175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0899 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  269  7e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  45.67 
 
 
137 aa  132  1e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  44.19 
 
 
550 aa  124  4e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  44.19 
 
 
550 aa  124  4e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  44.19 
 
 
550 aa  123  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  43.75 
 
 
132 aa  122  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  44.62 
 
 
541 aa  120  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  39.1 
 
 
137 aa  114  4e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  39.1 
 
 
137 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  39.1 
 
 
137 aa  113  1e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  39.84 
 
 
548 aa  110  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  40.62 
 
 
548 aa  110  9e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  38.76 
 
 
135 aa  108  2e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  36.43 
 
 
135 aa  104  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  37.59 
 
 
137 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  41.27 
 
 
319 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  37.41 
 
 
155 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  37.59 
 
 
137 aa  100  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  35.34 
 
 
143 aa  97.4  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  37.69 
 
 
321 aa  94  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  40 
 
 
132 aa  93.6  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  35.34 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  34.59 
 
 
137 aa  89.4  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  37.88 
 
 
136 aa  88.6  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  36.8 
 
 
315 aa  84.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3856  protein of unknown function DUF35  39.68 
 
 
322 aa  81.6  3e-15  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.343505  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  32.31 
 
 
133 aa  80.5  8e-15  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  36.75 
 
 
132 aa  78.6  3e-14  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  35.61 
 
 
140 aa  78.2  4e-14  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  36.75 
 
 
132 aa  77.8  5e-14  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  32.5 
 
 
146 aa  77.4  6e-14  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  34.09 
 
 
138 aa  77.4  6e-14  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  35.61 
 
 
143 aa  77  8e-14  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  35.83 
 
 
141 aa  75.9  2e-13  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  36 
 
 
120 aa  75.9  2e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  29.77 
 
 
139 aa  75.1  3e-13  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  32.58 
 
 
138 aa  75.1  3e-13  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  32.58 
 
 
138 aa  75.1  3e-13  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4020  hypothetical protein  40 
 
 
141 aa  74.7  4e-13  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.909625 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  33.61 
 
 
143 aa  74.3  5e-13  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  39.81 
 
 
305 aa  73.9  7e-13  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  35.11 
 
 
138 aa  73.6  8e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  36.94 
 
 
129 aa  73.2  1e-12  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6833  hypothetical protein  37.89 
 
 
121 aa  72.8  1e-12  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4633  hypothetical protein  33.61 
 
 
153 aa  72  2e-12  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  35.88 
 
 
152 aa  72  2e-12  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  37.61 
 
 
141 aa  72  2e-12  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  33.62 
 
 
132 aa  72  2e-12  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  37.19 
 
 
149 aa  72.4  2e-12  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  29.91 
 
 
130 aa  72.4  2e-12  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  35.59 
 
 
144 aa  72.8  2e-12  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  35.88 
 
 
152 aa  72  2e-12  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  34.86 
 
 
136 aa  71.6  3e-12  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  29.63 
 
 
140 aa  71.6  3e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  33.94 
 
 
143 aa  71.2  4e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  29.69 
 
 
129 aa  71.2  5e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  29.41 
 
 
133 aa  70.9  6e-12  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  33.03 
 
 
319 aa  70.5  7e-12  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  33.05 
 
 
130 aa  70.5  7e-12  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  35.11 
 
 
152 aa  69.7  1e-11  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  35.11 
 
 
152 aa  69.7  1e-11  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  32.2 
 
 
130 aa  69.7  1e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  35.59 
 
 
136 aa  70.1  1e-11  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  35.11 
 
 
152 aa  69.7  1e-11  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  35.11 
 
 
152 aa  69.7  1e-11  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  35.11 
 
 
152 aa  69.7  1e-11  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  35.11 
 
 
152 aa  69.7  1e-11  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  35.11 
 
 
152 aa  68.6  3e-11  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  33.06 
 
 
176 aa  68.2  4e-11  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  36.36 
 
 
311 aa  67.8  5e-11  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  31.03 
 
 
142 aa  67.8  5e-11  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  34.82 
 
 
151 aa  67.8  5e-11  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  33.61 
 
 
132 aa  67.4  6e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  5.85754e-05  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  33.04 
 
 
132 aa  66.6  1e-10  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  33.05 
 
 
312 aa  66.6  1e-10  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  26.12 
 
 
136 aa  65.9  2e-10  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  29.55 
 
 
132 aa  65.9  2e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  36.52 
 
 
317 aa  65.1  3e-10  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  36.52 
 
 
318 aa  64.7  4e-10  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  36.52 
 
 
318 aa  64.7  4e-10  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  33.04 
 
 
132 aa  64.7  4e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  34.17 
 
 
145 aa  63.9  7e-10  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  34.17 
 
 
145 aa  63.9  7e-10  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0060  protein of unknown function DUF35  33.72 
 
 
136 aa  63.9  7e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  34.56 
 
 
324 aa  63.9  7e-10  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  30.4 
 
 
145 aa  63.9  7e-10  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  34.17 
 
 
145 aa  63.9  7e-10  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  29.41 
 
 
135 aa  63.5  8e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  34.19 
 
 
138 aa  63.5  9e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  32.74 
 
 
134 aa  63.5  1e-09  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  2.62786e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  30.51 
 
 
144 aa  63.2  1e-09  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  30.77 
 
 
140 aa  62.8  2e-09  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  36.52 
 
 
317 aa  62.8  2e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  35.83 
 
 
333 aa  62.4  2e-09  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  31.36 
 
 
132 aa  61.2  4e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  37.5 
 
 
131 aa  61.2  4e-09  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  38.96 
 
 
120 aa  61.6  4e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  28.81 
 
 
130 aa  59.7  1e-08  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0902  hypothetical protein  27.5 
 
 
140 aa  60.1  1e-08  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  34.75 
 
 
142 aa  58.9  2e-08  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>