188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1395 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  100 
 
 		 431 aa  845    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  60.81 
 
 		 428 aa  496  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  59.21 
 
 		 429 aa  455  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  50.13 
 
 		 424 aa  356  3.9999999999999996e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  50.61 
 
 		 435 aa  354  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  45.37 
 
 		 436 aa  335  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  46.39 
 
 		 423 aa  335  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  49.37 
 
 		 421 aa  334  2e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  46.15 
 
 		 423 aa  332  6e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  46.5 
 
 		 423 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  47.85 
 
 		 389 aa  332  1e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  47.46 
 
 		 423 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  48.23 
 
 		 415 aa  331  2e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  47.46 
 
 		 423 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  47.46 
 
 		 423 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  47.46 
 
 		 423 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  47.46 
 
 		 423 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  48.86 
 
 		 415 aa  330  3e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  48.12 
 
 		 424 aa  329  6e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  48.23 
 
 		 415 aa  329  6e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  45.52 
 
 		 428 aa  328  8e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  47.21 
 
 		 420 aa  323  3e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  44.8 
 
 		 428 aa  319  5e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  44.58 
 
 		 428 aa  319  6e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  43.75 
 
 		 435 aa  318  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  47.98 
 
 		 421 aa  317  2e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  45.57 
 
 		 410 aa  317  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  46.94 
 
 		 431 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  46.87 
 
 		 437 aa  315  9e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  46.79 
 
 		 431 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  45.91 
 
 		 426 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  46.53 
 
 		 431 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  42.76 
 
 		 425 aa  311  1e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  45.66 
 
 		 426 aa  310  5e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  45.71 
 
 		 407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  46.53 
 
 		 427 aa  305  9.000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  41.88 
 
 		 440 aa  298  1e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  44.55 
 
 		 412 aa  296  5e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  44.72 
 
 		 436 aa  295  9e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  44.34 
 
 		 413 aa  295  1e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  45.16 
 
 		 435 aa  291  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  41 
 
 		 412 aa  271  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  43.34 
 
 		 403 aa  271  2e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  38.19 
 
 		 468 aa  242  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  36.27 
 
 		 471 aa  237  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  40 
 
 		 408 aa  237  3e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  36.85 
 
 		 458 aa  237  4e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1486  glucose/galactose transporter  39.38 
 
 		 439 aa  236  5.0000000000000005e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  39.95 
 
 		 405 aa  236  7e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  38.24 
 
 		 413 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  40.3 
 
 		 408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  35.61 
 
 		 417 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  35.75 
 
 		 417 aa  228  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  33.72 
 
 		 431 aa  223  4.9999999999999996e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  35.22 
 
 		 417 aa  215  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1551  L-fucose transporter  37.5 
 
 		 434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  33.49 
 
 		 432 aa  209  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02756  L-fucose:H+ symporter permease  35.84 
 
 		 411 aa  206  5e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  34.5 
 
 		 438 aa  203  5e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  34.5 
 
 		 438 aa  203  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  34.5 
 
 		 438 aa  203  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  34.5 
 
 		 438 aa  203  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  34.5 
 
 		 438 aa  203  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  34.58 
 
 		 438 aa  202  8e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0872  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 426 aa  202  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224242  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  34.34 
 
 		 433 aa  199  7.999999999999999e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  41.32 
 
 		 485 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  34.38 
 
 		 438 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  34.38 
 
 		 438 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  34.38 
 
 		 438 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  34.38 
 
 		 438 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  34.38 
 
 		 438 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  32.08 
 
 		 431 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  32.01 
 
 		 414 aa  195  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0960  fucose permease  34.22 
 
 		 421 aa  195  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  31.27 
 
 		 412 aa  195  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  31.19 
 
 		 417 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  30.56 
 
 		 420 aa  193  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1420  major facilitator transporter  34.65 
 
 		 467 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  31.19 
 
 		 413 aa  188  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  31.52 
 
 		 457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6289  L-fucose transporter  31.52 
 
 		 457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  33.09 
 
 		 409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0364  L-fucose permease  30.05 
 
 		 448 aa  182  7e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6905  L-fucose permease  31.76 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  31.53 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1052  L-fucose permease  29.62 
 
 		 444 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.682471  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1612  L-fucose transporter  29.8 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0487027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01616  putative fucose permease  33.15 
 
 		 381 aa  176  7e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000108257  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4488  L-fucose permease  29.73 
 
 		 443 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  33.17 
 
 		 437 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1614  fucose permease  28.67 
 
 		 448 aa  164  3e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139111  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  30.28 
 
 		 425 aa  162  8.000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.65 
 
 		 438 aa  159  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03600  L-fucose: permease  31.67 
 
 		 442 aa  157  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01060  conserved hypothetical protein  30.65 
 
 		 468 aa  157  3e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17660  fucose permease  30.32 
 
 		 425 aa  157  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.634966  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1066  L-fucose:H+ symporter permease  31.02 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0827702  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0406  L-fucose transporter  26.34 
 
 		 451 aa  155  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00228439  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  32.93 
 
 		 426 aa  153  5e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>