217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0814 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  100 
 
 		 204 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  52.2 
 
 		 177 aa  175  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  40.57 
 
 		 184 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  40.91 
 
 		 199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  38.18 
 
 		 184 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  38.42 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4995  2'-5' RNA ligase  41.14 
 
 		 178 aa  109  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5472  2'-5' RNA ligase  43.5 
 
 		 180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  36.78 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1775  2'-5' RNA ligase  40.68 
 
 		 179 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0390  putative 2'-5' RNA ligase  39.52 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117956  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4176  2'-5' RNA ligase  35 
 
 		 195 aa  105  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0620865  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0832  2'-5' RNA ligase  38.86 
 
 		 177 aa  104  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.658836  normal  0.059604 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0533  2',5' RNA ligase  37.5 
 
 		 178 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.883714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0189  2'-5' RNA ligase  36.72 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0810981  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  37.72 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  34.25 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  34.09 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0096  2'-5' RNA ligase  35.83 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  34.41 
 
 		 197 aa  101  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  36 
 
 		 182 aa  101  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0283  2',5' RNA ligase  37.43 
 
 		 188 aa  101  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277228 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0417  2',5' RNA ligase  36.53 
 
 		 178 aa  101  9e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1922  2'-5' RNA ligase  38.29 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0081  2'-5' RNA ligase  35.29 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0084  hypothetical protein  35.29 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.514694  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  37.06 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  33.69 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  36.53 
 
 		 178 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0261  2'-5' RNA ligase  37.29 
 
 		 179 aa  99.8  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00684061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0408  2'-5' RNA ligase  40.34 
 
 		 176 aa  99  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  36.31 
 
 		 179 aa  98.6  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  35.33 
 
 		 178 aa  98.2  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1013  2'-5' RNA ligase  35.03 
 
 		 179 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.184793 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  30.48 
 
 		 194 aa  97.1  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4476  2'-5' RNA ligase  37.64 
 
 		 191 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  32.78 
 
 		 189 aa  93.6  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  36 
 
 		 179 aa  92.8  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  33.52 
 
 		 182 aa  91.7  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  31.47 
 
 		 199 aa  91.3  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3995  2'-5' RNA ligase  36.67 
 
 		 188 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173651  normal  0.591095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4364  2'-5' RNA ligase  36.11 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5914  2,5 RNA ligase  39.11 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.720477 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  33.71 
 
 		 186 aa  88.2  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  35.2 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0528  2',5' RNA ligase  33.33 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  35.2 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  31.63 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  36.26 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  27.87 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  30.22 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3011  2'-5' RNA ligase  33.91 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  36.5 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  31.32 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  32.03 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2786  2'-5' RNA ligase  34.08 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  25.79 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  28.21 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02479  3'-5' RNA ligase  27.43 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  32.42 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  27.84 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  26.46 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  27.57 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1002  2'-5' RNA ligase  26.97 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000523375  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  28.34 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  25.27 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  26.98 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0869  2'-5' RNA ligase  29.83 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1166  2'-5' RNA ligase  29.83 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  29.44 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  32.8 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1647  2'-5' RNA ligase  26.09 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  29.55 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1659  2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000321406  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  29.78 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  29.05 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  29.26 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  23.33 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  28.25 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  29.55 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2817  2'-5' RNA ligase  32.43 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.433451  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3240  2',5' RNA ligase  31.49 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  27.56 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2212  2'-5' RNA ligase  32.58 
 
 		 186 aa  62  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3743  2'-5' RNA ligase  33.11 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0012  2'-5' RNA ligase  31.58 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0833472 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1636  2'-5' RNA ligase  33.83 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  25.68 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0172  2'-5' RNA ligase  25.45 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1939  2'-5' RNA ligase  25.14 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.33767  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  24.86 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  26.88 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  26.88 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2732  hypothetical protein  32 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  22.91 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3712  2'-5' RNA ligase  32.67 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0326  2'-5' RNA ligase  33.52 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2784  2'-5' RNA ligase  32 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0421  putative 2'-5' RNA ligase family protein  25.42 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  21.79 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>