More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1068 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1285  adenylosuccinate lyase  74.32 
 
 
435 aa  646  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348183  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7577  adenylosuccinate lyase  79.18 
 
 
435 aa  669  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2682  adenylosuccinate lyase  76.61 
 
 
435 aa  665  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6842  adenylosuccinate lyase  78.03 
 
 
435 aa  667  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  77.29 
 
 
435 aa  691  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  73 
 
 
434 aa  657  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  79.04 
 
 
435 aa  705  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2417  adenylosuccinate lyase  72.25 
 
 
433 aa  635  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12659  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  73.91 
 
 
438 aa  642  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  75.11 
 
 
435 aa  677  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0716  adenylosuccinate lyase  72.11 
 
 
437 aa  639  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  79 
 
 
435 aa  705  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3693  adenylosuccinate lyase  72.02 
 
 
458 aa  646  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  76.26 
 
 
435 aa  677  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1095  adenylosuccinate lyase  73.85 
 
 
435 aa  652  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1068  adenylosuccinate lyase  100 
 
 
438 aa  893  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0025797  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2569  adenylosuccinate lyase  74.31 
 
 
435 aa  662  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1769  adenylosuccinate lyase  70.64 
 
 
435 aa  640  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.468404  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  78.54 
 
 
435 aa  702  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1610  adenylosuccinate lyase  71.79 
 
 
435 aa  652  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.18937  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4343  adenylosuccinate lyase  73.17 
 
 
435 aa  654  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.119583  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1309  adenylosuccinate lyase  84.02 
 
 
438 aa  749  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.244408  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  75.57 
 
 
435 aa  671  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3849  adenylosuccinate lyase  74.66 
 
 
435 aa  648  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  72.48 
 
 
433 aa  642  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  76.38 
 
 
445 aa  687  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5353  adenylosuccinate lyase  75 
 
 
435 aa  651  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0156814 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4474  adenylosuccinate lyase  81.88 
 
 
432 aa  734  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457482  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  75.74 
 
 
435 aa  672  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0841  adenylosuccinate lyase  73.17 
 
 
433 aa  628  1e-179  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0849  adenylosuccinate lyase  73.17 
 
 
433 aa  628  1e-179  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  72.37 
 
 
434 aa  628  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3439  adenylosuccinate lyase  69.57 
 
 
436 aa  626  1e-178  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  72.15 
 
 
434 aa  621  1e-177  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1842  adenylosuccinate lyase  71.75 
 
 
450 aa  623  1e-177  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.333164 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  72.15 
 
 
434 aa  621  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1011  adenylosuccinate lyase  70.02 
 
 
434 aa  620  1e-176  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1036  adenylosuccinate lyase  69.57 
 
 
433 aa  617  1e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2663  adenylosuccinate lyase  70.48 
 
 
434 aa  599  1e-170  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.139235 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1145  adenylosuccinate lyase  66.51 
 
 
431 aa  590  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2695  adenylosuccinate lyase  65.45 
 
 
431 aa  577  1e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0303486  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3019  adenylosuccinate lyase  66.44 
 
 
445 aa  577  1e-163  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.472154  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0179  adenylosuccinate lyase  65.39 
 
 
451 aa  575  1e-163  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0644035  normal  0.14096 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  61.78 
 
 
431 aa  553  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  62.01 
 
 
431 aa  549  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  61.1 
 
 
431 aa  545  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  61.1 
 
 
431 aa  542  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  60.87 
 
 
431 aa  536  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0852  adenylosuccinate lyase  56.32 
 
 
432 aa  532  1e-150  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.20433  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0238  adenylosuccinate lyase  55.4 
 
 
433 aa  529  1e-149  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.247681  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0786  adenylosuccinate lyase  56.65 
 
 
430 aa  529  1e-149  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0346499  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1237  adenylosuccinate lyase  59.64 
 
 
439 aa  508  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1169  adenylosuccinate lyase  59.64 
 
 
439 aa  505  1e-142  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1109  adenylosuccinate lyase  59.28 
 
 
439 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0660  adenylosuccinate lyase  58.49 
 
 
437 aa  499  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0610462  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1148  adenylosuccinate lyase  58.28 
 
 
439 aa  493  1e-138  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.64996  normal  0.297095 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0059  adenylosuccinate lyase  54.34 
 
 
432 aa  489  1e-137  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.169461  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  54.82 
 
 
431 aa  481  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  52.29 
 
 
430 aa  478  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  52.07 
 
 
431 aa  472  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2356  adenylosuccinate lyase  56.32 
 
 
435 aa  471  1e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1990  adenylosuccinate lyase  56.32 
 
 
435 aa  471  1e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246521  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1894  adenylosuccinate lyase  51.57 
 
 
443 aa  467  1e-130  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1819  adenylosuccinate lyase  52.36 
 
 
442 aa  466  1e-130  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0050  adenylosuccinate lyase  53.36 
 
 
442 aa  464  1e-129  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  52.29 
 
 
430 aa  463  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  51.84 
 
 
431 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0025  adenylosuccinate lyase  53.14 
 
 
442 aa  462  1e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  53 
 
 
431 aa  462  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  54.04 
 
 
431 aa  462  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0023  adenylosuccinate lyase  52.91 
 
 
442 aa  460  1e-128  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  48.62 
 
 
430 aa  453  1e-126  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1468  adenylosuccinate lyase  51.61 
 
 
432 aa  451  1e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0095  adenylosuccinate lyase  51.95 
 
 
436 aa  452  1e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0024  adenylosuccinate lyase  52.13 
 
 
442 aa  448  1e-125  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.938099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  49.08 
 
 
435 aa  451  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2095  adenylosuccinate lyase  50.11 
 
 
443 aa  450  1e-125  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1740  adenylosuccinate lyase  51.24 
 
 
442 aa  450  1e-125  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.483488  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  48.62 
 
 
435 aa  445  1e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1121  adenylosuccinate lyase  50.45 
 
 
447 aa  446  1e-124  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  48.62 
 
 
435 aa  446  1e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  48.62 
 
 
435 aa  447  1e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  48.62 
 
 
435 aa  446  1e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  48.62 
 
 
435 aa  446  1e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  48.62 
 
 
435 aa  446  1e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  48.62 
 
 
435 aa  447  1e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  48.62 
 
 
435 aa  446  1e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  48.62 
 
 
435 aa  446  1e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  53.21 
 
 
432 aa  442  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  47.71 
 
 
433 aa  444  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0055  adenylosuccinate lyase  52.69 
 
 
442 aa  443  1e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  49.43 
 
 
438 aa  444  1e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1648  adenylosuccinate lyase  49.42 
 
 
431 aa  443  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1721  adenylosuccinate lyase  49.19 
 
 
431 aa  440  1e-122  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1963  adenylosuccinate lyase  51.72 
 
 
433 aa  441  1e-122  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.700985  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1108  adenylosuccinate lyase  51.95 
 
 
434 aa  437  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.34197  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  50.69 
 
 
431 aa  438  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1139  adenylosuccinate lyase  52.57 
 
 
425 aa  435  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.863394  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3011  adenylosuccinate lyase  50.57 
 
 
431 aa  436  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  47.81 
 
 
431 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>