More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1061 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1061  FolC bifunctional protein  100 
 
 
443 aa  876    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1299  FolC bifunctional protein  60.95 
 
 
435 aa  504  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2729  FolC bifunctional protein  61.25 
 
 
453 aa  476  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  45.87 
 
 
423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1963  FolC bifunctional protein  48.36 
 
 
432 aa  325  1e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  45.33 
 
 
421 aa  324  2e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0060  FolC bifunctional protein  46.12 
 
 
442 aa  323  4e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0052  folylpolyglutamate synthetase  45.23 
 
 
442 aa  319  5e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0632  FolC bifunctional protein  45.79 
 
 
448 aa  318  9e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  48.11 
 
 
437 aa  318  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0200  FolC bifunctional protein  45.66 
 
 
448 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  44.97 
 
 
442 aa  312  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0094  putative folC protein  43.08 
 
 
447 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3431  folylpolyglutamate synthetase  46.29 
 
 
435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0930  folylpolyglutamate synthetase  46.33 
 
 
424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2985  FolC bifunctional protein  46.84 
 
 
412 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1697  FolC bifunctional protein  48.31 
 
 
447 aa  302  6.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000041019 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2589  FolC bifunctional protein  45.98 
 
 
424 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.500866  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0844  FolC bifunctional protein  46.77 
 
 
437 aa  301  2e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0389  FolC bifunctional protein  47.06 
 
 
447 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251585  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1623  FolC bifunctional protein  44.49 
 
 
441 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0140  FolC bifunctional protein  43.08 
 
 
444 aa  294  3e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1988  FolC bifunctional protein  43.82 
 
 
422 aa  291  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362806  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1986  FolC bifunctional protein  44.27 
 
 
438 aa  290  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0400217 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1404  FolC bifunctional protein  41.44 
 
 
438 aa  289  7e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0662  FolC bifunctional protein  41.15 
 
 
440 aa  288  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0116745  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0475  FolC bifunctional protein  43.02 
 
 
441 aa  285  8e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617675  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0132  folylpolyglutamate synthase  45.52 
 
 
422 aa  282  9e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4958  FolC bifunctional protein  41.89 
 
 
441 aa  274  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.154774 
 
 
-
 
NC_004310  BR2106  FolC bifunctional protein  39.01 
 
 
442 aa  272  7e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0277055  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4444  FolC bifunctional protein  41.44 
 
 
441 aa  271  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.545059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4908  FolC bifunctional protein  41.22 
 
 
441 aa  271  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.094704  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2022  FolC bifunctional protein  38.79 
 
 
442 aa  271  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000765521  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0814  FolC bifunctional protein  40.09 
 
 
430 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3957  FolC bifunctional protein  39.69 
 
 
442 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.755042  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3380  FolC bifunctional protein  43.12 
 
 
441 aa  266  7e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4284  FolC bifunctional protein  39.47 
 
 
442 aa  259  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.045669  normal  0.825965 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3240  FolC bifunctional protein  39.29 
 
 
447 aa  258  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0024  folylpolyglutamate synthase  38.98 
 
 
470 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1052  folylpolyglutamate synthase  34.92 
 
 
429 aa  249  5e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.275241  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1352  folylpolyglutamate synthase  37.44 
 
 
440 aa  246  6e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0702  folylpolyglutamate synthase  35.1 
 
 
435 aa  239  5.999999999999999e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  33.97 
 
 
434 aa  238  1e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5701  FolC bifunctional protein  37.36 
 
 
467 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.504133  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0715  folylpolyglutamate synthase  33.96 
 
 
442 aa  226  9e-58  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  35.8 
 
 
426 aa  218  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0088  FolC bifunctional protein  37.68 
 
 
397 aa  209  6e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  36.79 
 
 
427 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  34.02 
 
 
412 aa  192  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.03 
 
 
466 aa  191  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  33.1 
 
 
425 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.91 
 
 
427 aa  188  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  31.75 
 
 
443 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  33.1 
 
 
432 aa  183  6e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0390  FolC bifunctional protein  33.8 
 
 
422 aa  181  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000576883  normal  0.0116756 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  35.99 
 
 
424 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  35.59 
 
 
424 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  33.85 
 
 
431 aa  179  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2510  FolC bifunctional protein  38.05 
 
 
403 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000623947 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  33.18 
 
 
416 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  32.15 
 
 
420 aa  172  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  34.69 
 
 
424 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1532  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  33.1 
 
 
434 aa  171  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182883  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  33.41 
 
 
425 aa  171  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1258  FolC bifunctional protein  37.7 
 
 
408 aa  170  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  31.76 
 
 
457 aa  170  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  30.02 
 
 
435 aa  168  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  30.02 
 
 
437 aa  168  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0358  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  32.87 
 
 
434 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1423  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  32.87 
 
 
434 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1337  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  32.93 
 
 
422 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.887259 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  31.63 
 
 
424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2693  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  32.93 
 
 
422 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  31.12 
 
 
438 aa  167  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  29.72 
 
 
441 aa  167  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1391  folylpolyglutamate synthase  30.7 
 
 
404 aa  167  5e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2471  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  32.69 
 
 
422 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  30.75 
 
 
428 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  33.58 
 
 
424 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02240  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  32.93 
 
 
422 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1341  FolC bifunctional protein  32.93 
 
 
422 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.420522  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  36.24 
 
 
414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2609  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  32.61 
 
 
422 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02200  hypothetical protein  32.93 
 
 
422 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3331  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  32.38 
 
 
420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0040495  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  28.34 
 
 
441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2466  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  32.93 
 
 
422 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  35.39 
 
 
437 aa  164  4.0000000000000004e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0207  FolC bifunctional protein  30.44 
 
 
418 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  34.78 
 
 
422 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  33.73 
 
 
436 aa  163  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0203  FolC bifunctional protein  30.44 
 
 
418 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0053743 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2605  FolC bifunctional protein  37.7 
 
 
408 aa  163  7e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  32.48 
 
 
422 aa  162  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3455  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  32.37 
 
 
422 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2507  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  33.09 
 
 
422 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  32.05 
 
 
439 aa  160  3e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23880  folylpolyglutamate synthetase  34.97 
 
 
429 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.351749  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2714  FolC bifunctional protein  35.23 
 
 
425 aa  160  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.20841  normal  0.0950332 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2595  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  33.09 
 
 
422 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.538955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>