More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1082 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2735  excinuclease ABC subunit C  55.45 
 
 
623 aa  714    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.0935486 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4277  excinuclease ABC subunit C  53.42 
 
 
634 aa  672    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.471865 
 
 
-
 
NC_004310  BR0699  excinuclease ABC subunit C  54.46 
 
 
690 aa  685    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1728  excinuclease ABC subunit C  53.04 
 
 
688 aa  652    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0415792 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2652  excinuclease ABC, C subunit  56.27 
 
 
668 aa  689    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1434  excinuclease ABC, C subunit  50.85 
 
 
679 aa  644    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3713  excinuclease ABC, C subunit  55.83 
 
 
668 aa  689    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1232  excinuclease ABC subunit C  54.74 
 
 
680 aa  678    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101228 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2526  excinuclease ABC subunit C  53.25 
 
 
666 aa  650    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2276  excinuclease ABC, C subunit  55.68 
 
 
644 aa  712    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1074  excinuclease ABC subunit C  55.28 
 
 
623 aa  713    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.969621  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1712  excinuclease ABC, C subunit  52.06 
 
 
692 aa  657    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2859  excinuclease ABC subunit C  56.13 
 
 
623 aa  721    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41177  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2220  excinuclease ABC subunit C  57.58 
 
 
639 aa  742    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0021269  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1558  excinuclease ABC subunit C  53.6 
 
 
690 aa  674    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1177  excinuclease ABC subunit C  52.07 
 
 
695 aa  670    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.8668  normal  0.100977 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1060  excinuclease ABC subunit C  68.67 
 
 
658 aa  909    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41739  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3919  excinuclease ABC subunit C  55.59 
 
 
631 aa  709    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5405  excinuclease ABC, C subunit  53.93 
 
 
688 aa  687    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0901  excinuclease ABC subunit C  51.62 
 
 
699 aa  654    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.686054  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1281  excinuclease ABC subunit C  51.86 
 
 
695 aa  662    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.280524  normal  0.136737 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3104  excinuclease ABC, C subunit  54.49 
 
 
682 aa  701    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.299342  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3146  excinuclease ABC subunit C  52.43 
 
 
690 aa  655    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.055346  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2520  excinuclease ABC subunit C  54.93 
 
 
635 aa  714    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1082  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
644 aa  1308    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3001  excinuclease ABC, C subunit  54.08 
 
 
700 aa  697    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0420  excinuclease ABC subunit C  55.94 
 
 
620 aa  702    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000882939  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1362  excinuclease ABC subunit C  52.17 
 
 
704 aa  652    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1975  excinuclease ABC subunit C  56.5 
 
 
653 aa  721    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0046  excinuclease ABC subunit C  53.5 
 
 
629 aa  667    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.714841  hitchhiker  0.00962006 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2589  excinuclease ABC subunit C  53.92 
 
 
691 aa  693    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0718587  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1086  excinuclease ABC subunit C  54.09 
 
 
680 aa  681    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000501867 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2878  excinuclease ABC, C subunit  54.49 
 
 
682 aa  702    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0772  excinuclease ABC subunit C  53.03 
 
 
633 aa  661    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00962744  normal  0.347624 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4491  excinuclease ABC subunit C  73.16 
 
 
642 aa  960    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.191027 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0782  excinuclease ABC subunit C  54.74 
 
 
674 aa  685    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191761  normal  0.0714693 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0516  excinuclease ABC subunit C  48.55 
 
 
658 aa  667    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2312  excinuclease ABC subunit C  56.3 
 
 
623 aa  689    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.136814 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0644  excinuclease ABC subunit C  56.46 
 
 
631 aa  721    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0690  excinuclease ABC subunit C  54.62 
 
 
690 aa  686    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.485523  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  46.31 
 
 
613 aa  530  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  46.12 
 
 
611 aa  531  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  46.61 
 
 
609 aa  520  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2344  excinuclease ABC, C subunit  54.68 
 
 
779 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.77277  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  45.9 
 
 
617 aa  515  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  46.55 
 
 
607 aa  510  1e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  45.55 
 
 
608 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  44.95 
 
 
607 aa  502  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  45.21 
 
 
608 aa  502  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  45.13 
 
 
607 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  45.13 
 
 
607 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3066  excinuclease ABC subunit C  45 
 
 
607 aa  495  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  41.78 
 
 
613 aa  496  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25040  excinuclease ABC subunit C  45.23 
 
 
607 aa  495  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  44.8 
 
 
607 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  45.06 
 
 
607 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0853  excinuclease ABC, C subunit  44.94 
 
 
608 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0154  excinuclease ABC subunit C  40.99 
 
 
605 aa  489  1e-137  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.168899  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0979  excinuclease ABC, C subunit  44.94 
 
 
623 aa  492  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0363417 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2896  excinuclease ABC subunit C  44.46 
 
 
607 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189646  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  41.82 
 
 
599 aa  488  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3671  excinuclease ABC subunit C  44.58 
 
 
585 aa  482  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159711  hitchhiker  0.0000000375345 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1403  excinuclease ABC subunit C  45.55 
 
 
614 aa  473  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.252536  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  40.69 
 
 
612 aa  474  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  42.2 
 
 
626 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  43.02 
 
 
599 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1071  excinuclease ABC subunit C  43.11 
 
 
654 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000538512  normal  0.216036 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1410  excinuclease ABC subunit C  42.76 
 
 
621 aa  463  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3241  excinuclease ABC, C subunit  41.91 
 
 
607 aa  465  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0161382  hitchhiker  0.00210477 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1316  excinuclease ABC subunit C  42.76 
 
 
627 aa  462  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.235211  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00582  excinuclease ABC subunit C  44.2 
 
 
618 aa  463  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  42.81 
 
 
619 aa  462  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1001  excinuclease ABC subunit C  41.56 
 
 
657 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73532  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2570  excinuclease ABC subunit C  41.69 
 
 
618 aa  460  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1803  excinuclease ABC, C subunit  43.41 
 
 
657 aa  461  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0340936  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2698  excinuclease ABC subunit C  41.05 
 
 
618 aa  458  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  42.03 
 
 
603 aa  456  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0936  excinuclease ABC subunit C  41.21 
 
 
657 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.581594  normal  0.110547 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1954  excinuclease ABC subunit C  40.5 
 
 
609 aa  456  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00983646  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1271  excinuclease ABC subunit C  43.65 
 
 
606 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2410  excinuclease ABC subunit C  41.19 
 
 
673 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.308713  hitchhiker  0.000953685 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  40.56 
 
 
610 aa  449  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2161  excinuclease ABC subunit C  40.39 
 
 
674 aa  451  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.263968 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  40.56 
 
 
610 aa  450  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  40.56 
 
 
610 aa  451  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0701  excinuclease ABC subunit C  42.95 
 
 
598 aa  450  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  40.56 
 
 
610 aa  450  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  40.56 
 
 
610 aa  449  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  40.56 
 
 
610 aa  449  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  40.56 
 
 
610 aa  450  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2109  excinuclease ABC subunit C  41.01 
 
 
610 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0217985  hitchhiker  0.00000000000000291711 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1297  excinuclease ABC subunit C  41.01 
 
 
610 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000512015  hitchhiker  0.00000387597 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4255  excinuclease ABC subunit C  39.61 
 
 
677 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27889  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1174  excinuclease ABC subunit C  41.01 
 
 
610 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000294093  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2676  excinuclease ABC subunit C  40.13 
 
 
609 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00512611  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2161  excinuclease ABC subunit C  40.85 
 
 
610 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138205  hitchhiker  0.0000000035589 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2102  excinuclease ABC subunit C  40.85 
 
 
610 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000495467  normal  0.0150424 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1783  excinuclease ABC subunit C  40.12 
 
 
653 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2454  excinuclease ABC subunit C  40.33 
 
 
609 aa  443  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.263996  normal  0.543932 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1783  excinuclease ABC subunit C  39.97 
 
 
610 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0533171  hitchhiker  0.000000162173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>