136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1625 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1625  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
521 aa  1074    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.127338  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0541  alkaline phosphatase  50.38 
 
 
515 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  47.91 
 
 
529 aa  459  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4228  twin-arginine translocation pathway signal  45.47 
 
 
535 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183471  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4130  alkaline phosphatase  40.45 
 
 
530 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  45.23 
 
 
545 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  40.23 
 
 
534 aa  380  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  41.68 
 
 
555 aa  378  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  42.18 
 
 
530 aa  375  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5006  Alkaline phosphatase  42.42 
 
 
519 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  41.32 
 
 
522 aa  371  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  40.15 
 
 
531 aa  369  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3986  Alkaline phosphatase  42.48 
 
 
523 aa  365  1e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6120  Alkaline phosphatase  40.64 
 
 
563 aa  355  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51031  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  39.37 
 
 
521 aa  353  2.9999999999999997e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  40.86 
 
 
529 aa  353  5e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3226  Alkaline phosphatase  41.84 
 
 
516 aa  351  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1045  alkaline phosphatase  39.78 
 
 
528 aa  350  3e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2896  Alkaline phosphatase  41.84 
 
 
522 aa  350  4e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  39.66 
 
 
531 aa  349  8e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1673  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  40.86 
 
 
524 aa  342  9e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  42.15 
 
 
549 aa  342  1e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1735  Alkaline phosphatase  37.69 
 
 
538 aa  338  9.999999999999999e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1126  Alkaline phosphatase  38.1 
 
 
529 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1582  Alkaline phosphatase  38.25 
 
 
530 aa  335  9e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.870601  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  38.94 
 
 
511 aa  329  8e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  39.62 
 
 
538 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  41.78 
 
 
523 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  39.77 
 
 
523 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0310  alkaline phosphatase  41.72 
 
 
494 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3547  Alkaline phosphatase  38.66 
 
 
528 aa  312  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  39.51 
 
 
520 aa  306  9.000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3997  Alkaline phosphatase  38.87 
 
 
513 aa  305  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647493  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  39.04 
 
 
552 aa  300  4e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2635  Alkaline phosphatase  39.72 
 
 
529 aa  297  4e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.289906  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  38.13 
 
 
523 aa  292  8e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  37.19 
 
 
523 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  36 
 
 
540 aa  286  5e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4801  alkaline phosphatase  36.31 
 
 
502 aa  281  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3820  alkaline phosphatase  38.58 
 
 
618 aa  279  8e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00587129  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0893  alkaline phosphatase  38.43 
 
 
554 aa  278  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.20064  normal  0.526833 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1077  Alkaline phosphatase  37.52 
 
 
534 aa  273  8.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.452967  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1157  alkaline phosphatase  37.43 
 
 
534 aa  272  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0769586  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03244  alkaline phosphatase D  35.84 
 
 
558 aa  268  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1326  alkaline phosphatase  37.57 
 
 
538 aa  265  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749734  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5032  alkaline phosphatase  34.72 
 
 
544 aa  250  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.4039  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2122  Alkaline phosphatase  32.66 
 
 
531 aa  250  5e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.7149  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3516  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  34.69 
 
 
524 aa  241  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.195825  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1411  alkaline phosphatase  37.67 
 
 
529 aa  237  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0946  alkaline phosphatase  31.7 
 
 
525 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0707  alkaline phosphatase  32.04 
 
 
541 aa  221  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537391  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4037  alkaline phosphatase  31.77 
 
 
583 aa  220  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  31.34 
 
 
587 aa  214  3.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  33 
 
 
532 aa  211  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0765  alkaline phosphatase  31.55 
 
 
541 aa  211  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.387118  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2905  Alkaline phosphatase  30.21 
 
 
606 aa  207  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3582  alkaline phosphatase  30.21 
 
 
617 aa  207  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2888  Alkaline phosphatase  32.91 
 
 
540 aa  205  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0055599  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2394  alkaline phosphatase  30.62 
 
 
540 aa  204  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115123  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3609  alkaline phosphatase  30.23 
 
 
576 aa  201  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  30.91 
 
 
555 aa  200  6e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5492  Alkaline phosphatase  31.45 
 
 
575 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201843  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03467  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  28.62 
 
 
564 aa  196  9e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3573  alkaline phosphatase  32.5 
 
 
550 aa  194  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05495  hypothetical protein  28.02 
 
 
674 aa  194  4e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.840238  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3819  alkaline phosphatase  31.25 
 
 
523 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5658  Alkaline phosphatase  30.38 
 
 
596 aa  188  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0738  Alkaline phosphatase  29.43 
 
 
450 aa  183  6e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0785781  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0348  alkaline phosphatase  30.82 
 
 
574 aa  181  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3287  twin-arginine translocation pathway signal  28.71 
 
 
585 aa  179  8e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2924  alkaline phosphatase, putative  27.82 
 
 
589 aa  178  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.626118  normal  0.330722 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0820  alkaline phosphatase  28.17 
 
 
589 aa  176  9e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3596  twin-arginine translocation pathway signal  28.43 
 
 
587 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000163132  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0959  alkaline phosphatase  28.14 
 
 
589 aa  172  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0910  alkaline phosphatase  32.32 
 
 
589 aa  171  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101698 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3482  alkaline phosphatase  31.49 
 
 
588 aa  170  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3312  twin-arginine translocation pathway signal  30.12 
 
 
588 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1209  alkaline phosphatase  31.63 
 
 
600 aa  169  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0641  twin-arginine translocation pathway signal  30.12 
 
 
588 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3654  alkaline phosphatase  30.39 
 
 
588 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3609  alkaline phosphatase  27.92 
 
 
582 aa  165  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107894 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3587  Alkaline phosphatase  30.66 
 
 
588 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003734  putative alkaline phosphatase  27.98 
 
 
557 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.139476  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0832  alkaline phosphatase  25.69 
 
 
590 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02038  hypothetical protein  28.16 
 
 
557 aa  163  7e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3777  alkaline phosphatase  30.39 
 
 
588 aa  163  7e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0651  alkaline phosphatase  30.39 
 
 
588 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08622  alkaline phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08710)  26.89 
 
 
641 aa  161  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3044  alkaline phosphatase  28.4 
 
 
710 aa  155  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0355467  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0806  alkaline phosphatase, putative  30.96 
 
 
588 aa  153  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3184  alkaline phosphatase  31.77 
 
 
587 aa  147  6e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2404  alkaline phosphatase  27.81 
 
 
566 aa  142  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0979  alkaline phosphatase  33.92 
 
 
622 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1243  Alkaline phosphatase  24.95 
 
 
714 aa  136  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2613  alkaline phosphatase  26.84 
 
 
679 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1502  Alkaline phosphatase  26.63 
 
 
545 aa  126  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0092  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  47.37 
 
 
209 aa  119  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3950  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  26.69 
 
 
689 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.028055  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5489  twin-arginine translocation pathway signal  27.88 
 
 
670 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0869  Alkaline phosphatase  25.86 
 
 
539 aa  94.4  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717187  normal  0.577908 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>