More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0986 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0986  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 158 aa  316  9e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2229  transcription elongation factor GreA  84.81 
 
 		 158 aa  275  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.570575  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0439  transcription elongation factor GreA  81.65 
 
 		 158 aa  274  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  58.28 
 
 		 152 aa  174  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  56.05 
 
 		 157 aa  174  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  57.05 
 
 		 158 aa  174  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  56.41 
 
 		 157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6800  transcription elongation factor GreA  57.69 
 
 		 158 aa  170  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2450  transcription elongation factor GreA  57.69 
 
 		 158 aa  170  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2876  transcription elongation factor GreA  57.05 
 
 		 158 aa  170  7.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3836  transcription elongation factor GreA  57.05 
 
 		 158 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1456  transcription elongation factor GreA  57.69 
 
 		 165 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1515  transcription elongation factor GreA  57.69 
 
 		 174 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  55.13 
 
 		 157 aa  168  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2751  transcription elongation factor GreA  55.77 
 
 		 168 aa  168  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  56.41 
 
 		 158 aa  165  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  57.05 
 
 		 158 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  55.41 
 
 		 203 aa  164  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  55.41 
 
 		 157 aa  164  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  57.05 
 
 		 158 aa  164  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  55.41 
 
 		 157 aa  164  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  53.85 
 
 		 157 aa  163  8e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  56.41 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  56.05 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  53.21 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  51.53 
 
 		 164 aa  160  5.0000000000000005e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3127  transcription elongation factor GreA  53.85 
 
 		 158 aa  160  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.59991  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0673  transcription elongation factor GreA  55.63 
 
 		 152 aa  159  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.487901 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  54.43 
 
 		 158 aa  157  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  53.85 
 
 		 158 aa  157  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  54.14 
 
 		 156 aa  155  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  53.21 
 
 		 171 aa  155  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  51.63 
 
 		 158 aa  153  8e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  50.99 
 
 		 152 aa  152  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  56.13 
 
 		 158 aa  153  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  52.26 
 
 		 158 aa  153  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  51.95 
 
 		 164 aa  153  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0498  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  52.9 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 		 166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1023  transcription elongation factor GreA  50.96 
 
 		 160 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 		 166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0133  transcription elongation factor GreA  51.57 
 
 		 162 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.431567  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 		 166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  52.53 
 
 		 172 aa  151  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1218  transcription elongation factor GreA  50.96 
 
 		 160 aa  150  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  51.3 
 
 		 158 aa  150  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1089  transcription elongation factor GreA  50.96 
 
 		 160 aa  150  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0566  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 		 179 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0510993  normal  0.103581 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2307  transcription elongation factor GreA  52.26 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  51.61 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 		 156 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  54.19 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1901  transcription elongation factor GreA  51.61 
 
 		 158 aa  148  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00416559  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  54.19 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  51.28 
 
 		 168 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4421  transcription elongation factor GreA  51.92 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  52.9 
 
 		 158 aa  148  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3400  transcription elongation factor GreA  50.96 
 
 		 158 aa  147  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0549133  normal  0.0891208 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  51.59 
 
 		 156 aa  147  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  51.59 
 
 		 156 aa  147  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1725  transcription elongation factor GreA  52.9 
 
 		 158 aa  147  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  51.95 
 
 		 157 aa  147  8e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 		 158 aa  146  9e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  51.28 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  51.28 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  52.9 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1522  transcription elongation factor GreA  53.55 
 
 		 158 aa  144  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  54.19 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1776  transcription elongation factor GreA  51.61 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0106174 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002600  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 		 157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000901215  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2033  transcription elongation factor GreA  52.26 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  50.32 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  51.9 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3084  GreA/GreB family elongation factor  49.37 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0589  transcription elongation factor GreA  50.96 
 
 		 157 aa  144  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00434692  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3457  transcription elongation factor GreA  51.92 
 
 		 158 aa  143  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.880997  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2612  transcription elongation factor GreA  53.25 
 
 		 158 aa  143  7.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.657313 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  52.9 
 
 		 158 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  49.69 
 
 		 159 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  52.9 
 
 		 158 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  52.9 
 
 		 158 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  52.9 
 
 		 158 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0808  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 159 aa  143  8.000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.350185  normal  0.0132742 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3657  transcription elongation factor GreA  50.63 
 
 		 158 aa  143  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00121074  normal  0.243551 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3488  transcription elongation factor GreA  50.63 
 
 		 158 aa  143  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000067905  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3558  transcription elongation factor GreA  50.63 
 
 		 158 aa  143  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0635889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3595  transcription elongation factor GreA  50.63 
 
 		 158 aa  143  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3489  transcription elongation factor GreA  50.63 
 
 		 158 aa  143  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2192  transcription elongation factor GreA  52.83 
 
 		 173 aa  143  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127913  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1774  transcription elongation factor GreA  50.32 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  49.37 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2821  transcription elongation factor GreA  51.61 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3748  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  49.37 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2007  GreA/GreB family elongation factor  50.63 
 
 		 180 aa  141  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  52.26 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>