More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0886 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0886  TonB-dependent receptor  100 
 
 
806 aa  1640  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0016588  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 
817 aa  265  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0330  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 
777 aa  260  8e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030228  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0302  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 
795 aa  247  8e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122608  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 
761 aa  234  7e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 
775 aa  232  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 
832 aa  227  7e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 
784 aa  227  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 
755 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 
755 aa  226  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 
761 aa  222  2e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 
792 aa  222  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 
730 aa  221  4e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 
765 aa  219  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 
771 aa  218  3e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 
775 aa  217  7e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 
860 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 
790 aa  208  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 
780 aa  207  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  26.95 
 
 
739 aa  207  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  30 
 
 
758 aa  204  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 
804 aa  201  4e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  2.57561e-05  unclonable  4.38861e-07 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 
851 aa  201  4e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 
763 aa  201  4e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 
730 aa  200  1e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 
783 aa  197  7e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 
744 aa  197  9e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 
704 aa  194  8e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 
730 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  7.05013e-05 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 
807 aa  190  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 
720 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 
777 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 
856 aa  190  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 
779 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 
745 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 
766 aa  188  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 
723 aa  187  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 
780 aa  187  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 
726 aa  187  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  26 
 
 
743 aa  186  1e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 
796 aa  186  2e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  25.64 
 
 
809 aa  186  2e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 
780 aa  184  4e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  28.85 
 
 
748 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  9.1536e-08  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 
790 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 
776 aa  182  3e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 
720 aa  182  3e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 
764 aa  182  3e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 
782 aa  182  3e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 
903 aa  181  5e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 
796 aa  181  5e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 
803 aa  181  5e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 
710 aa  181  6e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 
738 aa  180  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 
753 aa  180  8e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  27.23 
 
 
741 aa  177  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  2.84329e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3473  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 
786 aa  177  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 
728 aa  176  1e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 
729 aa  176  2e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 
764 aa  175  3e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 
814 aa  175  3e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 
732 aa  173  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 
743 aa  173  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 
728 aa  173  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 
749 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  3.58025e-10  decreased coverage  1.02915e-05 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 
758 aa  172  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 
736 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 
773 aa  171  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 
758 aa  171  7e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 
758 aa  170  8e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 
734 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  27.42 
 
 
751 aa  168  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  2.21173e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  26.7 
 
 
759 aa  168  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  25.69 
 
 
799 aa  166  2e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 
764 aa  166  2e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  3.45148e-11  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 
771 aa  165  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 
737 aa  165  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  26.5 
 
 
797 aa  165  4e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 
786 aa  165  4e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 
794 aa  164  5e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 
785 aa  164  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 
784 aa  164  8e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  3.45148e-11  hitchhiker  6.7501e-06 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 
759 aa  163  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 
758 aa  162  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 
700 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 
730 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  7.40519e-09  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 
780 aa  162  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 
757 aa  161  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03368  putative TonB-dependent receptor  28.05 
 
 
754 aa  162  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00133491  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 
803 aa  161  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 
790 aa  161  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.59663e-05 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 
713 aa  161  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 
751 aa  161  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  8.75615e-10  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1474  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 
817 aa  161  6e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.698611  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  25 
 
 
809 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  28.48 
 
 
767 aa  159  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 
750 aa  159  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 
733 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 
776 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 
789 aa  158  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>