 		 370 aa  76.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2361  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.51 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.320362 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3059  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.66 
 
 		 575 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0019  RND family efflux transporter MFP subunit  28.9 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  26.71 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1613  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.89 
 
 		 346 aa  73.2  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2988  hypothetical protein  27.3 
 
 		 416 aa  73.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.02 
 
 		 579 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.429948  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1297  RND family efflux transporter MFP subunit  25.78 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.89 
 
 		 579 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.71 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00335506  normal  0.0890337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1104  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.73 
 
 		 579 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0417227 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2832  RND family efflux transporter MFP subunit  28.49 
 
 		 575 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459229 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0579  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.53 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.087454  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2147  secretion protein HlyD  32.07 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0041  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.73 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89791  normal  0.261432 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.43 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  26.2 
 
 		 354 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1143  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.92 
 
 		 371 aa  69.7  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.144704  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1812  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.58 
 
 		 364 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  29.23 
 
 		 537 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6209  membrane fusion protein cluster 2  31.67 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.401631  normal  0.0698846 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4256  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.71 
 
 		 526 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4568  hypothetical protein  27.93 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.72 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0152  secretion protein HlyD  25.57 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3301  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.17 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  28.32 
 
 		 581 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.247146  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2719  heavy metal efflux system protein, putative  25.56 
 
 		 365 aa  67  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0333968  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2666  RND family efflux transporter MFP subunit  29.63 
 
 		 387 aa  67  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2732  RND family efflux transporter MFP subunit  24.65 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844309  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0942  acriflavine resistance protein E  24.51 
 
 		 374 aa  67  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  26.18 
 
 		 358 aa  67  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3982  RND family efflux transporter MFP subunit  25.81 
 
 		 500 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.14 
 
 		 568 aa  67  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  27.57 
 
 		 455 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  29.23 
 
 		 538 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  25.32 
 
 		 388 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  26.18 
 
 		 358 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2152  RND family efflux transporter MFP subunit  26.2 
 
 		 403 aa  66.6  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3245  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.87 
 
 		 372 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2295  RND family efflux transporter MFP subunit  29.87 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.73 
 
 		 503 aa  65.5  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.21 
 
 		 537 aa  65.1  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.99 
 
 		 519 aa  64.7  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.817622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.34 
 
 		 587 aa  64.3  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.609412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1700  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.86 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.116912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2036  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.86 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0261077  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5617  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.67 
 
 		 573 aa  63.9  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1967  RND family efflux transporter MFP subunit  27.38 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0310111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.01 
 
 		 459 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2746  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.29 
 
 		 366 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  30.1 
 
 		 517 aa  63.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5356  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.48 
 
 		 510 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3474  heavy metal efflux system protein, putative  25.48 
 
 		 526 aa  63.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  23.56 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  25.08 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3566  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.52 
 
 		 671 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.707704  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.72 
 
 		 512 aa  62.4  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0747  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.91 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0266  RND family efflux transporter MFP subunit  30.6 
 
 		 375 aa  62  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.56 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000873754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.64 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3470  RND family efflux transporter MFP subunit  27.95 
 
 		 564 aa  62  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025961  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.24 
 
 		 400 aa  62  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00705  cation efflux system protein  31.65 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333087  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2383  RND family efflux transporter MFP subunit  31.25 
 
 		 530 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182874  normal  0.0987183 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.08 
 
 		 354 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  25.08 
 
 		 354 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2097  RND family efflux transporter MFP subunit  28.91 
 
 		 391 aa  62  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.902105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>