More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1353 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1054  integrase catalytic subunit  100 
 
 
316 aa  655  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161609  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2400  integrase catalytic subunit  100 
 
 
316 aa  655  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.61618  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1780  integrase catalytic subunit  100 
 
 
316 aa  655  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0228632  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1767  integrase catalytic subunit  99.68 
 
 
316 aa  654  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1353  integrase catalytic subunit  100 
 
 
316 aa  655  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.4232  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0224  integrase catalytic subunit  99.68 
 
 
316 aa  654  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0529  integrase, catalytic core  85.59 
 
 
259 aa  405  1e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  59.19 
 
 
321 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  58.81 
 
 
316 aa  377  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  58.49 
 
 
316 aa  376  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  58.81 
 
 
316 aa  377  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  58.81 
 
 
316 aa  377  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  58.68 
 
 
327 aa  376  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  58.68 
 
 
316 aa  375  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  57.99 
 
 
319 aa  374  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  57.99 
 
 
319 aa  374  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  58.81 
 
 
316 aa  377  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  58.81 
 
 
316 aa  377  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  58.81 
 
 
316 aa  377  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  57.99 
 
 
319 aa  374  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  57.99 
 
 
319 aa  374  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0176  transposase, putative  57.86 
 
 
320 aa  372  1e-102  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3372  integrase catalytic region  54.21 
 
 
321 aa  358  8e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  53.94 
 
 
330 aa  354  1e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  54.1 
 
 
330 aa  354  1e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  53.94 
 
 
330 aa  352  4e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  53.8 
 
 
330 aa  350  1e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  53.8 
 
 
330 aa  350  1e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  54.35 
 
 
463 aa  350  2e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  53.64 
 
 
348 aa  349  3e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  53.64 
 
 
355 aa  349  4e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  59.44 
 
 
329 aa  346  3e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  59.09 
 
 
329 aa  345  7e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1273  hypothetical protein  53.67 
 
 
314 aa  340  1e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0999856 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0952  hypothetical protein  52.12 
 
 
320 aa  337  1e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0554  hypothetical protein  53.75 
 
 
314 aa  336  3e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  2.79647e-10 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25530  Integrase, catalytic domain-containing protein  57.3 
 
 
265 aa  312  4e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1176  hypothetical protein  52.28 
 
 
284 aa  308  6e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.118975 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5447  Integrase catalytic region  56.68 
 
 
277 aa  299  4e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681137  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  59.75 
 
 
286 aa  286  3e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  59.75 
 
 
329 aa  286  3e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7134  Integrase catalytic core  60.09 
 
 
303 aa  253  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0122  integrase, catalytic region  59.7 
 
 
221 aa  239  6e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3474  hypothetical protein  59.9 
 
 
206 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.180544 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1128  integrase catalytic subunit  50.72 
 
 
280 aa  219  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1631  Integrase catalytic region  37.3 
 
 
329 aa  196  5e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1515  integrase catalytic region  60 
 
 
178 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60322  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2557  integrase, catalytic region  60 
 
 
188 aa  192  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.805017  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1251  integrase catalytic subunit  37.13 
 
 
333 aa  184  1e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1301  integrase catalytic subunit  37.13 
 
 
321 aa  184  2e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1280  integrase catalytic subunit  37.13 
 
 
463 aa  184  2e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.722165  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4152  transposase ISRme5 (copy d)  37.13 
 
 
321 aa  184  2e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29962  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  37.65 
 
 
325 aa  182  4e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  8.45152e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  37.46 
 
 
325 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2660  integrase catalytic subunit  36.71 
 
 
323 aa  180  3e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.271661 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1401  integrase catalytic subunit  35.96 
 
 
323 aa  178  9e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1424  integrase catalytic subunit  35.96 
 
 
323 aa  177  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3549  integrase catalytic region  45.81 
 
 
216 aa  174  1e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.032093 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2839  integrase, catalytic region  59.31 
 
 
153 aa  174  2e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2535  integrase catalytic subunit  35.33 
 
 
323 aa  173  3e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2179  transposase  33.95 
 
 
325 aa  166  7e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2194  putative transposase  33.64 
 
 
329 aa  164  1e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2493  transposase, putative  33.64 
 
 
325 aa  164  1e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0120  hypothetical protein  33.75 
 
 
497 aa  164  2e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2250  putative transposase  33.75 
 
 
333 aa  164  2e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2728  putative transposase  33.64 
 
 
441 aa  164  2e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33450  integrase, catalytic core  42.86 
 
 
185 aa  164  2e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0917  transposase  33.75 
 
 
327 aa  164  2e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1782  putative integrase  33.33 
 
 
325 aa  162  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1378  putative integrase  33.44 
 
 
325 aa  162  8e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0021  putative integrase  35.08 
 
 
332 aa  155  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0793  putative integrase  35.08 
 
 
343 aa  155  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.638394 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7791  Integrase catalytic region  32.8 
 
 
323 aa  153  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562755  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0142  integrase, catalytic region  66.36 
 
 
111 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3472  hypothetical protein  51.49 
 
 
170 aa  142  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.119399 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5037  Integrase catalytic region  35.48 
 
 
274 aa  131  1e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4022  Integrase catalytic region  30.6 
 
 
330 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500717  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2447  integrase catalytic subunit  34.47 
 
 
238 aa  116  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01280  transposase  35.53 
 
 
216 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0995831  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00518  transposase  35.53 
 
 
216 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2732  transcriptional regulator, putative  45.9 
 
 
289 aa  99  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2839  transcriptional regulator, putative  45.9 
 
 
289 aa  99  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1371  Fis family transcriptional regulator  38.24 
 
 
179 aa  98.6  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0199142  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2665  transcriptional regulator, putative  45.9 
 
 
289 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1603  transcriptional regulator, putative  44.26 
 
 
302 aa  97.4  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2626  transcriptional regulator, putative  42.86 
 
 
336 aa  94.7  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1327  transcriptional regulator, putative  46.9 
 
 
289 aa  93.6  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2906  transcriptional regulator, putative  27.31 
 
 
288 aa  93.2  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0733  transposase, putative  29.82 
 
 
229 aa  92.8  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1222  transcriptional regulator, putative  41.13 
 
 
293 aa  92  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2664  transcriptional regulator, putative  28.7 
 
 
284 aa  90.9  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3201  transcriptional regulator, putative  27.16 
 
 
288 aa  87.8  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3767  hypothetical protein  44.55 
 
 
128 aa  85.5  1e-15  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8690  putative integrase  34.53 
 
 
157 aa  84.7  2e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5566  integrase catalytic region  26.54 
 
 
316 aa  84  3e-15  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0200505  normal  0.0677233 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0801  integrase catalytic region  26.54 
 
 
316 aa  84  3e-15  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2928  transcriptional regulator, putative  43.64 
 
 
289 aa  83.6  4e-15  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1424  transcriptional regulator, putative  27.71 
 
 
288 aa  83.6  4e-15  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1420  transcriptional regulator, putative  43.64 
 
 
289 aa  83.6  4e-15  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1426  transcriptional regulator, putative  43.64 
 
 
289 aa  83.2  5e-15  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>