More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1783 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2534  CzcA family heavy metal efflux protein  43.18 
 
 		 1049 aa  702    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409022  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0669  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.51 
 
 		 1092 aa  716    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725798  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3400  CzcA family heavy metal efflux protein  46.83 
 
 		 1023 aa  876    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0064  CzcA family heavy metal efflux protein  43.99 
 
 		 1039 aa  828    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4094  CzcA family heavy metal efflux protein  52.2 
 
 		 1045 aa  1010    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.966069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4387  acriflavin resistance protein  46.56 
 
 		 1030 aa  731    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285885  normal  0.792526 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1887  heavy metal efflux pump, CzcA family  44.67 
 
 		 1037 aa  733    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646993  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2073  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  38.02 
 
 		 1066 aa  691    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2351  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  38.72 
 
 		 1071 aa  711    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2063  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  38.03 
 
 		 1066 aa  693    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18570  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.41 
 
 		 1039 aa  751    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219423  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2617  heavy metal efflux pump CzcA  42.03 
 
 		 1039 aa  743    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.427313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4089  acriflavin resistance protein  40.41 
 
 		 1075 aa  683    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4126  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.75 
 
 		 1049 aa  698    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1746  heavy metal efflux pump CzcA  42.53 
 
 		 1034 aa  802    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0294  heavy metal efflux pump  51.31 
 
 		 1041 aa  1010    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.393519  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3471  CzcA family heavy metal efflux protein  42.45 
 
 		 1043 aa  747    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00106273  normal  0.764993 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1542  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.28 
 
 		 1054 aa  659    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3406  CzcA family heavy metal efflux protein  44.29 
 
 		 1043 aa  750    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2382  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.38 
 
 		 1039 aa  742    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0207882  hitchhiker  0.000762741 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2095  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.38 
 
 		 1039 aa  742    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0144  CzcA family heavy metal efflux protein  43.47 
 
 		 1047 aa  760    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1649  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  41.94 
 
 		 1039 aa  736    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.880571  normal  0.706094 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1742  CzcA family heavy metal efflux protein  43.09 
 
 		 1043 aa  754    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0110  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.32 
 
 		 1049 aa  708    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2674  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.29 
 
 		 1039 aa  738    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0949  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.57 
 
 		 1053 aa  674    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2949  acriflavin resistance protein  43.64 
 
 		 1058 aa  716    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  43 
 
 		 1048 aa  747    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998262  normal  0.0908924 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5616  acriflavin resistance protein  42.06 
 
 		 1031 aa  718    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4569  CzcA family heavy metal efflux protein  41.64 
 
 		 1039 aa  735    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0181  CzcA family heavy metal efflux protein  41.46 
 
 		 1047 aa  674    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.543317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1103  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.9 
 
 		 1049 aa  728    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442224  normal  0.0460054 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1329  CzcA family heavy metal efflux protein  42.33 
 
 		 1039 aa  744    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.039425  normal  0.381421 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3058  acriflavin resistance protein  43.25 
 
 		 1066 aa  723    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1783  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1040 aa  2025    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2098  heavy metal efflux pump, CzcA family  44.86 
 
 		 1026 aa  741    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0183  acriflavin resistance protein  38.9 
 
 		 1032 aa  657    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1991  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.86 
 
 		 1061 aa  671    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1584  heavy metal efflux pump, CzcA family  45.22 
 
 		 1034 aa  772    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2831  acriflavin resistance protein  43.35 
 
 		 1058 aa  719    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4731  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.3 
 
 		 1037 aa  713    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971345 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1142  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.47 
 
 		 1048 aa  714    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0325102  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0902  heavy metal efflux pump CzcA  37.39 
 
 		 1036 aa  623  1e-177  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1297  multidrug ABC transporter  38.3 
 
 		 1052 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1059  acriflavin resistance protein  34.4 
 
 		 1052 aa  602  1e-170  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1184  heavy metal efflux pump CzcA, putative  38.33 
 
 		 1039 aa  593  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  33.65 
 
 		 1053 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  34.15 
 
 		 1052 aa  556  1e-157  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  33.65 
 
 		 1053 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  33.65 
 
 		 1053 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3709  acriflavin resistance protein  37.29 
 
 		 1054 aa  553  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294251  decreased coverage  0.000260897 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  33.4 
 
 		 1053 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  33.4 
 
 		 1054 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  33.56 
 
 		 1053 aa  555  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  34.03 
 
 		 1049 aa  551  1e-155  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4980  acriflavin resistance protein  37.77 
 
 		 1064 aa  552  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418063  normal  0.190212 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4520  acriflavin resistance protein  37.91 
 
 		 1064 aa  546  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.52 
 
 		 1052 aa  546  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5032  acriflavin resistance protein  37.13 
 
 		 1064 aa  546  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  35.38 
 
 		 1029 aa  548  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  35.71 
 
 		 1046 aa  544  1e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  33.99 
 
 		 1048 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1632  acriflavin resistance protein  34.3 
 
 		 1046 aa  544  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951985  normal  0.0573923 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2044  CzcA family heavy metal efflux protein  33.71 
 
 		 1048 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.668471  normal  0.474032 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  36.01 
 
 		 1066 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3285  CzcA family heavy metal efflux protein  33.8 
 
 		 1048 aa  542  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.571532 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  34.08 
 
 		 1070 aa  537  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  33.11 
 
 		 1050 aa  536  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.59 
 
 		 1063 aa  538  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0079  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.95 
 
 		 1028 aa  533  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.60921  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7263  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  34.2 
 
 		 1060 aa  533  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.24626 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  34.07 
 
 		 1077 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  33.9 
 
 		 1070 aa  534  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  33.99 
 
 		 1070 aa  534  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  34.21 
 
 		 1069 aa  536  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2183  acriflavin resistance protein  34.56 
 
 		 1054 aa  534  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  33.99 
 
 		 1070 aa  535  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  33.99 
 
 		 1070 aa  535  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0147  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.56 
 
 		 1443 aa  530  1e-149  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.75 
 
 		 1049 aa  532  1e-149  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  34.29 
 
 		 1077 aa  532  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  33.88 
 
 		 1046 aa  531  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3586  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  34.6 
 
 		 1062 aa  532  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  34.31 
 
 		 1072 aa  532  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0541  CzcA family heavy metal efflux protein  35.32 
 
 		 1074 aa  529  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.865334  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  33.3 
 
 		 1063 aa  532  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  34.29 
 
 		 1077 aa  532  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  34 
 
 		 1064 aa  526  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4081  CzcA family heavy metal efflux protein  35.57 
 
 		 1082 aa  528  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0515  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.46 
 
 		 1047 aa  527  1e-148  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.750928  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3369  CzcA family heavy metal efflux protein  34.58 
 
 		 1060 aa  526  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.957207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  32.99 
 
 		 1048 aa  526  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  34.19 
 
 		 1077 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.71 
 
 		 1034 aa  528  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  34.16 
 
 		 1077 aa  529  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  34.19 
 
 		 1077 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  33.27 
 
 		 1083 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  34.19 
 
 		 1077 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  33.01 
 
 		 1051 aa  525  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>