More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1403 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 308 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0915  protoheme IX farnesyltransferase  63.79 
 
 		 304 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010873  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3877  protoheme IX farnesyltransferase  66.56 
 
 		 302 aa  357  9.999999999999999e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  57.04 
 
 		 325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  56.99 
 
 		 316 aa  316  4e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  59.5 
 
 		 312 aa  312  4.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  54.88 
 
 		 316 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  55.41 
 
 		 316 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  54.77 
 
 		 318 aa  305  9.000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  55.1 
 
 		 315 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  54.1 
 
 		 315 aa  300  3e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  55 
 
 		 312 aa  299  4e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  54.88 
 
 		 310 aa  298  6e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  55.9 
 
 		 328 aa  296  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  55.9 
 
 		 328 aa  296  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  57.78 
 
 		 353 aa  295  7e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  57.78 
 
 		 312 aa  295  9e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  52.84 
 
 		 315 aa  294  1e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  55.86 
 
 		 313 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  52 
 
 		 309 aa  290  2e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  57.41 
 
 		 313 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  55.86 
 
 		 313 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2335  protoheme IX farnesyltransferase  55.12 
 
 		 313 aa  288  1e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  55.4 
 
 		 321 aa  285  7e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  52.4 
 
 		 305 aa  280  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  54.88 
 
 		 317 aa  279  4e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  55.32 
 
 		 315 aa  278  8e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  51.57 
 
 		 310 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  51.57 
 
 		 310 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  52.49 
 
 		 311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0901  protoheme IX farnesyltransferase  57.46 
 
 		 312 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110093  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1141  protoheme IX farnesyltransferase  55.83 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  47.31 
 
 		 295 aa  265  1e-69  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0615  protoheme IX farnesyltransferase  51.92 
 
 		 310 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  54.31 
 
 		 345 aa  262  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2232  protoheme IX farnesyltransferase  52.54 
 
 		 330 aa  260  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0835279  hitchhiker  0.00671366 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1239  protoheme IX farnesyltransferase  53.63 
 
 		 316 aa  256  3e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377478 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  49.83 
 
 		 316 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0262  protoheme IX farnesyltransferase  54.98 
 
 		 317 aa  253  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  46.9 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2347  protoheme IX farnesyltransferase  52.77 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3585  protoheme IX farnesyltransferase  50.17 
 
 		 317 aa  246  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3261  protoheme IX farnesyltransferase  50.17 
 
 		 317 aa  246  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3457  protoheme IX farnesyltransferase  52.99 
 
 		 317 aa  246  4e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  43.73 
 
 		 295 aa  240  2e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  44.74 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  42.96 
 
 		 299 aa  219  6e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  43.11 
 
 		 328 aa  216  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  43.84 
 
 		 301 aa  215  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  45.2 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  43.29 
 
 		 303 aa  209  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  42.61 
 
 		 323 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  42.61 
 
 		 323 aa  208  9e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1636  protoheme IX farnesyltransferase  42.72 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.156009  normal  0.433074 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  43.88 
 
 		 301 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  43.05 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  40.86 
 
 		 317 aa  204  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  43.43 
 
 		 305 aa  203  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  42.71 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  42.71 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1463  protoheme IX farnesyltransferase  44.09 
 
 		 298 aa  202  5e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  39.87 
 
 		 328 aa  202  5e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  43.94 
 
 		 302 aa  202  6e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  41.61 
 
 		 301 aa  202  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  43.9 
 
 		 289 aa  202  7e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0319  protoheme IX farnesyltransferase  43.96 
 
 		 297 aa  202  7e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  42.65 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0062  protoheme IX farnesyltransferase  41.11 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  41.53 
 
 		 300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  40.86 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  41.2 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  41.98 
 
 		 535 aa  200  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  41.2 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  42.07 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  41.2 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  42.07 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  41.2 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  42.07 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  42.07 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  41.2 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  41.2 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  41.2 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  45.24 
 
 		 309 aa  199  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  40.21 
 
 		 534 aa  199  7e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2710  protoheme IX farnesyltransferase  37.46 
 
 		 311 aa  199  7e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.242296  normal  0.192859 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  44.64 
 
 		 296 aa  198  9e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  41.55 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  41.38 
 
 		 300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  42.71 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  42.96 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  41.38 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0150  protoheme IX farnesyltransferase  45.24 
 
 		 299 aa  196  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  41 
 
 		 306 aa  196  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  42.37 
 
 		 304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  41.1 
 
 		 304 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  40.14 
 
 		 302 aa  195  9e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0247  protoheme IX farnesyltransferase  43.77 
 
 		 313 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  43.66 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  43.77 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0713  protoheme IX farnesyltransferase  43.49 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>