More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1051 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1051  DEAD/DEAH box helicase-like protein  100 
 
 
458 aa  931    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0480198  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1292  DEAD/DEAH box helicase-like  69.64 
 
 
464 aa  605  9.999999999999999e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0140  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  71.96 
 
 
448 aa  605  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.398154  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3252  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  63.43 
 
 
504 aa  499  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0717985  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2120  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.27 
 
 
521 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308058  decreased coverage  0.00839171 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4353  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.73 
 
 
519 aa  474  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.807247 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2985  DEAD/DEAH box helicase  56.3 
 
 
516 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0305282 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3984  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.81 
 
 
519 aa  474  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.950119 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1913  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.91 
 
 
505 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0106  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.29 
 
 
484 aa  468  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2463  DEAD/DEAH box helicase-like  61.64 
 
 
500 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.710449  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0999  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.2 
 
 
527 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.431733  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3974  putative ATP-dependent RNA helicase  59.5 
 
 
478 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0856  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.11 
 
 
503 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0104833  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3323  DEAD/DEAH box helicase domain protein  64.23 
 
 
465 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.469232  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4464  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.39 
 
 
501 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4759  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.58 
 
 
537 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346691 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  63.14 
 
 
482 aa  462  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.341636 
 
 
-
 
NC_004310  BR0938  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  52.94 
 
 
482 aa  460  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.556655  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2431  ATP-dependent RNA helicase  57.71 
 
 
516 aa  461  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2833  DEAD/DEAH box helicase-like  55.26 
 
 
503 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.900807  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1773  DEAD/DEAH box helicase-like  62.87 
 
 
477 aa  460  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0933  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  52.94 
 
 
482 aa  459  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1478  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.85 
 
 
499 aa  461  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142934  hitchhiker  0.00960181 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2249  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.8 
 
 
498 aa  457  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2718  DEAD/DEAH box helicase  57.99 
 
 
799 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.370248  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.91 
 
 
555 aa  451  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.131298 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2746  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.71 
 
 
678 aa  448  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633229  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1657  DEAD/DEAH box helicase  61.52 
 
 
483 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0121598  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2755  DEAD/DEAH box helicase domain protein  61.14 
 
 
472 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0813357  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1324  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.71 
 
 
498 aa  447  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.695587  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2321  DEAD/DEAH box helicase-like  51.71 
 
 
487 aa  442  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2536  ATP-dependent helicase, DEAD-box  56.82 
 
 
518 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1195  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.82 
 
 
516 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1987  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.63 
 
 
507 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.173393  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0954  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.03 
 
 
494 aa  435  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000813647 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1809  DEAD/DEAH box helicase-like  56.33 
 
 
493 aa  437  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1333  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.51 
 
 
493 aa  427  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218178  normal  0.0904092 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0608  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.77 
 
 
462 aa  428  1e-118  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.166251  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1200  DEAD/DEAH box helicase-like  58.18 
 
 
644 aa  419  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.994083  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.26 
 
 
489 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0245  DEAD/DEAH box helicase-like protein  42.08 
 
 
463 aa  352  7e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283018  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3295  putative ATP-dependent RNA helicase 2  49.24 
 
 
491 aa  351  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.8 
 
 
493 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73004  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2235  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.96 
 
 
511 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.24 
 
 
571 aa  350  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0961  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.24 
 
 
509 aa  350  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0175474  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2355  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50 
 
 
497 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651471  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2082  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.52 
 
 
482 aa  349  6e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.162291 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  50.96 
 
 
482 aa  348  9e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  50.96 
 
 
482 aa  348  9e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  50.96 
 
 
482 aa  348  9e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  50.96 
 
 
482 aa  348  9e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  50.96 
 
 
482 aa  348  9e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  50.96 
 
 
481 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  50.96 
 
 
559 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.6 
 
 
452 aa  348  1e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00281492  normal  0.0306725 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2409  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.53 
 
 
493 aa  347  3e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.92601 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5658  DEAD/DEAH box helicase-like  51.24 
 
 
527 aa  345  7e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2155  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.3 
 
 
504 aa  345  8.999999999999999e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.659506  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2657  DEAD/DEAH box helicase-like  48.38 
 
 
510 aa  345  1e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2582  DEAD/DEAH box helicase-like protein  49.73 
 
 
556 aa  345  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.28 
 
 
494 aa  344  2e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0899  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  48.53 
 
 
537 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.96 
 
 
520 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0312074 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1148  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.44 
 
 
489 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0456  DEAD/DEAH box helicase-like protein  48.8 
 
 
540 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1704  DEAD/DEAH box helicase-like  50.96 
 
 
520 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2316  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.96 
 
 
520 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.83 
 
 
550 aa  342  7e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2211  ATP-dependent RNA helicase protein  48.53 
 
 
495 aa  342  9e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1101  DEAD/DEAH box helicase  46.89 
 
 
460 aa  342  9e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.173172  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2648  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.78 
 
 
479 aa  342  1e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.57 
 
 
487 aa  341  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0539  ATP-dependent RNA helicase protein  45.6 
 
 
540 aa  340  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00876522  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0617  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.53 
 
 
479 aa  340  4e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.028654 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0517  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  48.76 
 
 
506 aa  339  5e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0847838  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.9 
 
 
513 aa  339  7e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0914  ATP-dependent RNA helicase  47.21 
 
 
485 aa  339  7e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348859  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0748  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  47.21 
 
 
485 aa  339  7e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162375  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2460  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  47.21 
 
 
485 aa  338  8e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0248  ATP-dependent RNA helicase RhlE  47.21 
 
 
485 aa  338  8e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2570  ATP-dependent RNA helicase  43.93 
 
 
446 aa  339  8e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0735  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  47.21 
 
 
485 aa  338  8e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4980  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  46.19 
 
 
626 aa  338  9e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0631  putative ATP-dependent RNA helicase 2  46.38 
 
 
494 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.640854  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4853  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.19 
 
 
627 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282261  normal  0.0691248 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.12 
 
 
626 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0400  DEAD/DEAH box helicase-like  43.71 
 
 
477 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2449  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.27 
 
 
485 aa  338  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727769  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.52 
 
 
628 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3137  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.96 
 
 
423 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.417065  normal  0.231067 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0314  DEAD/DEAH box helicase  43.21 
 
 
476 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4192  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.95 
 
 
474 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0985  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.25 
 
 
463 aa  337  1.9999999999999998e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0420  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.13 
 
 
560 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437867  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03540  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family  43.61 
 
 
557 aa  336  5e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.897279  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7020  ATP-dependent RNA helicase  47.17 
 
 
469 aa  336  5e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325131  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1528  ATP-dependent RNA helicase RhlE  47.71 
 
 
477 aa  335  7.999999999999999e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.515167  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.36 
 
 
486 aa  335  9e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0203924  hitchhiker  0.000949009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>