More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1444 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  100 
 
 		 178 aa  360  7.0000000000000005e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2562  transcription antitermination protein nusG  82.68 
 
 		 179 aa  299  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0500837 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0832  transcription antitermination protein nusG  78.09 
 
 		 178 aa  292  2e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  61.71 
 
 		 185 aa  229  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  62.29 
 
 		 176 aa  229  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  62.86 
 
 		 176 aa  228  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  62.29 
 
 		 176 aa  228  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  62.29 
 
 		 176 aa  228  5e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  62.29 
 
 		 176 aa  227  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  62.29 
 
 		 176 aa  227  8e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  61.14 
 
 		 176 aa  225  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  61.71 
 
 		 176 aa  225  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  58.29 
 
 		 185 aa  218  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1818  transcription antitermination protein NusG  58.52 
 
 		 176 aa  216  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  58.52 
 
 		 176 aa  216  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3997  transcription termination/antitermination factor NusG  60.8 
 
 		 177 aa  214  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4478  NusG antitermination factor  60.8 
 
 		 177 aa  214  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4366  NusG antitermination factor  60.8 
 
 		 177 aa  214  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1824  transcription antitermination protein NusG  60.8 
 
 		 174 aa  214  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3863  NusG antitermination factor  58.29 
 
 		 176 aa  214  7e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0971314 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0973  transcription antitermination protein NusG  57.39 
 
 		 176 aa  214  7e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943054 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1342  NusG antitermination factor  57.71 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.204626  normal  0.0694294 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0367  NusG antitermination factor  60.23 
 
 		 177 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527388  normal  0.813654 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3845  NusG antitermination factor  60.57 
 
 		 177 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  57.14 
 
 		 176 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_004310  BR1249  transcription antitermination protein NusG  56.82 
 
 		 175 aa  212  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1025  transcription antitermination protein NusG  57.63 
 
 		 176 aa  211  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1210  transcription antitermination protein NusG  56.82 
 
 		 175 aa  212  2.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1894  NusG antitermination factor  60.23 
 
 		 177 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0214948  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1942  transcription antitermination protein NusG  56.82 
 
 		 175 aa  211  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321032  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1319  transcription antitermination protein NusG  56.82 
 
 		 176 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.20753  normal  0.259679 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1417  transcription antitermination protein NusG  56.82 
 
 		 176 aa  210  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.311768 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1807  transcription antitermination protein nusG  57.95 
 
 		 177 aa  209  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.379623  normal  0.264433 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0566  transcription antitermination protein NusG  55.37 
 
 		 176 aa  206  2e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268519  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  53.71 
 
 		 176 aa  202  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  52 
 
 		 177 aa  190  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  52 
 
 		 177 aa  188  4e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0314  transcription termination/antitermination factor NusG  49.14 
 
 		 177 aa  187  8e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.655686  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0485  NusG antitermination factor  49.14 
 
 		 177 aa  187  8e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00514524  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  50.86 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0393  transcription antitermination protein nusG  50.8 
 
 		 187 aa  185  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772348 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0283  NusG antitermination factor  51.43 
 
 		 177 aa  185  4e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912407  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  49.71 
 
 		 177 aa  184  5e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3350  transcription antitermination protein NusG  50.29 
 
 		 177 aa  184  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.309973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3039  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 194 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0219  transcription antitermination protein NusG  50.86 
 
 		 183 aa  182  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3771  NusG antitermination factor  50.86 
 
 		 183 aa  182  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000919  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3597  NusG antitermination factor  48.57 
 
 		 202 aa  182  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259347  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  50 
 
 		 188 aa  182  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2226  NusG antitermination factor  49.15 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0470266 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0187  transcription antitermination protein nusG  50.86 
 
 		 183 aa  182  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000177465  hitchhiker  0.00840518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0182  transcription antitermination protein nusG  50.86 
 
 		 183 aa  182  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000371558  normal  0.0116836 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0187  transcription antitermination protein nusG  50.86 
 
 		 183 aa  182  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000254051  normal  0.0190585 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4068  NusG antitermination factor  50.29 
 
 		 183 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000120393  hitchhiker  0.00918489 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0188  NusG antitermination factor  50.29 
 
 		 183 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000173496  hitchhiker  0.000578467 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002168  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 182 aa  181  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000118825  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4470  NusG antitermination factor  50.29 
 
 		 183 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0184  NusG antitermination factor  50.29 
 
 		 183 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000410017  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3456  transcription antitermination protein NusG  48.3 
 
 		 192 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147926  normal  0.436073 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0201  transcription antitermination protein NusG  50.29 
 
 		 183 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538288  hitchhiker  0.00010102 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0041  NusG antitermination factor  49.43 
 
 		 190 aa  180  8.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273158  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1061  transcription antitermination protein NusG  49.14 
 
 		 177 aa  179  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0756818  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  48.3 
 
 		 194 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0158  transcription termination/antitermination factor NusG  49.14 
 
 		 183 aa  180  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000171251  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  48.3 
 
 		 194 aa  179  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  48.28 
 
 		 180 aa  180  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  48.57 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00230  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 182 aa  179  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  48.57 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0707  transcription antitermination protein NusG  52 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0037  NusG antitermination factor  49.14 
 
 		 190 aa  178  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000759472  hitchhiker  0.0000000000226007 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  48 
 
 		 177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2725  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 182 aa  178  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0259  NusG antitermination factor  51.15 
 
 		 177 aa  178  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2868  transcription antitermination protein NusG  48.85 
 
 		 175 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.157482  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4536  transcription antitermination protein nusG  48.57 
 
 		 197 aa  177  5.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2991  transcription antitermination protein nusG  46.86 
 
 		 184 aa  177  7e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1450  NusG antitermination factor  48.3 
 
 		 184 aa  177  7e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0444  NusG antitermination factor  48.86 
 
 		 183 aa  177  9e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4013  NusG antitermination factor  48 
 
 		 181 aa  176  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017638  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4470  transcription antitermination protein NusG  48 
 
 		 181 aa  176  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000671893  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4043  transcription antitermination protein NusG  48 
 
 		 181 aa  176  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000183625  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>