More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1337 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 289 aa  595  1e-169  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  66.21 
 
 		 290 aa  399  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  56.84 
 
 		 327 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  46.13 
 
 		 285 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  45.42 
 
 		 300 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  44.37 
 
 		 289 aa  245  6e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  45.77 
 
 		 359 aa  236  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 		 305 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  30.21 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 297 aa  126  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1153  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 307 aa  122  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3775  alpha/beta hydrolase fold protein  31.05 
 
 		 309 aa  122  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1135  putative hydrolase protein  29.93 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  30.49 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1173  alpha/beta hydrolase fold  30.46 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.95564  decreased coverage  0.000000135804 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  29.9 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  29.9 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  29.9 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  29.9 
 
 		 340 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  32.55 
 
 		 295 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  29.9 
 
 		 296 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  29.57 
 
 		 349 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  29.7 
 
 		 296 aa  119  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 311 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  30.14 
 
 		 311 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 		 289 aa  115  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  30.13 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 		 325 aa  112  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  28.28 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2554  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 		 294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000366635  normal  0.152292 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  29.93 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1074  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1579  putative hydrolase  29.05 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144323  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  29.05 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  29.05 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  29.9 
 
 		 300 aa  106  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 		 289 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1433  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1062  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00192187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1767  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963183 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1589  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 		 343 aa  98.2  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  32.22 
 
 		 256 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  26.39 
 
 		 282 aa  96.3  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  26.39 
 
 		 282 aa  95.5  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2055  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 		 322 aa  91.3  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011604 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 		 256 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  31.06 
 
 		 256 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 		 504 aa  89.7  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 		 288 aa  89.7  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 285 aa  89.7  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  24.67 
 
 		 300 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  29.96 
 
 		 284 aa  88.6  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 267 aa  89  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 		 333 aa  88.2  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.52 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 		 284 aa  87.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  32.62 
 
 		 279 aa  87.8  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  28.03 
 
 		 256 aa  87.4  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  31.98 
 
 		 288 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  31.98 
 
 		 288 aa  86.7  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3283  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 303 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3221  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 303 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3232  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 303 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 288 aa  86.3  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 294 aa  86.3  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  28 
 
 		 293 aa  85.9  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 303 aa  85.5  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03843  hydrolase  30.9 
 
 		 244 aa  85.5  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  40.68 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  29.35 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5753  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766272  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  29.92 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  24.76 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  31.23 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  24.76 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5377  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  22.73 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5466  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0306241 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  25.08 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.82 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  26.52 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  26.71 
 
 		 2762 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  25.76 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  24.48 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  26.15 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  24.34 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>