More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1494 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1494  cytidylate kinase  100 
 
 		 209 aa  409  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.373102 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1324  cytidylate kinase  66.34 
 
 		 208 aa  248  5e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2457  cytidylate kinase  61.54 
 
 		 208 aa  230  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1111  cytidylate kinase  59.8 
 
 		 208 aa  197  7e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0614  cytidylate kinase  58.33 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00523823 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0102  cytidylate kinase  54.19 
 
 		 216 aa  188  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0066  cytidylate kinase  53.88 
 
 		 212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0168644  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2086  cytidylate kinase  58.05 
 
 		 222 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1023  cytidylate kinase  52.43 
 
 		 212 aa  179  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283753  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2129  cytidylate kinase  59.8 
 
 		 222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.29015 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0104  cytidylate kinase  54.59 
 
 		 212 aa  179  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2406  cytidylate kinase  59.8 
 
 		 222 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.311621 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0641  cytidylate kinase  53.66 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.112665 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2938  cytidylate kinase  55.29 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0208  cytidylate kinase  55.17 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.300993  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0164  cytidylate kinase  55.39 
 
 		 209 aa  175  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0398  cytidylate kinase  54.37 
 
 		 212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7108  cytidylate kinase  57.49 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978606  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0025  cytidylate kinase  49.29 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0026  cytidylate kinase  48.58 
 
 		 219 aa  171  7.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404349  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0191  cytidylate kinase  52.71 
 
 		 212 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5617  cytidylate kinase  56.1 
 
 		 212 aa  169  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.314381  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6548  cytidylate kinase  59.47 
 
 		 210 aa  167  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219054  normal  0.440161 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0030  cytidylate kinase  47.39 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3607  cytidylate kinase  49.52 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0733159  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4031  cytidylate kinase  47.55 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0197  cytidylate kinase  51.47 
 
 		 203 aa  159  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0294  cytidylate kinase  52.71 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4361  cytidylate kinase  46.08 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0102365 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0099  cytidylate kinase  52.66 
 
 		 208 aa  157  8e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.906806 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3784  cytidylate kinase  53.27 
 
 		 194 aa  156  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150684  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0030  cytidylate kinase  49.76 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0963  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  44.65 
 
 		 699 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0193  cytidylate kinase  46.15 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0150  cytidylate kinase  50.24 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3457  cytidylate kinase  44.5 
 
 		 212 aa  152  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  45.41 
 
 		 221 aa  152  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  40.91 
 
 		 229 aa  151  8e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1304  cytidylate kinase  42.11 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00011985  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3881  cytidylate kinase  49.49 
 
 		 211 aa  148  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3276  cytidylate kinase  50.49 
 
 		 211 aa  147  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.811486  normal  0.522336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  44.08 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3591  cytidylate kinase  50.49 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.39582  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0564  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  38.64 
 
 		 224 aa  145  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  42.65 
 
 		 228 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00890  cytidylate kinase  43.33 
 
 		 227 aa  144  8.000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.007598  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1332  cytidylate kinase  42.18 
 
 		 219 aa  144  8.000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000433479  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  35.78 
 
 		 218 aa  144  9e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1645  cytidylate kinase  43.41 
 
 		 225 aa  144  9e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  42.18 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  42.18 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0715  cytidylate kinase  53.19 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  43.6 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  42.53 
 
 		 229 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  42.53 
 
 		 229 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  38.29 
 
 		 226 aa  142  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  42.65 
 
 		 229 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  42.72 
 
 		 229 aa  142  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4723  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  41.94 
 
 		 675 aa  141  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.86018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2883  cytidylate kinase  42.65 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0880838  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1375  cytidylate kinase  37.27 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1371  cytidylate kinase  37.27 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2946  cytidylate kinase  42.65 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2570  cytidylate kinase  43.33 
 
 		 221 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138254  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2995  cytidylate kinase  42.65 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1637  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 228 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2243  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  45.85 
 
 		 674 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0429  cytidylate kinase  42.18 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0200  cytidylate kinase  42.18 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0948  cytidylate kinase  42.18 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2573  cytidylate kinase  42.18 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0883038  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02861  cytidylate kinase  38.29 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  43.05 
 
 		 237 aa  138  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  37.9 
 
 		 237 aa  138  4.999999999999999e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  41.7 
 
 		 232 aa  138  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  37.9 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1567  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  39.81 
 
 		 669 aa  137  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.484392  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  37.56 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1536  cytidylate kinase  36.32 
 
 		 237 aa  135  4e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000588366  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0641  cytidylate kinase  36.32 
 
 		 237 aa  135  4e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000272482  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1615  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  41.67 
 
 		 670 aa  135  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1026  cytidylate kinase  42.33 
 
 		 226 aa  135  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000434199  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  35.35 
 
 		 221 aa  135  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1674  cytidylate kinase  39.72 
 
 		 251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal  0.368895 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2334  cytidylate kinase  38.64 
 
 		 226 aa  134  7.000000000000001e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000116453  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  40.49 
 
 		 227 aa  134  7.000000000000001e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0254  cytidylate kinase  36.82 
 
 		 225 aa  134  7.000000000000001e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.13077  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0849  cytidylate kinase  41.9 
 
 		 231 aa  134  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.744629  normal  0.265979 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0930  cytidylate kinase  41.38 
 
 		 234 aa  134  8e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0955  cytidylate kinase  43.72 
 
 		 225 aa  134  9e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000242866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1598  cytidylate kinase  39.11 
 
 		 223 aa  134  9e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0908  cytidylate kinase  41.43 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  36.92 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1541  cytidylate kinase  39.35 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0778  cytidylate kinase  40 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00825892 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  34.68 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  40.72 
 
 		 251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  35.29 
 
 		 230 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  35.29 
 
 		 230 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>