99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1015 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  39.35 
 
 		 992 aa  672    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1016 aa  2065    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  38.96 
 
 		 1010 aa  632  1e-179  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  38.9 
 
 		 1008 aa  627  1e-178  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  39 
 
 		 1008 aa  626  1e-178  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  40.7 
 
 		 1012 aa  614  9.999999999999999e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  38.51 
 
 		 1026 aa  585  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1075 aa  163  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  24.7 
 
 		 986 aa  147  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 1114 aa  140  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 1105 aa  120  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 1123 aa  114  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 1176 aa  112  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  31.04 
 
 		 1203 aa  109  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1067 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  31.83 
 
 		 1123 aa  108  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  25.11 
 
 		 1052 aa  108  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  24.85 
 
 		 1097 aa  105  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1071 aa  104  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 1232 aa  104  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  24.14 
 
 		 1077 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 1041 aa  102  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 1105 aa  101  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 1065 aa  99.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  29.77 
 
 		 1298 aa  99.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1053 aa  98.6  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  23.42 
 
 		 1066 aa  98.2  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  22.92 
 
 		 1007 aa  97.8  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  26.3 
 
 		 1125 aa  97.8  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  23.04 
 
 		 1122 aa  97.4  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  32.44 
 
 		 1061 aa  97.1  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  28.71 
 
 		 1161 aa  96.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  29.87 
 
 		 1056 aa  96.7  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  28.87 
 
 		 1081 aa  95.9  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  28.98 
 
 		 1075 aa  95.5  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  30.46 
 
 		 1068 aa  95.5  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1069 aa  95.1  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 		 1007 aa  95.1  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  29.18 
 
 		 1257 aa  94.7  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  24.1 
 
 		 1037 aa  94.4  9e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  28.53 
 
 		 1057 aa  93.2  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  27.79 
 
 		 1008 aa  92.8  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 1206 aa  92.4  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1141 aa  91.7  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  24.64 
 
 		 1041 aa  90.9  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  26.55 
 
 		 1162 aa  89.7  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  29.25 
 
 		 1196 aa  88.6  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  24.32 
 
 		 1071 aa  87  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  27.59 
 
 		 511 aa  84.7  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.48 
 
 		 1050 aa  83.2  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 1149 aa  82.4  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1173 aa  82  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  25.15 
 
 		 1100 aa  80.9  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  26.45 
 
 		 1051 aa  79.7  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  25.15 
 
 		 1195 aa  80.1  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  26.18 
 
 		 1194 aa  79  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4161  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1008 aa  78.6  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000881228  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  22.12 
 
 		 1074 aa  77.4  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  23.56 
 
 		 972 aa  75.1  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 1066 aa  74.7  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  25 
 
 		 1210 aa  74.7  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  20.52 
 
 		 994 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  26.93 
 
 		 1066 aa  72  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 1167 aa  72  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  26.22 
 
 		 1068 aa  71.6  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 1153 aa  71.2  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  26.75 
 
 		 1116 aa  69.7  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  27.89 
 
 		 1066 aa  70.1  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  24.84 
 
 		 1074 aa  69.7  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  24.76 
 
 		 1125 aa  68.2  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1132 aa  67  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  24.77 
 
 		 1126 aa  64.7  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  21.35 
 
 		 966 aa  64.7  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  27.92 
 
 		 1162 aa  64.3  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  27.16 
 
 		 1129 aa  64.3  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  23.65 
 
 		 1120 aa  62.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  24.25 
 
 		 1122 aa  62.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  22.82 
 
 		 997 aa  62  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 1007 aa  61.2  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 991 aa  61.2  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  25.08 
 
 		 1054 aa  60.1  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  24.69 
 
 		 1194 aa  60.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  25.21 
 
 		 1001 aa  59.7  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 1010 aa  57  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  24.44 
 
 		 1109 aa  55.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  22.32 
 
 		 993 aa  54.3  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5117  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 		 801 aa  52.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  22.83 
 
 		 1188 aa  52.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  27.3 
 
 		 979 aa  51.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2574  hypothetical protein  27.75 
 
 		 710 aa  50.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  25.32 
 
 		 1105 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 1124 aa  49.3  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0522  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 727 aa  46.2  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.569695 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4373  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 730 aa  46.2  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116704 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 836 aa  46.2  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 918 aa  45.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0509  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 743 aa  45.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 845 aa  45.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0595  putative outer membrane receptor signal peptide protein  28.57 
 
 		 729 aa  45.1  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.426057  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>