273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1161 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1161  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  100 
 
 		 281 aa  573  1.0000000000000001e-163  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00427132  normal  0.195503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0829  taurine dioxygenase  44 
 
 		 289 aa  249  5e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.464747 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5979  Taurine dioxygenase  44.89 
 
 		 290 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  39.86 
 
 		 291 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  34.18 
 
 		 278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  36.07 
 
 		 295 aa  162  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6587  taurine dioxygenase  37.68 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2504  taurine dioxygenase  36.21 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  37.17 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1245  taurine dioxygenase  37.68 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0188  taurine dioxygenase  36.96 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  35.09 
 
 		 276 aa  159  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  36.59 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6251  taurine dioxygenase  36.59 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6536  taurine dioxygenase  36.59 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5058  taurine dioxygenase  35.48 
 
 		 299 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0190  taurine dioxygenase  35.48 
 
 		 299 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6191  taurine dioxygenase  36.96 
 
 		 308 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  34.2 
 
 		 273 aa  155  6e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0169  TauD/TfdA family dioxygenase  35.13 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  36.63 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  36.1 
 
 		 305 aa  152  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  35.48 
 
 		 277 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  33.57 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.05 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  33.57 
 
 		 298 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4704  taurine dioxygenase  33.81 
 
 		 282 aa  149  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  38.01 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3604  taurine dioxygenase  34.64 
 
 		 304 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  34.77 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  35.56 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4401  TauD/TfdA family dioxygenase  34.15 
 
 		 296 aa  143  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.0785293 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0746  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase oxidoreductase protein  35.16 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34750  putative taurine catabolism dioxygenase  36.3 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109909  normal  0.0729012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4308  Taurine dioxygenase  35.9 
 
 		 303 aa  142  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677541  hitchhiker  0.00107302 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  32.48 
 
 		 285 aa  141  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  33.7 
 
 		 287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0824  Taurine dioxygenase  34.19 
 
 		 307 aa  139  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  33.21 
 
 		 264 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  30.8 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5293  taurine dioxygenase  33.21 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298962  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  32.85 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3809  taurine dioxygenase  33.7 
 
 		 267 aa  135  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  33.83 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  31.27 
 
 		 270 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2528  taurine dioxygenase  34.98 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2536  taurine dioxygenase  34.98 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189114  normal  0.626822 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2491  taurine dioxygenase  34.98 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0762  Taurine dioxygenase  33.7 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  31.54 
 
 		 277 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2175  taurine dioxygenase  33.22 
 
 		 306 aa  132  9e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129597 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  34.44 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  31.14 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  31.18 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  31.14 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  34.57 
 
 		 335 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  30.82 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  31.14 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3107  taurine dioxygenase  33.94 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  34.69 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2152  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  33.1 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  31.14 
 
 		 283 aa  130  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  31.14 
 
 		 283 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  31.14 
 
 		 283 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  31.14 
 
 		 283 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  31.52 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  31.14 
 
 		 283 aa  130  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  33.83 
 
 		 306 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  31.93 
 
 		 315 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  34.15 
 
 		 315 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13441  dioxygenase  34.19 
 
 		 295 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.379206 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  30.22 
 
 		 280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3036  taurine dioxygenase  32.35 
 
 		 306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.163614  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  34.86 
 
 		 315 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  34.07 
 
 		 277 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  35.23 
 
 		 322 aa  128  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0696  Taurine dioxygenase  33.33 
 
 		 300 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1546  taurine dioxygenase  32.14 
 
 		 316 aa  129  8.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3893  Taurine dioxygenase  33.69 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  31.54 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4934  Taurine dioxygenase  32.63 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  31.69 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0112  taurine dioxygenase  32.75 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3507  taurine dioxygenase  34.28 
 
 		 315 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220581 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1139  TauD/TfdA family dioxygenase  35.76 
 
 		 297 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0690  TauD/TfdA family dioxygenase  35.76 
 
 		 297 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0776  TauD/TfdA family dioxygenase  35.76 
 
 		 297 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1740  TauD/TfdA family dioxygenase  35.76 
 
 		 297 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2415  TauD/TfdA family dioxygenase  35.76 
 
 		 297 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4017  taurine dioxygenase  34.28 
 
 		 315 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1214  TauD/TfdA family dioxygenase  35.76 
 
 		 297 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.631548  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3967  Taurine dioxygenase  33.45 
 
 		 301 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.575031 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08160  Taurine dioxygenase  31.52 
 
 		 298 aa  125  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243844  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1665  taurine dioxygenase  30.58 
 
 		 303 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3666  Taurine dioxygenase  32 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02435  hypothetical protein  30.94 
 
 		 299 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2676  taurine dioxygenase  32.85 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2819  taurine dioxygenase  32.74 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.373247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0273  hypothetical protein  30.94 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18160  Probable taurine catabolism dioxygenase  33.57 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>