More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0906 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0906  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  802    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00747371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  50 
 
 		 396 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  52.64 
 
 		 395 aa  391  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  44.07 
 
 		 397 aa  333  5e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  42.01 
 
 		 389 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  44.84 
 
 		 548 aa  296  5e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  45.94 
 
 		 548 aa  294  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  43.69 
 
 		 541 aa  291  9e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  43.19 
 
 		 453 aa  288  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  44.3 
 
 		 396 aa  287  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  43.89 
 
 		 550 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  43.89 
 
 		 550 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  43.89 
 
 		 550 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  43 
 
 		 393 aa  283  5.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  33.93 
 
 		 385 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.25 
 
 		 378 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  32.66 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.92 
 
 		 384 aa  178  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  35.13 
 
 		 386 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.96 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0617  DitF protein  32.63 
 
 		 400 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  33.69 
 
 		 389 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  32.32 
 
 		 390 aa  166  8e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  34.25 
 
 		 394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  31.59 
 
 		 385 aa  163  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  30.52 
 
 		 392 aa  162  7e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  31.81 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  31.84 
 
 		 385 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  32.32 
 
 		 385 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.12 
 
 		 387 aa  160  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  30.67 
 
 		 385 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  33.51 
 
 		 390 aa  158  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  31.83 
 
 		 388 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  32.4 
 
 		 381 aa  158  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  31.09 
 
 		 385 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  31.09 
 
 		 385 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  35.16 
 
 		 388 aa  157  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  32.74 
 
 		 389 aa  156  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  34.35 
 
 		 381 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  31.71 
 
 		 391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  31.49 
 
 		 390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  31.52 
 
 		 394 aa  154  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  32.82 
 
 		 395 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  33.25 
 
 		 390 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  31.43 
 
 		 383 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4632  acetyl-CoA acetyltransferase  33.16 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  32.51 
 
 		 389 aa  150  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  30.4 
 
 		 385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  32.35 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  30.73 
 
 		 385 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  34.07 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  32.4 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.11 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  33.06 
 
 		 380 aa  144  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  30.18 
 
 		 388 aa  144  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  32.9 
 
 		 384 aa  142  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  31.77 
 
 		 383 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2044  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  30.71 
 
 		 360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.09 
 
 		 389 aa  140  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  32.25 
 
 		 383 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  31.07 
 
 		 389 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  31.56 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  31.62 
 
 		 403 aa  136  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.77 
 
 		 382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  30.26 
 
 		 383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  31.07 
 
 		 402 aa  134  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  32.23 
 
 		 379 aa  133  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.19 
 
 		 397 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3540  hypothetical protein  29.34 
 
 		 392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  33.85 
 
 		 382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  32.51 
 
 		 379 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  31.87 
 
 		 379 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  33.09 
 
 		 393 aa  129  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  29.64 
 
 		 388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  29.64 
 
 		 388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  32.23 
 
 		 389 aa  125  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  28.5 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  34.04 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  28.07 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  29.59 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1999  thiolase  29.07 
 
 		 381 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.915594  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  30.79 
 
 		 388 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  30.79 
 
 		 388 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  30.79 
 
 		 388 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  30.75 
 
 		 382 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  29.64 
 
 		 388 aa  123  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  29.64 
 
 		 388 aa  123  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  31.13 
 
 		 379 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1761  thiolase  28.64 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0585987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  29.81 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1779  thiolase  28.64 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187266  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  29.38 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1826  thiolase  28.64 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  29.38 
 
 		 403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  32.29 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  29.81 
 
 		 402 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0050  hypothetical protein  29.81 
 
 		 402 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0851197  normal  0.0510911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  33.48 
 
 		 381 aa  119  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0529  putative nonspecific lipid-transfer protein  29.9 
 
 		 388 aa  119  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6481  thiolase  30.13 
 
 		 388 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>