More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1468 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1468  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 		 294 aa  585  1e-166  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  53.92 
 
 		 292 aa  285  5e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6089  phosphoserine phosphatase  52.65 
 
 		 296 aa  242  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  50.52 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  51.5 
 
 		 297 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2096  phosphoserine phosphatase SerB  56.7 
 
 		 226 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.646648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  46.51 
 
 		 309 aa  229  5e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  53.54 
 
 		 289 aa  226  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3316  phosphoserine phosphatase  47.44 
 
 		 292 aa  221  8e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.979977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3257  phosphoserine phosphatase SerB  50.19 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.230695 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  47.49 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3139  phosphoserine phosphatase SerB  49.62 
 
 		 325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.598874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  47.49 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  49.83 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  48.46 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2345  phosphoserine phosphatase SerB  49.01 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2724  phosphoserine phosphatase SerB  55.07 
 
 		 241 aa  217  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  48.45 
 
 		 291 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0812  phosphoserine phosphatase SerB  46.15 
 
 		 291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 		 296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2797  phosphoserine phosphatase SerB  43.43 
 
 		 296 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2240  phosphoserine phosphatase SerB  51.13 
 
 		 297 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110047  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1744  phosphoserine phosphatase  46.54 
 
 		 295 aa  211  9e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121425  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1800  phosphoserine phosphatase SerB  46.77 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1348  phosphoserine phosphatase SerB  46.74 
 
 		 299 aa  211  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.561677  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  44.44 
 
 		 295 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1391  phosphoserine phosphatase  46.36 
 
 		 299 aa  209  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115011  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  49.03 
 
 		 291 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2538  phosphoserine phosphatase SerB  43.14 
 
 		 296 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1350  phosphoserine phosphatase  49.03 
 
 		 291 aa  209  7e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2835  phosphoserine phosphatase SerB  47.81 
 
 		 332 aa  206  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.978803  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  46 
 
 		 298 aa  205  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0252  phosphoserine phosphatase  41.5 
 
 		 291 aa  202  7e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0008  phosphoserine phosphatase SerB  47.86 
 
 		 291 aa  198  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197314 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  41.84 
 
 		 296 aa  196  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1777  phosphoserine phosphatase SerB  51.6 
 
 		 298 aa  193  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3292  phosphoserine phosphatase SerB  43.23 
 
 		 297 aa  191  9e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117576  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4531  phosphoserine phosphatase SerB  51.75 
 
 		 297 aa  191  9e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.545382 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2259  phosphoserine phosphatase  54.88 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.148184  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1660  phosphoserine phosphatase SerB  46.94 
 
 		 299 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  45.58 
 
 		 404 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  45.26 
 
 		 415 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  45.81 
 
 		 404 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  45.26 
 
 		 404 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  45.79 
 
 		 404 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  47.11 
 
 		 409 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  45.79 
 
 		 429 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  41.45 
 
 		 410 aa  178  8e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  44.35 
 
 		 404 aa  178  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  45.58 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  45.45 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  42.74 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  45.58 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  45.58 
 
 		 326 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  44.7 
 
 		 404 aa  176  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  44.39 
 
 		 429 aa  175  7e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  44.87 
 
 		 325 aa  175  8e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  45.83 
 
 		 322 aa  175  9e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  45.83 
 
 		 322 aa  175  9e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  45.83 
 
 		 322 aa  175  9e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  45.83 
 
 		 322 aa  175  9e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  45.83 
 
 		 322 aa  175  9e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  45.83 
 
 		 322 aa  175  9e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  45.83 
 
 		 322 aa  175  9e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  45.83 
 
 		 322 aa  175  9e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  41.59 
 
 		 410 aa  173  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  45.37 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  45.32 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  43.61 
 
 		 418 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  41.56 
 
 		 432 aa  172  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  44.55 
 
 		 281 aa  172  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  42.86 
 
 		 413 aa  172  5.999999999999999e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  46.12 
 
 		 325 aa  172  5.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  42.6 
 
 		 410 aa  172  6.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  43.33 
 
 		 404 aa  172  7.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  43.36 
 
 		 418 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  42.02 
 
 		 406 aa  171  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  41.45 
 
 		 412 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  44.91 
 
 		 322 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  42.22 
 
 		 403 aa  169  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4990  phosphoserine phosphatase  45.37 
 
 		 322 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  45.37 
 
 		 322 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  45.37 
 
 		 322 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  45.37 
 
 		 322 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  45.37 
 
 		 322 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  42.31 
 
 		 438 aa  168  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  44.44 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  46.76 
 
 		 406 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3544  phosphoserine phosphatase SerB  44.28 
 
 		 326 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084049 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2817  phosphoserine phosphatase SerB  44.28 
 
 		 331 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  44.55 
 
 		 279 aa  165  8e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  42.18 
 
 		 435 aa  165  9e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  41.89 
 
 		 398 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  44.69 
 
 		 414 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  42.52 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1042  phosphoserine phosphatase  43.78 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193123 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0538  phosphoserine phosphatase SerB  42.62 
 
 		 372 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000117789  unclonable  0.0000000000304475 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3222  phosphoserine phosphatase SerB  43.35 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1107  phosphoserine phosphatase  43 
 
 		 330 aa  163  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829453 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1007  phosphoserine phosphatase SerB  41.01 
 
 		 328 aa  163  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>