More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1630 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  54.09 
 
 
689 aa  686    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1630  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
636 aa  1301    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0924694  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  54.36 
 
 
662 aa  683    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4035  peptidoglycan glycosyltransferase  43.36 
 
 
647 aa  466  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  43.03 
 
 
648 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  42.44 
 
 
648 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  42.86 
 
 
624 aa  451  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  43.03 
 
 
648 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  42.71 
 
 
628 aa  450  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  40.16 
 
 
648 aa  439  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3648  peptidoglycan glycosyltransferase  42.76 
 
 
649 aa  436  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0783266 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  41.46 
 
 
647 aa  438  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1763  penicillin-binding protein 2  45.06 
 
 
658 aa  437  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.549162  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1492  penicillin-binding protein 2  44.33 
 
 
670 aa  424  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.149057 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  42.93 
 
 
681 aa  419  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0580  penicillin-binding protein 2  39.53 
 
 
634 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39479  hitchhiker  0.00000000000028844 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0658  peptidoglycan glycosyltransferase  38.59 
 
 
639 aa  376  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83418  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0497  peptidoglycan glycosyltransferase  38.53 
 
 
634 aa  365  1e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  36.49 
 
 
643 aa  364  3e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  37.25 
 
 
639 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.53 
 
 
618 aa  353  4e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  36.33 
 
 
642 aa  348  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  36.71 
 
 
626 aa  346  8e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  37.24 
 
 
633 aa  346  8.999999999999999e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  37.67 
 
 
630 aa  346  8.999999999999999e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  36.16 
 
 
602 aa  343  7e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  36.16 
 
 
602 aa  343  7e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  36.54 
 
 
629 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  36.58 
 
 
630 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  36.43 
 
 
607 aa  336  7e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  34.9 
 
 
662 aa  335  2e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  37.13 
 
 
631 aa  334  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  35.95 
 
 
629 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  36.54 
 
 
627 aa  332  1e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  34.35 
 
 
647 aa  331  3e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  33 
 
 
643 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  36.26 
 
 
629 aa  330  6e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  34.75 
 
 
678 aa  330  7e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  36.29 
 
 
619 aa  329  9e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  36.26 
 
 
629 aa  329  9e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  33.9 
 
 
645 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  34.09 
 
 
664 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  34 
 
 
634 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  34.45 
 
 
610 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  37.2 
 
 
631 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  34.35 
 
 
618 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  37.05 
 
 
630 aa  327  5e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  34.01 
 
 
618 aa  327  5e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  34.01 
 
 
618 aa  327  5e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  34.01 
 
 
618 aa  325  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  36.43 
 
 
629 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  34.49 
 
 
636 aa  326  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  34.01 
 
 
618 aa  325  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  35.88 
 
 
646 aa  325  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  34.73 
 
 
703 aa  325  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  37.02 
 
 
631 aa  324  3e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  35.04 
 
 
609 aa  324  4e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  34.01 
 
 
618 aa  323  7e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  34.01 
 
 
618 aa  323  7e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  34.01 
 
 
618 aa  323  7e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  35.71 
 
 
646 aa  323  7e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  34.01 
 
 
618 aa  323  7e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  35.46 
 
 
629 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  35.38 
 
 
679 aa  321  3e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  36.3 
 
 
630 aa  321  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  32.11 
 
 
637 aa  321  3e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  35.28 
 
 
611 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  36.24 
 
 
655 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  35.08 
 
 
630 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3150  penicillin-binding protein 2  33.73 
 
 
634 aa  320  5e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0887106  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  34.16 
 
 
638 aa  320  5e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2964  penicillin-binding protein 2  33.06 
 
 
636 aa  320  6e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  35.91 
 
 
640 aa  320  6e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  35.74 
 
 
631 aa  320  7e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  31.37 
 
 
628 aa  320  7e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  35.74 
 
 
667 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  32.1 
 
 
637 aa  316  8e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  35.14 
 
 
632 aa  316  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  33.39 
 
 
631 aa  315  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  33.56 
 
 
631 aa  315  1.9999999999999998e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  33.39 
 
 
631 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2848  peptidoglycan glycosyltransferase  34.51 
 
 
626 aa  315  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.209414  hitchhiker  0.000000241166 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  36.46 
 
 
619 aa  314  2.9999999999999996e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  32.31 
 
 
673 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  33.16 
 
 
610 aa  313  7.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  34.39 
 
 
636 aa  313  9e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  32.88 
 
 
634 aa  312  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  33.28 
 
 
618 aa  310  5e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  33.44 
 
 
631 aa  310  5e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  33 
 
 
633 aa  310  5.9999999999999995e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08390  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.57 
 
 
640 aa  309  8e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.630549  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.44 
 
 
641 aa  310  8e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  32.82 
 
 
618 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0225  peptidoglycan glycosyltransferase  36.19 
 
 
691 aa  308  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.466269  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  35.36 
 
 
640 aa  308  3e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  33.22 
 
 
645 aa  307  3e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  33.11 
 
 
618 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0286  penicillin-binding protein 2  34.03 
 
 
655 aa  306  7e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0696  penicillin-binding protein 2  31.33 
 
 
633 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982712  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  31.33 
 
 
633 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>