163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1560 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1560  membrane protein-like protein  100 
 
 
190 aa  366  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00722707  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0241  hypothetical protein  70.21 
 
 
191 aa  238  4e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  62.01 
 
 
203 aa  225  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  64.48 
 
 
191 aa  222  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0094  hypothetical protein  61.75 
 
 
190 aa  211  4e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169792 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  59.44 
 
 
192 aa  209  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4126  hypothetical protein  58.89 
 
 
192 aa  207  6e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  57.78 
 
 
192 aa  206  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2778  hypothetical protein  58.06 
 
 
188 aa  202  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130489  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  56.67 
 
 
204 aa  202  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2431  transmembrane protein  54.45 
 
 
206 aa  201  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447861  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  55.49 
 
 
204 aa  200  1e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0520  hypothetical protein  58.86 
 
 
187 aa  199  2e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4103  hypothetical protein  55.8 
 
 
188 aa  195  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2251  protein of unknown function UPF0016  54.8 
 
 
190 aa  194  8e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305842  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1927  protein of unknown function UPF0016  54.8 
 
 
190 aa  193  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3626  hypothetical protein  64.61 
 
 
185 aa  192  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  55.87 
 
 
190 aa  191  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0577  hypothetical protein  57.98 
 
 
193 aa  190  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.188553  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  53.33 
 
 
185 aa  189  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0148  hypothetical protein  54.44 
 
 
188 aa  189  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  54.75 
 
 
218 aa  189  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0366  putative transmembrane protein  60.22 
 
 
191 aa  188  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  54.19 
 
 
190 aa  187  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  52.78 
 
 
185 aa  187  7e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  51.96 
 
 
188 aa  187  8e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  54.19 
 
 
190 aa  187  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0447  hypothetical protein  55.8 
 
 
191 aa  187  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243135  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5289  protein of unknown function UPF0016  56.91 
 
 
187 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  54.19 
 
 
218 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  56.11 
 
 
196 aa  185  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  53.33 
 
 
234 aa  185  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  53.01 
 
 
218 aa  184  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  53.01 
 
 
218 aa  184  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4428  hypothetical protein  55.21 
 
 
194 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  54.19 
 
 
190 aa  181  5e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  54.19 
 
 
190 aa  181  5e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  54.19 
 
 
190 aa  181  5e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  54.19 
 
 
190 aa  181  5e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  54.19 
 
 
190 aa  181  5e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  54.19 
 
 
190 aa  181  5e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  54.19 
 
 
190 aa  181  5e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  53.63 
 
 
190 aa  181  8e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0802  hypothetical protein  54.69 
 
 
194 aa  181  8e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1438  protein of unknown function UPF0016  52.46 
 
 
195 aa  181  8e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0788  hypothetical protein  55.21 
 
 
194 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.632611 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0575  hypothetical protein  53.07 
 
 
184 aa  179  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  52.51 
 
 
190 aa  178  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0760  hypothetical protein  54.69 
 
 
194 aa  178  5e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2039  protein of unknown function UPF0016  50.56 
 
 
196 aa  175  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.589069  hitchhiker  8.98807e-09 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2072  hypothetical protein  48.15 
 
 
201 aa  173  1e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0921348  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  52.2 
 
 
191 aa  173  1e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3666  hypothetical protein  58.58 
 
 
194 aa  172  2e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2409  hypothetical protein  49.44 
 
 
183 aa  172  3e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.936736  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0887  hypothetical protein  52.88 
 
 
241 aa  171  4e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159087  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0488  hypothetical protein  53.07 
 
 
205 aa  171  6e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4713  hypothetical protein  52.85 
 
 
194 aa  171  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133421  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3880  hypothetical protein  51.37 
 
 
188 aa  170  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  2.26161e-06  hitchhiker  2.50469e-07 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61260  hypothetical protein  55.21 
 
 
192 aa  170  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001996  hypothetical protein  50 
 
 
184 aa  169  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0516  protein of unknown function UPF0016  52.51 
 
 
187 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113311  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00451  hypothetical protein  50 
 
 
184 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  51.81 
 
 
194 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0985  hypothetical protein  51.3 
 
 
194 aa  168  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172763  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0640  hypothetical protein  49.72 
 
 
184 aa  167  8e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  51.12 
 
 
187 aa  167  9e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3189  hypothetical protein  51.4 
 
 
184 aa  167  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.372005  normal  0.740442 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3467  hypothetical protein  49.16 
 
 
184 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0950509  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3391  protein of unknown function UPF0016  49.16 
 
 
184 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3590  hypothetical protein  49.16 
 
 
184 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.976053  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0895  hypothetical protein  49.16 
 
 
184 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.363973  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41260  hypothetical protein  48.45 
 
 
194 aa  165  3e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140731  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2497  hypothetical protein  48.89 
 
 
200 aa  164  6e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  47.54 
 
 
189 aa  164  8e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5275  hypothetical protein  61.29 
 
 
192 aa  163  1e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.932867  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3939  hypothetical protein  48.39 
 
 
204 aa  162  2e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143914  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0682  hypothetical protein  53.63 
 
 
184 aa  162  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.634771  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41250  hypothetical protein  55.44 
 
 
193 aa  159  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396742  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0914  hypothetical protein  50.84 
 
 
184 aa  157  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1080  membrane protein  49.41 
 
 
189 aa  155  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0946  hypothetical protein  50.28 
 
 
198 aa  154  5e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.0960568 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0909  hypothetical protein  49.72 
 
 
197 aa  154  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0121906  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3028  hypothetical protein  49.72 
 
 
198 aa  153  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.521433 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1071  hypothetical protein  48.6 
 
 
197 aa  152  3e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0521  protein of unknown function UPF0016  52.51 
 
 
187 aa  152  3e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2940  hypothetical protein  49.16 
 
 
186 aa  150  9e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.835594  normal  0.0290979 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  39.36 
 
 
195 aa  108  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  35.14 
 
 
216 aa  106  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  3.30292e-05  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2663  hypothetical protein  37.44 
 
 
204 aa  102  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1345  protein of unknown function UPF0016  35.75 
 
 
212 aa  102  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1664  protein of unknown function UPF0016  33.86 
 
 
211 aa  101  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.508745  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5105  protein of unknown function UPF0016  39.23 
 
 
197 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.440587 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0794  hypothetical protein  34.08 
 
 
213 aa  99.4  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552893  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1084  protein of unknown function UPF0016  35.2 
 
 
215 aa  99.4  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2448  protein of unknown function UPF0016  37.23 
 
 
196 aa  98.6  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3202  hypothetical protein  48.96 
 
 
102 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1056  hypothetical protein  33.87 
 
 
231 aa  96.3  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0745  hypothetical protein  36.36 
 
 
189 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0996219  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  34.64 
 
 
216 aa  95.5  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  35.2 
 
 
218 aa  95.5  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>