58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0779 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0779  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  229  9e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4584  hypothetical protein  52.21 
 
 		 160 aa  126  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2307  hypothetical protein  48.21 
 
 		 173 aa  120  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2176  hypothetical protein  40.34 
 
 		 181 aa  101  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2088  hypothetical protein  40.34 
 
 		 245 aa  100  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0353  hypothetical protein  43.97 
 
 		 175 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0072  hypothetical protein  42.24 
 
 		 137 aa  100  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237291  normal  0.464662 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3789  hypothetical protein  35.96 
 
 		 186 aa  99  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0735  hypothetical protein  39.5 
 
 		 190 aa  98.2  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3379  hypothetical protein  38.33 
 
 		 183 aa  96.3  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0615  hypothetical protein  43.97 
 
 		 174 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.190546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0427  protein of unknown function DUF1058  43.97 
 
 		 174 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3942  hypothetical protein  38.66 
 
 		 185 aa  95.9  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0218  hypothetical protein  43.97 
 
 		 174 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.0484329 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2971  hypothetical protein  38.39 
 
 		 204 aa  95.9  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0914  hypothetical protein  40.54 
 
 		 190 aa  95.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0044  hypothetical protein  41.38 
 
 		 185 aa  94.7  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0315  hypothetical protein  38.33 
 
 		 179 aa  94.4  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2312  hypothetical protein  38.74 
 
 		 191 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0986  hypothetical protein  38.74 
 
 		 203 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1942  hypothetical protein  42.34 
 
 		 200 aa  93.2  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398084  decreased coverage  0.00719314 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4125  hypothetical protein  40.52 
 
 		 183 aa  92.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4088  protein of unknown function DUF1058  36.67 
 
 		 179 aa  92  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4408  protein of unknown function DUF1058  36.67 
 
 		 179 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0036  hypothetical protein  39.66 
 
 		 176 aa  90.5  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3642  hypothetical protein  36.75 
 
 		 199 aa  90.5  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000544722 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2188  hypothetical protein  36.94 
 
 		 197 aa  90.5  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2170  hypothetical protein  40 
 
 		 177 aa  90.1  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.82966  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2486  protein of unknown function DUF1058  40.52 
 
 		 177 aa  89  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1100  hypothetical protein  38.33 
 
 		 239 aa  85.9  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00740954  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1176  hypothetical protein  37.5 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0379  protein of unknown function DUF1058  35.77 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403111  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2231  hypothetical protein  35.77 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.115294 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0479  hypothetical protein  34.82 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0510  hypothetical protein  34.48 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.833855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5059  hypothetical protein  38.94 
 
 		 182 aa  80.5  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1266  hypothetical protein  28.81 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0422  hypothetical protein  35.16 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.26681 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3061  hypothetical protein  36.04 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0455  protein of unknown function DUF1058  35.16 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0492  protein of unknown function DUF1058  34.38 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.216806 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2687  hypothetical protein  34.11 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5957  protein of unknown function DUF1058  31.67 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0475342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1540  protein of unknown function DUF1058  33.33 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2000  protein of unknown function DUF1058  45.76 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0346  hypothetical protein  28.57 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00234847  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3295  hypothetical protein  30.97 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1125  hypothetical protein  26.09 
 
 		 162 aa  52.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2403  hypothetical protein  31.25 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.482031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3400  protein of unknown function DUF1058  30.97 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2184  hypothetical protein  28.72 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1788  SH3 type 3 domain-containing protein  29.2 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.292681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  25 
 
 		 370 aa  45.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1934  SH3 type 3 domain protein  29.2 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.890926  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0614  hypothetical protein  28.57 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  22.73 
 
 		 418 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1988  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  23.13 
 
 		 420 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.1332199999999997e-59 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1787  NLP/P60 family protein  23.13 
 
 		 420 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>