More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1463 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 822 aa  1655    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  46.54 
 
 		 784 aa  623  1e-177  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  34.95 
 
 		 777 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  33.42 
 
 		 734 aa  392  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  35.81 
 
 		 856 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  35 
 
 		 795 aa  369  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  34.39 
 
 		 752 aa  358  2.9999999999999997e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  35.65 
 
 		 777 aa  346  8e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  33.63 
 
 		 753 aa  326  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  33.72 
 
 		 802 aa  313  5.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 747 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 786 aa  282  2e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 763 aa  280  7e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  30.37 
 
 		 785 aa  272  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  30.31 
 
 		 771 aa  268  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 791 aa  264  4.999999999999999e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 808 aa  263  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 742 aa  254  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 762 aa  254  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 766 aa  254  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  30.78 
 
 		 712 aa  251  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 795 aa  246  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 795 aa  244  7e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 780 aa  242  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 780 aa  242  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 792 aa  241  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 		 806 aa  239  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 847 aa  239  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 797 aa  234  4.0000000000000004e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 757 aa  231  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 802 aa  229  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 807 aa  225  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 781 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  29.01 
 
 		 889 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 875 aa  208  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 808 aa  206  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 757 aa  206  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 790 aa  204  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 720 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 732 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 774 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 798 aa  201  5e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 778 aa  200  9e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 778 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 704 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 763 aa  197  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 753 aa  197  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 795 aa  197  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  27.09 
 
 		 767 aa  193  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 730 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 764 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 713 aa  191  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 751 aa  190  9e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 784 aa  187  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 724 aa  187  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 722 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 755 aa  182  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  25.95 
 
 		 715 aa  182  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 723 aa  181  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 736 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 853 aa  180  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 779 aa  178  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3036  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 904 aa  178  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637497  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 851 aa  177  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 822 aa  177  9e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 783 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 776 aa  177  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.700663 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  24.88 
 
 		 846 aa  177  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 794 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 734 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 773 aa  175  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 786 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  27.96 
 
 		 695 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 730 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 803 aa  174  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 726 aa  174  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  27.33 
 
 		 739 aa  174  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 755 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 775 aa  173  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2426  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 804 aa  172  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812429  normal  0.91606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 732 aa  172  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 717 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 786 aa  171  5e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 763 aa  171  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 700 aa  170  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 743 aa  170  9e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1050  TonB-dependent receptor, plug  25.74 
 
 		 830 aa  169  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.908027 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 790 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 761 aa  169  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  26.3 
 
 		 759 aa  168  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 790 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 769 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  26.39 
 
 		 776 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 784 aa  167  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 747 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 730 aa  165  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 741 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 726 aa  164  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 731 aa  164  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 702 aa  164  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>