180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1041 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1041  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  292  1e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2937  protein of unknown function DUF55  61.07 
 
 		 138 aa  165  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.362763 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1331  hypothetical protein  59.26 
 
 		 147 aa  161  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00023234  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2850  hypothetical protein  56.06 
 
 		 137 aa  158  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0291  hypothetical protein  56.39 
 
 		 137 aa  150  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.852842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0472  hypothetical protein  57.14 
 
 		 137 aa  150  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.904612  normal  0.134048 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0559  hypothetical protein  56.39 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0254  protein of unknown function DUF55  55.64 
 
 		 137 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.049773  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0317  hypothetical protein  55.64 
 
 		 137 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5451  protein of unknown function DUF55  53.33 
 
 		 137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.794452 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1317  hypothetical protein  53.68 
 
 		 148 aa  143  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559236  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1261  protein of unknown function DUF55  52.63 
 
 		 139 aa  143  8.000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.673781 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0468  hypothetical protein  55.64 
 
 		 137 aa  143  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0044  hypothetical protein  53.38 
 
 		 137 aa  141  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0082  hypothetical protein  51.13 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1217  protein of unknown function DUF55  51.49 
 
 		 137 aa  140  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.02485  hitchhiker  0.000132613 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2115  hypothetical protein  51.82 
 
 		 138 aa  139  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.596924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2222  protein of unknown function DUF55  50.75 
 
 		 147 aa  137  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.155182 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1108  hypothetical protein  52.63 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0926  protein of unknown function DUF55  53.85 
 
 		 139 aa  135  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2001  hypothetical protein  50.75 
 
 		 141 aa  134  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2368  hypothetical protein  46.81 
 
 		 142 aa  133  9e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.864843  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0242  protein of unknown function DUF55  46.32 
 
 		 138 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0087907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3218  hypothetical protein  50 
 
 		 144 aa  128  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0164  hypothetical protein  53.03 
 
 		 141 aa  127  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1136  protein of unknown function DUF55  49.62 
 
 		 137 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0115295  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1512  hypothetical protein  53.03 
 
 		 137 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2489  hypothetical protein  46.15 
 
 		 142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0016498  normal  0.0588103 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2917  hypothetical protein  51.13 
 
 		 137 aa  124  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0673011  normal  0.0896051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0705  hypothetical protein  44.7 
 
 		 133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1748  hypothetical protein  50.38 
 
 		 138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2173  hypothetical protein  49.62 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3573  hypothetical protein  47.66 
 
 		 135 aa  121  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612442  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0064  protein of unknown function DUF55  47.79 
 
 		 146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0729  hypothetical protein  48.12 
 
 		 140 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.580961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0742  protein of unknown function DUF55  48.12 
 
 		 140 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0060  hypothetical protein  46.62 
 
 		 142 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0702  protein of unknown function DUF55  48.12 
 
 		 139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.807504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0076  protein of unknown function DUF55  47.06 
 
 		 146 aa  116  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0059  hypothetical protein  47.06 
 
 		 154 aa  115  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0061  hypothetical protein  44.12 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.177861  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2832  hypothetical protein  44.2 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4077  hypothetical protein  44.36 
 
 		 137 aa  114  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_004310  BR1891  hypothetical protein  45.86 
 
 		 142 aa  113  7.999999999999999e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1819  hypothetical protein  45.86 
 
 		 142 aa  113  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0710947  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2962  hypothetical protein  48.15 
 
 		 143 aa  113  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.481941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1341  hypothetical protein  47.37 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000414601 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4141  hypothetical protein  45.86 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2275  hypothetical protein  42.38 
 
 		 163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3695  protein of unknown function DUF55  43.61 
 
 		 143 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3412  protein of unknown function DUF55  42.54 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0971  hypothetical protein  43.61 
 
 		 144 aa  104  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3206  hypothetical protein  42.86 
 
 		 141 aa  103  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162762  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1486  hypothetical protein  42.34 
 
 		 139 aa  102  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6859  protein of unknown function DUF55  40.38 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0506026 
 
 
-
 
NC_002978  WD0724  hypothetical protein  37.78 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.142066  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2363  hypothetical protein  42.38 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0926  hypothetical protein  38.52 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1154  hypothetical protein  40 
 
 		 135 aa  102  3e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.306462  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4016  protein of unknown function DUF55  42.11 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1357  hypothetical protein  38.82 
 
 		 155 aa  100  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000263938  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2983  protein of unknown function DUF55  36.6 
 
 		 155 aa  100  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.394198 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0319  hypothetical protein  41.78 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5266  hypothetical protein  39.07 
 
 		 153 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69050  hypothetical protein  40.54 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0266  protein of unknown function DUF55  40.67 
 
 		 173 aa  99.8  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.252089  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5972  hypothetical protein  41.1 
 
 		 152 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3446  hypothetical protein  43.24 
 
 		 156 aa  98.2  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271189  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5205  hypothetical protein  39.04 
 
 		 149 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3129  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  40.74 
 
 		 150 aa  97.1  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2770  protein of unknown function DUF55  39.73 
 
 		 152 aa  97.1  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0051852  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5440  hypothetical protein  40.41 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3975  protein of unknown function DUF55  38 
 
 		 154 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.644317  normal  0.0207421 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0315  hypothetical protein  36.99 
 
 		 149 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5031  hypothetical protein  39.19 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01690  AT DNA binding protein (Thy28), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08590)  37.13 
 
 		 324 aa  94.7  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.240865 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0251  protein of unknown function DUF55  39.33 
 
 		 156 aa  94.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1642  hypothetical protein  35.76 
 
 		 152 aa  94  7e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  7.18563e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0509  hypothetical protein  35.76 
 
 		 152 aa  93.6  8e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000393887  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1853  protein of unknown function DUF55  34.69 
 
 		 150 aa  93.6  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.890211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0815  hypothetical protein  37.5 
 
 		 160 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.422094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2196  hypothetical protein  34.69 
 
 		 150 aa  93.6  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1573  hypothetical protein  40.13 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000165437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0781  protein of unknown function DUF55  38.67 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0209669  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5229  hypothetical protein  36.3 
 
 		 149 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5113  hypothetical protein  38.36 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.839421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3212  hypothetical protein  38.56 
 
 		 156 aa  91.3  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2537  hypothetical protein  41.18 
 
 		 158 aa  90.5  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal  0.0651387 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0353  hypothetical protein  39.74 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2670  protein of unknown function DUF55  38.26 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0856709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0651  hypothetical protein  39.19 
 
 		 167 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2792  hypothetical protein  38.51 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.495937 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2477  hypothetical protein  37.09 
 
 		 153 aa  88.2  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0301106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1312  hypothetical protein  37.75 
 
 		 165 aa  88.2  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.29751e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2907  hypothetical protein  36.11 
 
 		 152 aa  87.4  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0170  protein of unknown function DUF55  36.57 
 
 		 131 aa  87.4  7e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2287  hypothetical protein  36.42 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000164575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2359  hypothetical protein  36.42 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000352986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0697  protein of unknown function DUF55  36.36 
 
 		 155 aa  86.3  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2403  hypothetical protein  38.26 
 
 		 168 aa  85.9  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>