146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1726 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1726  response regulator receiver protein  100 
 
 		 115 aa  226  9e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5346  response regulator receiver protein  42.34 
 
 		 118 aa  90.1  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3363  response regulator receiver protein  45.87 
 
 		 133 aa  86.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.387857 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6449  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2323  response regulator receiver protein  38.74 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.03657 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4234  response regulator receiver protein  46.08 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3299  response regulator receiver protein  43.43 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414312 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1267  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  33.33 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862788 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  37.39 
 
 		 846 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2399  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0186457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0470  response regulator receiver protein  36.45 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2089  response regulator receiver protein  40.78 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0717  response regulator receiver protein  42.34 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0892969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2738  response regulator receiver domain-containing protein  35.19 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4798  response regulator receiver protein  41.12 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.107601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3435  response regulator receiver protein  42.59 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465011  normal  0.396609 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3180  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0167969  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2783  response regulator receiver  35.85 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0109  response regulator receiver  40.19 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2183  response regulator receiver protein  38.38 
 
 		 134 aa  67  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7970  response regulator receiver and SARP domain protein  37.04 
 
 		 160 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304155  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1788  response regulator receiver domain-containing protein  39.05 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2608  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.186263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03021  regulatory protein  39.45 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  36.45 
 
 		 856 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3759  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.514361  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2520  response regulator receiver domain-containing protein  36.36 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.113297  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6064  response regulator receiver domain-containing protein  36.08 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4411  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  36.04 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1774  response regulator receiver  31.48 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0498529  decreased coverage  0.00379005 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  37.76 
 
 		 855 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6265  response regulator receiver protein  40.2 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1200  response regulator receiver protein  35.45 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0646  response regulator receiver domain-containing protein  38.83 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4110  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00730632  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0556  response regulator receiver  39 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.032469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  38.18 
 
 		 842 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1334  response regulator receiver protein  35.42 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.395948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1920  response regulator receiver protein  45 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1289  response regulator receiver protein  33.03 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.704465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2532  response regulator receiver protein  35.78 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  39.18 
 
 		 849 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  35.19 
 
 		 847 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0440  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0544928  normal  0.588008 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0407  response regulator receiver  35.51 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0022  response regulator receiver and SARP domain protein  34.58 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1965  response regulator receiver  43.75 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.132523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2241  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.926249 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1793  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.244756  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0251  hypothetical protein  36.45 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0019  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0611118 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  39.8 
 
 		 852 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0475  response regulator receiver protein  34.86 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  35.35 
 
 		 856 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2937  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.972944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0621  response regulator receiver protein  28.97 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1154  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  31.82 
 
 		 847 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0773  response regulator receiver  37.5 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 631 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  31.82 
 
 		 847 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  35.58 
 
 		 844 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1001  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.283402  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5004  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.325761  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6401  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0708  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal  0.880104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5707  response regulator receiver protein  33.01 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4155  response regulator receiver domain-containing protein  35.8 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.918011  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1215  response regulator receiver protein  32.73 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0588681  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2338  response regulator receiver protein  41.98 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449719  normal  0.223899 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0272  response regulator receiver protein  41.98 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.820027  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 602 aa  53.9  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5235  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0801642 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5238  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  normal  0.262734 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2651  response regulator  31.48 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00566392  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2363  response regulator receiver protein  35.45 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549917  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6261  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  36.61 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 559 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1296  response regulator receiver protein  37.97 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1396  response regulator receiver domain-containing protein  33.65 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230809  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3509  signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal  0.542318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0677  putative two component-response regulator receiver (CheY-like protein)  37.97 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.339833 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4279  response regulator receiver protein  37.11 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  33.98 
 
 		 1096 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4846  response regulator receiver protein  34.26 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  29.09 
 
 		 844 aa  50.4  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2384  response regulator receiver  30.84 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00466139  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2069  response regulator receiver domain-containing protein  29.82 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.240465  normal  0.487014 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5233  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.02 
 
 		 384 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 1111 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0013  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.67 
 
 		 314 aa  47.8  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.992585 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5541  response regulator  31.82 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2623  response regulator receiver protein  32.71 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0431  response regulator receiver protein  31.68 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0769354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4417  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 442 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.628973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1114  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 373 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1784  response regulator receiver domain-containing protein  30.69 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474362  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1461  response regulator receiver domain-containing protein  40.28 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4799  hypothetical protein  32.14 
 
 		 867 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5321  putative sensory transduction regulatory protein  43.06 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.563131  normal  0.70291 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>