80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0863 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  297  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  34.56 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  32.87 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0968  hypothetical protein  38.41 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0459119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  35.71 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  37.23 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  34.13 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13509  hypothetical protein  35.83 
 
 		 168 aa  57  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2408  hypothetical protein  38.02 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0302  hypothetical protein  34.13 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.029098  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1179  hypothetical protein  32.8 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1490  hypothetical protein  31.11 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1152  hypothetical protein  33.07 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1169  hypothetical protein  33.07 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4928  hypothetical protein  33.85 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  33.87 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  34.11 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  36.59 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  32.86 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  33.59 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3722  hypothetical protein  33.06 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5864  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2333 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2721  hypothetical protein  32.79 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  34.45 
 
 		 156 aa  50.4  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  35.77 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  33.87 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  28.47 
 
 		 190 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  35.77 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  31.69 
 
 		 450 aa  50.1  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  32.5 
 
 		 133 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1963  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1943  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  0.939013 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2009  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2029  hypothetical protein  33.59 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1359  hypothetical protein  33.58 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.17438  normal  0.585219 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  47.37 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4956  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  28.86 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6762  hypothetical protein  32.17 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3839  hypothetical protein  29.13 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  33.83 
 
 		 150 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4910  hypothetical protein  30.3 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  29.6 
 
 		 185 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4369  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1516  hypothetical protein  30.08 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0195085  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2921  hypothetical protein  34.74 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2722  hypothetical protein  30.08 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5694  hypothetical protein  24.31 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.614955 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2029  hypothetical protein  29.01 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0499  hypothetical protein  30.08 
 
 		 180 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1978  hypothetical protein  29.31 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.335296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3701  hypothetical protein  30.58 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.713261  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4109  hypothetical protein  32.09 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3720  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  31.94 
 
 		 274 aa  43.5  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.81836  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  31.85 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  29.27 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  30.6 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1484  hypothetical protein  25.83 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7088  hypothetical protein  28.91 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3759  hypothetical protein  32.23 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.800623  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0309  hypothetical protein  31.5 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  31.5 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  28.99 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1465  hypothetical protein  29.23 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.726298  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4587  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  27.82 
 
 		 158 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.892698  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3776  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  27.82 
 
 		 158 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.408818 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  30.83 
 
 		 451 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  27.82 
 
 		 181 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3810  hypothetical protein  33.83 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0820746  normal  0.258605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2874  hypothetical protein  32.32 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00821183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1984  hypothetical protein  25.85 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3464  hypothetical protein  33.07 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4199  hypothetical protein  26.45 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4856  hypothetical protein  29.32 
 
 		 153 aa  40.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0599762  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5802  hypothetical protein  32.26 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2372  hypothetical protein  28.46 
 
 		 184 aa  40.4  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2324  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  26.85 
 
 		 162 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1769  hypothetical protein  29.71 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3544  hypothetical protein  30.94 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.174906  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4591  hypothetical protein  32.56 
 
 		 139 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0395893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4178  hypothetical protein  29.92 
 
 		 141 aa  40  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>