More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1129 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 493 aa  969    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  56.06 
 
 		 539 aa  489  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  51.69 
 
 		 526 aa  458  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  36.36 
 
 		 460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  36.42 
 
 		 460 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  36.34 
 
 		 460 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  37.23 
 
 		 482 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  37.23 
 
 		 482 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  37.23 
 
 		 482 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  37.23 
 
 		 482 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  37.23 
 
 		 482 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  36.99 
 
 		 492 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  37.23 
 
 		 482 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  37.93 
 
 		 491 aa  265  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  38.04 
 
 		 484 aa  265  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0419  type II and III secretion system protein  36.93 
 
 		 491 aa  261  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  36.7 
 
 		 473 aa  256  7e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  38.13 
 
 		 482 aa  252  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  37.62 
 
 		 493 aa  249  9e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4200  type II and III secretion system protein  35.13 
 
 		 480 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  34.91 
 
 		 486 aa  248  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  35.7 
 
 		 479 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2042  type II and III secretion system protein  37.39 
 
 		 474 aa  247  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160512  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  36.59 
 
 		 480 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0301  type II and III secretion system protein  34.32 
 
 		 493 aa  239  5.999999999999999e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0306  type II and III secretion system protein  35.52 
 
 		 463 aa  239  8e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  35.08 
 
 		 499 aa  239  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5683  putative pilus assembly protein cpaC  36.24 
 
 		 489 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0895  type II and III secretion system protein  36.52 
 
 		 475 aa  239  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276547  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7031  putative pilus assembly protein cpaC  36.16 
 
 		 497 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157408  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  34.73 
 
 		 517 aa  234  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0667  type II and III secretion system protein  35.71 
 
 		 478 aa  234  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  33.19 
 
 		 482 aa  233  4.0000000000000004e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  34.38 
 
 		 497 aa  233  7.000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2384  type II and III secretion system protein  36.24 
 
 		 501 aa  232  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0712341  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2480  type II and III secretion system protein  33.84 
 
 		 502 aa  232  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3791  type II and III secretion system protein  36.34 
 
 		 546 aa  231  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.78564 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2408  type II and III secretion system protein  34.05 
 
 		 502 aa  230  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3713  type II and III secretion system protein  36.4 
 
 		 492 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2827  type II and III secretion system protein  34.9 
 
 		 494 aa  226  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.59291  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0481  type II and III secretion system protein  34.16 
 
 		 491 aa  224  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  32.24 
 
 		 483 aa  221  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  34.43 
 
 		 652 aa  221  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  34.29 
 
 		 620 aa  219  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 		 478 aa  218  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3997  type II and III secretion system protein  34.57 
 
 		 516 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  33.5 
 
 		 464 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5498  type II and III secretion system protein  34.35 
 
 		 642 aa  216  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0729153  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6784  type II and III secretion system protein  34.35 
 
 		 642 aa  216  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0225639  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6372  type II and III secretion system protein  34.35 
 
 		 646 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118292  normal  0.881452 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  32.33 
 
 		 466 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  33.73 
 
 		 461 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  33.13 
 
 		 477 aa  213  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  32.71 
 
 		 461 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  33.49 
 
 		 461 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3352  type II and III secretion system protein  33.47 
 
 		 524 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.78669 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  33.79 
 
 		 656 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0217  component of type IV pilus  32.53 
 
 		 525 aa  209  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  31.79 
 
 		 490 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2644  type II and III secretion system protein:transport-associated  34.19 
 
 		 633 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  34.62 
 
 		 466 aa  206  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0591  type II and III secretion system protein  32.65 
 
 		 663 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341845  normal  0.0532026 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0723  type II and III secretion system protein  35.18 
 
 		 507 aa  204  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0315649  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  33.18 
 
 		 657 aa  203  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4851  bacterial type II/III secretion system protein  40.49 
 
 		 419 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4476  type II and III secretion system protein  31.42 
 
 		 499 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.988373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  34.04 
 
 		 474 aa  201  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002644  type II/IV secretion system secretin RcpA/CpaC associated with Flp pilus assembly  33.09 
 
 		 487 aa  200  5e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4188  type II and III secretion system protein  31.16 
 
 		 499 aa  200  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  40.27 
 
 		 457 aa  200  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1403  type II and III secretion system protein  33.55 
 
 		 444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1732  type II and III secretion system protein  34.33 
 
 		 443 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793195  hitchhiker  0.00000430206 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  33.33 
 
 		 496 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2827  type II and III secretion system protein  32.01 
 
 		 487 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.863407  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4391  type II and III secretion system protein  36.44 
 
 		 416 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0070  type II and III secretion system protein  34.44 
 
 		 461 aa  197  5.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5549  type II and III secretion system protein  32.97 
 
 		 512 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090409 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1443  type II and III secretion system protein  33.89 
 
 		 461 aa  196  9e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549017 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4661  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  33.75 
 
 		 443 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000794738  hitchhiker  0.00340482 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  34.55 
 
 		 441 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1789  type II/III secretion system protein  34.55 
 
 		 432 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1290  type II/III secretion system protein  34.55 
 
 		 432 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  34.55 
 
 		 441 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  34.55 
 
 		 441 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  34.55 
 
 		 441 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0848  type II and III secretion system protein  33.4 
 
 		 419 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  34.55 
 
 		 432 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2915  type II and III secretion system protein  33.11 
 
 		 484 aa  193  5e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1497  type II and III secretion system protein  33.68 
 
 		 443 aa  193  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0318341  hitchhiker  0.0000037114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1041  type II and III secretion system protein  33.68 
 
 		 443 aa  193  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00604679  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1521  type II and III secretion system protein  33.68 
 
 		 443 aa  193  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00384422  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  33.48 
 
 		 530 aa  193  7e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1312  phospholipid-binding domain-containing protein  33.96 
 
 		 690 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  32.87 
 
 		 679 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  32.45 
 
 		 468 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2960  type II/III secretion system protein  33.96 
 
 		 690 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3085  type II/III secretion system protein  33.64 
 
 		 690 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  33.91 
 
 		 441 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4193  type II and III secretion system protein  50.25 
 
 		 545 aa  191  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  30.9 
 
 		 514 aa  191  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>