More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1534 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1534  MaoC-like dehydratase  100 
 
 
150 aa  312  9.999999999999999e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.734487  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0956  dehydratase  82.67 
 
 
150 aa  268  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1641  MaoC-like dehydratase  79.05 
 
 
149 aa  256  7e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204847  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3435  MaoC domain protein dehydratase  77.55 
 
 
149 aa  256  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1877  dehydratase  75.68 
 
 
149 aa  251  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6513  MaoC domain protein dehydratase  75 
 
 
150 aa  241  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4375  MaoC domain protein dehydratase  72.97 
 
 
150 aa  233  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2706  MaoC-like dehydratase  54 
 
 
150 aa  175  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5038  MaoC domain protein dehydratase  53.33 
 
 
150 aa  174  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2290  MaoC-like dehydratase  53.33 
 
 
150 aa  172  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1254  MaoC-like protein dehydratase  62.84 
 
 
161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.373696  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2683  dehydratase  57.05 
 
 
154 aa  170  7.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0607  MaoC-like dehydratase  52.7 
 
 
150 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1013  MaoC-like dehydratase  49.33 
 
 
150 aa  160  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475086  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2315  dehydratase  49.33 
 
 
169 aa  160  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0892641  normal  0.0374532 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0292  MaoC domain protein dehydratase  50.34 
 
 
166 aa  160  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0772639  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3912  dehydratase  52.7 
 
 
169 aa  159  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.675333  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2758a  hypothetical protein  51.33 
 
 
150 aa  158  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7289  MaoC-like dehydratase  50 
 
 
153 aa  155  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2642  MaoC-like dehydratase  50 
 
 
153 aa  152  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1312  hypothetical protein  51.03 
 
 
170 aa  152  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06880  acyl dehydratase  52.45 
 
 
176 aa  150  5e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7153  MaoC-like dehydratase  48.97 
 
 
150 aa  148  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851321  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12521  oxidase regulatory-like protein  53.02 
 
 
185 aa  148  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1360  MaoC domain protein dehydratase  49.66 
 
 
160 aa  144  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0206053  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3633  dehydratase  48.98 
 
 
161 aa  143  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635263  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3701  dehydratase  48.98 
 
 
161 aa  143  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3628  MaoC-like dehydratase  48.98 
 
 
161 aa  143  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118021  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4088  dehydratase  48.98 
 
 
164 aa  143  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0156653  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2555  dehydratase  49.66 
 
 
164 aa  143  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162941  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1286  MaoC dehydratase  46 
 
 
159 aa  141  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00460  acyl dehydratase  46.26 
 
 
165 aa  141  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2716  MaoC-like dehydratase  50 
 
 
172 aa  140  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695357  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2320  MaoC domain protein dehydratase  48.32 
 
 
152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2915  MaoC domain protein dehydratase  46.62 
 
 
152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.759057  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4170  MaoC-like dehydratase  48.28 
 
 
172 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00256261  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4180  MaoC-like dehydratase  48.28 
 
 
172 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0213114  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3318  MaoC domain protein dehydratase  51.02 
 
 
175 aa  136  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5294  MaoC-like dehydratase  41.89 
 
 
169 aa  135  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0746897  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0804  MaoC domain protein dehydratase  46.71 
 
 
156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.637206  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2924  MaoC-like dehydratase  48.65 
 
 
177 aa  133  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.45225  normal  0.0805169 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4088  hypothetical protein  46.15 
 
 
166 aa  131  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977948  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0612  MaoC domain protein dehydratase  46.15 
 
 
166 aa  131  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0337105 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1726  MoaC domain-containing protein  44.59 
 
 
175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1652  MoaC domain-containing protein  44.59 
 
 
175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0702  MoaC domain-containing protein  44.59 
 
 
175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0609  MaoC domain-containing protein  44.59 
 
 
175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442461  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2304  Acyl dehydratase  44.59 
 
 
175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.69727  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2221  Acyl dehydratase  44.59 
 
 
175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1933  MoaC domain-containing protein  44.59 
 
 
175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0670  MaoC-like dehydratase  41.5 
 
 
168 aa  130  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00727845  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0007  MaoC domain protein dehydratase  45.81 
 
 
155 aa  130  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1390  dehydratase  47.3 
 
 
186 aa  130  7.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.542578  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3455  MaoC domain protein dehydratase  43.84 
 
 
199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.031511  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2737  MaoC-like dehydratase  41.1 
 
 
168 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2103  MaoC domain protein dehydratase  41.89 
 
 
159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.598637  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2533  dehydratase  44.9 
 
 
175 aa  127  6e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164666  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3849  MaoC domain protein dehydratase  46.85 
 
 
168 aa  125  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6336  MaoC-like dehydratase  41.89 
 
 
172 aa  124  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00693601  normal  0.881007 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1408  MaoC domain protein dehydratase  45.27 
 
 
175 aa  124  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147029 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2117  MaoC domain-containing protein  44.59 
 
 
175 aa  123  7e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.456393 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2157  MaoC domain-containing protein  44.59 
 
 
175 aa  123  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2267  dehydratase  44.59 
 
 
216 aa  123  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4064  dehydratase  43.24 
 
 
173 aa  122  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1216  dehydratase  41.1 
 
 
344 aa  120  6e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3463  hypothetical protein  44.14 
 
 
175 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.443162  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2919  dehydratase  41.22 
 
 
184 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1709  dehydrogenase with MaoC-like domain  43.15 
 
 
174 aa  119  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1721  dehydratase  42.66 
 
 
184 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775583  normal  0.261141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3368  hypothetical protein  44.14 
 
 
175 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.487735 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3361  hypothetical protein  44.14 
 
 
175 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.864271 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3294  FkbR2  44.14 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.754163 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0832  putative dehydratase  43.75 
 
 
161 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0146859 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0480  MaoC domain-containing protein  42.47 
 
 
174 aa  117  7.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3023  dehydratase  39.58 
 
 
171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4212  MaoC domain protein dehydratase  41.1 
 
 
174 aa  112  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2168  MaoC-like dehydratase  41.5 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.234418  normal  0.625533 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0676  dehydratase  38.51 
 
 
171 aa  110  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251329  normal  0.381536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4032  dehydratase  40.14 
 
 
190 aa  110  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.962919  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4501  dehydratase  39.46 
 
 
169 aa  110  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0462  dehydratase  40 
 
 
163 aa  107  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.244814 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0731  dehydratase  37.41 
 
 
171 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7764  MaoC domain protein dehydratase  38.1 
 
 
167 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1603  MaoC domain protein dehydratase  38.93 
 
 
172 aa  105  3e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.535625  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1582  dehydratase  40.82 
 
 
162 aa  101  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0997283  hitchhiker  0.00301397 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4264  MaoC domain protein dehydratase  36.73 
 
 
169 aa  101  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0555425  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0875  MaoC domain protein dehydratase  33.12 
 
 
161 aa  99  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1459  dehydratase  35.81 
 
 
177 aa  99  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1584  dehydratase  36.73 
 
 
166 aa  93.6  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0906655  hitchhiker  0.00294488 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7163  MaoC-like dehydratase  35.71 
 
 
167 aa  90.5  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3869  MaoC-like dehydratase  36.64 
 
 
166 aa  90.1  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7491  MaoC-like dehydratase  40.41 
 
 
165 aa  90.1  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2195  MaoC domain protein dehydratase  37.24 
 
 
161 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.300893 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2272  dehydratase  35.17 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2633  dehydratase  36.49 
 
 
343 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0973  MaoC family protein  36.49 
 
 
343 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1872  MaoC domain protein dehydratase  37.24 
 
 
161 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.760179  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4847  dehydratase  38.51 
 
 
164 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0085  dehydratase  35.14 
 
 
343 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1834  MaoC-like dehydratase  39.16 
 
 
171 aa  87.8  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.420495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>