More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1288 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
157 aa  323  7e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  73.72 
 
 
158 aa  245  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  73.51 
 
 
155 aa  236  5.999999999999999e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  69.43 
 
 
161 aa  224  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  66.88 
 
 
166 aa  219  9e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  66.88 
 
 
164 aa  217  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  67.52 
 
 
166 aa  215  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  67.52 
 
 
166 aa  215  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  66.24 
 
 
166 aa  211  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  64.97 
 
 
166 aa  210  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  66.24 
 
 
166 aa  210  7e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  62.42 
 
 
166 aa  206  7e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  58.06 
 
 
158 aa  192  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  58.71 
 
 
160 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  58.06 
 
 
160 aa  189  9e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  58.06 
 
 
176 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  58.06 
 
 
159 aa  189  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  56.77 
 
 
159 aa  189  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  56.77 
 
 
170 aa  188  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2442  AsnC family transcriptional regulator  60.67 
 
 
168 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.127715  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3204  transcriptional regulator, AsnC family  58.94 
 
 
170 aa  176  8e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10165  normal  0.976378 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2752  AsnC family transcriptional regulator  54.61 
 
 
180 aa  174  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  56.29 
 
 
156 aa  174  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  58.04 
 
 
156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  58.04 
 
 
156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  58.04 
 
 
156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3138  transcriptional regulator AsnC family  52.26 
 
 
155 aa  165  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2113  AsnC family transcriptional regulator  53.15 
 
 
157 aa  161  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.264729  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2720  transcriptional regulator, AsnC family  50.32 
 
 
155 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.380031  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  54.3 
 
 
156 aa  159  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  52.32 
 
 
175 aa  159  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3795  AsnC family transcriptional regulator  52.94 
 
 
156 aa  155  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  49.01 
 
 
152 aa  149  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 
152 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 
154 aa  145  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 
177 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 
152 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 
152 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 
152 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  49.01 
 
 
152 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  49.01 
 
 
152 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  49.01 
 
 
152 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  49.01 
 
 
152 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  48.67 
 
 
155 aa  142  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  49.67 
 
 
155 aa  140  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 
157 aa  140  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  50.99 
 
 
155 aa  140  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  44.67 
 
 
154 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 
155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 
155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 
155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  48.34 
 
 
154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  43.23 
 
 
181 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 
153 aa  137  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5122  transcriptional regulator, AsnC family  46.41 
 
 
158 aa  136  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  41.18 
 
 
175 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 
167 aa  135  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  41.18 
 
 
175 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  41.18 
 
 
175 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  41.18 
 
 
175 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  41.18 
 
 
229 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 
175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 
159 aa  134  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 
213 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  41.72 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  39.87 
 
 
229 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  44.76 
 
 
154 aa  131  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4924  putative AsnC/lsr family transcriptional regulator  40.76 
 
 
157 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.0801597 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 
169 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  41.72 
 
 
155 aa  131  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 
158 aa  130  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
157 aa  131  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
155 aa  130  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  38.82 
 
 
175 aa  130  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3070  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 
158 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
174 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
157 aa  130  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  41.88 
 
 
162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  40.76 
 
 
157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 
175 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0773  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
154 aa  128  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 
153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  41.88 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  41.88 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0723  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3359  transcriptional regulator, AsnC family  43.42 
 
 
168 aa  128  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
168 aa  128  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3989  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 
151 aa  128  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>