More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1021 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
246 aa  478  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  66.26 
 
 
278 aa  323  1e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  65.85 
 
 
278 aa  318  5e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1605  ABC transporter sugar permease  62.2 
 
 
278 aa  285  2.9999999999999996e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1548  monosaccharide-transporting ATPase  62.2 
 
 
278 aa  285  4e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1924  sugar ABC transporter, permease protein  58.54 
 
 
271 aa  270  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444482  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  45.34 
 
 
281 aa  215  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  42.68 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.35 
 
 
279 aa  207  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0471  ABC-type sugar transport system permease component-like  44.53 
 
 
276 aa  207  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.65 
 
 
274 aa  205  7e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.15 
 
 
311 aa  203  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  42.98 
 
 
302 aa  202  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.22 
 
 
275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.49 
 
 
271 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2231  Monosaccharide-transporting ATPase  44.49 
 
 
271 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3574  Monosaccharide-transporting ATPase  44.72 
 
 
290 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11620  ABC-type sugar transport system, permease component  43.09 
 
 
306 aa  193  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00242068  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3424  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  41.99 
 
 
277 aa  193  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.35 
 
 
269 aa  192  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.68 
 
 
275 aa  192  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.15 
 
 
295 aa  192  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.25 
 
 
297 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.65 
 
 
298 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.26 
 
 
268 aa  188  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.33 
 
 
274 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.26 
 
 
294 aa  187  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000948808  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09191  ABC-type sugar transport system, permease component  43.09 
 
 
287 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  41.18 
 
 
269 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
294 aa  186  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000583333  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.04 
 
 
284 aa  186  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.146391  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3031  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
277 aa  186  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.04 
 
 
284 aa  186  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0401383  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.4 
 
 
273 aa  186  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.41 
 
 
278 aa  186  4e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.84 
 
 
310 aa  186  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
290 aa  185  5e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.191447  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.24 
 
 
272 aa  185  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.34 
 
 
280 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0326071  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.35 
 
 
298 aa  183  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00177289  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.73 
 
 
281 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.56 
 
 
287 aa  182  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.27 
 
 
297 aa  182  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.4 
 
 
283 aa  182  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1881  monosaccharide-transporting ATPase  38.87 
 
 
297 aa  182  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.87 
 
 
276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0827234 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 
279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3639  monosaccharide-transporting ATPase  39.92 
 
 
292 aa  182  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41 
 
 
275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.8 
 
 
275 aa  182  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.96 
 
 
298 aa  179  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.96 
 
 
297 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227991  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.06 
 
 
275 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.66 
 
 
297 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195165  normal  0.550162 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 
285 aa  179  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
281 aa  179  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
277 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000457855  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0728  putative permease protein of sugar ABC transporter  43.09 
 
 
263 aa  178  5.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 
300 aa  178  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.49 
 
 
299 aa  178  9e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2748  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.02 
 
 
306 aa  177  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925228  normal  0.18236 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 
294 aa  177  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68182  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1550  MalG-type ABC sugar transport system permease component  37.3 
 
 
308 aa  177  1e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.02 
 
 
285 aa  177  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000816013  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0383  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.37 
 
 
268 aa  177  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.68 
 
 
271 aa  177  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.68 
 
 
275 aa  176  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.4 
 
 
278 aa  175  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.482027  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0840  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  40.85 
 
 
273 aa  175  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.610279  normal  0.112445 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  39.83 
 
 
304 aa  174  8e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.86 
 
 
271 aa  174  9e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.6 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00258755  normal  0.655339 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.23 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
303 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.4 
 
 
278 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.716321  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
277 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.57 
 
 
324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.52 
 
 
301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7346  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  37.8 
 
 
278 aa  173  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4881  monosaccharide-transporting ATPase  42.01 
 
 
269 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196924  normal  0.0342078 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.24 
 
 
271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.96 
 
 
276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.68 
 
 
299 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0163331  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.78 
 
 
290 aa  171  9e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309927  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2023  Monosaccharide-transporting ATPase  39.67 
 
 
295 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07090  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.04 
 
 
297 aa  171  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.57 
 
 
298 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337575  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1938  putative permease protein of sugar ABC transporter  44.16 
 
 
274 aa  170  2e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.17 
 
 
275 aa  170  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
297 aa  170  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0358856  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.94 
 
 
299 aa  170  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
261 aa  169  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.290821  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
267 aa  169  5e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705466  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 
296 aa  169  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.982521  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0528  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.87 
 
 
281 aa  169  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00417189  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.25 
 
 
296 aa  168  6e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0552972  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.11 
 
 
278 aa  168  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.519096  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
315 aa  168  8e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.3 
 
 
288 aa  168  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>