130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0733 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0733  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
104 aa  221  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.579236  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2599  excinuclease ABC subunit C  58.59 
 
 
100 aa  123  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515816  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0814  excinuclease ABC subunit C  59.41 
 
 
111 aa  122  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.683613  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2878  excinuclease ABC subunit C  58.7 
 
 
95 aa  119  2e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00418139  hitchhiker  0.000396722 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2291  excinuclease ABC subunit C  56.52 
 
 
95 aa  118  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.361879  normal  0.317834 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2430  excinuclease ABC subunit C  59.79 
 
 
102 aa  116  1e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0651  excinuclease ABC subunit C  55.79 
 
 
115 aa  114  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0670127  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2524  excinuclease ABC subunit C  58.43 
 
 
100 aa  112  1e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1144  hypothetical protein  57.3 
 
 
97 aa  112  1e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0101  excinuclease ABC subunit C  58.7 
 
 
95 aa  111  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.873181  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2889  excinuclease ABC subunit C  59.78 
 
 
95 aa  108  2e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0492999  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3180  excinuclease ABC subunit C  56.47 
 
 
95 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734981  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4335  Excinuclease ABC C subunit domain protein  57.3 
 
 
95 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0231895  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3175  excinuclease ABC subunit C  55.29 
 
 
95 aa  108  4e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00936772  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0827  excinuclease ABC subunit C  54.26 
 
 
121 aa  107  7e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000437312 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4225  Excinuclease ABC C subunit domain protein  54.12 
 
 
95 aa  105  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0073463  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3101  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  53.26 
 
 
95 aa  105  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0003  excinuclease ABC subunit C  55.06 
 
 
95 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.164369  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4056  excinuclease ABC subunit C  56.98 
 
 
130 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366291  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0883  excinuclease ABC subunit C  50.54 
 
 
114 aa  105  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227593  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2226  excinuclease ABC subunit C  55.56 
 
 
119 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.163339  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0039  hypothetical protein  54.35 
 
 
97 aa  104  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0717  hypothetical protein  54.35 
 
 
97 aa  104  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1812  hypothetical protein  54.35 
 
 
97 aa  104  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1852  hypothetical protein  54.35 
 
 
97 aa  104  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1944  hypothetical protein  54.35 
 
 
97 aa  104  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2051  hypothetical protein  54.35 
 
 
97 aa  104  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2896  hypothetical protein  54.35 
 
 
97 aa  104  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0882  hypothetical protein  54.35 
 
 
97 aa  104  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2181  excinuclease ABC subunit C  54.44 
 
 
113 aa  104  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00892068  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2855  Excinuclease ABC C subunit domain protein  55.81 
 
 
96 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0675434  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2170  excinuclease ABC subunit C  51.65 
 
 
98 aa  104  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.013295  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0331  hypothetical protein  54.35 
 
 
97 aa  103  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0877  excinuclease ABC subunit C  52.13 
 
 
125 aa  103  9e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1975  excinuclease ABC subunit C  48.98 
 
 
118 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1409  excinuclease ABC subunit C  54.55 
 
 
95 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3124  Excinuclease ABC C subunit domain protein  54.65 
 
 
96 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80236  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1899  GIY-YIG catalytic domain-containing protein  51.69 
 
 
96 aa  102  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0285  excinuclease ABC subunit C  55.29 
 
 
95 aa  101  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722146  normal  0.992997 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0294  hypothetical cytosolic protein  51.69 
 
 
96 aa  102  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.479939  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1984  Excinuclease ABC C subunit domain protein  43.88 
 
 
100 aa  100  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569269  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2055  hypothetical protein  48.45 
 
 
96 aa  100  9e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0771  excinuclease ABC subunit C  51.11 
 
 
95 aa  100  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.959878 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3382  excinuclease ABC subunit C  50.59 
 
 
120 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114521  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1965  excinuclease ABC subunit C  52.81 
 
 
95 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.70444 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3151  excinuclease ABC subunit C  52.81 
 
 
96 aa  99.4  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0891506  normal  0.0226516 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2997  excinuclease ABC subunit C  49.45 
 
 
95 aa  98.2  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.867299  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5085  Excinuclease ABC C subunit domain protein  51.09 
 
 
95 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.88934 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1655  excinuclease ABC subunit C  57.14 
 
 
98 aa  98.2  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2352  excinuclease ABC subunit C  51.11 
 
 
110 aa  98.6  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.51382  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1266  excinuclease ABC subunit C  49.44 
 
 
109 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0720825  normal  0.107878 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0706  excinuclease ABC subunit C  50 
 
 
101 aa  97.1  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.200173  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1328  excinuclease ABC subunit C  51.11 
 
 
95 aa  97.1  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4684  excinuclease ABC subunit C  51.14 
 
 
99 aa  93.6  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2227  excinuclease ABC subunit C  39.58 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  4.08802e-05  hitchhiker  5.27007e-05 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0893  excinuclease ABC subunit C  47.19 
 
 
99 aa  92.8  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0841998  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4264  excinuclease ABC subunit C  44.44 
 
 
95 aa  91.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604611  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05230  hypothetical protein  46.07 
 
 
100 aa  90.9  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.610254  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2602  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40 
 
 
97 aa  90.9  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  8.20325e-08  normal  0.0436651 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0767  excinuclease ABC subunit C  48.86 
 
 
102 aa  90.1  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.464931  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0358  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  47.62 
 
 
96 aa  89  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1362  excinuclease ABC subunit C  46.67 
 
 
107 aa  88.6  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0916  excinuclease ABC subunit C  49.43 
 
 
95 aa  88.6  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2317  excinuclease ABC subunit C  42.71 
 
 
98 aa  88.2  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0365776  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2057  excinuclease ABC subunit C  50 
 
 
113 aa  87.4  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1053  excinuclease ABC, C subunit  45.88 
 
 
110 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.175656  normal  0.959304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7339  putative excinuclease ABC, C subunit  49.4 
 
 
101 aa  86.3  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3672  excinuclease ABC subunit C  47.73 
 
 
118 aa  84.7  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.246174  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2807  excinuclease ABC subunit C  47.73 
 
 
118 aa  84.7  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171123  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4673  excinuclease ABC subunit C  46.07 
 
 
95 aa  84.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0203068  normal  0.740164 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0957  excinuclease ABC subunit C  46.59 
 
 
118 aa  84  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00735212  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0895  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.66 
 
 
99 aa  79.3  2e-14  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00270858 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05250  endo/excinuclease amino terminal domain protein  43.68 
 
 
107 aa  75.5  2e-13  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05270  hypothetical protein  38.64 
 
 
100 aa  73.6  1e-12  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05260  endo/excinuclease amino terminal domain protein  39.29 
 
 
98 aa  71.6  4e-12  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.509703  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2914  excinuclease ABC subunit C  37.78 
 
 
101 aa  70.5  7e-12  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00677745  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4036  hypothetical protein  47.76 
 
 
79 aa  69.7  1e-11  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420287  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09001  hypothetical protein  41.43 
 
 
80 aa  60.5  7e-09  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1277  Excinuclease ABC C subunit domain protein  31.11 
 
 
96 aa  58.9  2e-08  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.129449  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3906  excinuclease ABC subunit C  45.9 
 
 
141 aa  58.2  4e-08  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647444  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01100  hypothetical protein  39.34 
 
 
67 aa  53.5  9e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1648  excinuclease ABC subunit C  35.48 
 
 
117 aa  52.8  1e-06  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.732413  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2428  hypothetical protein  40 
 
 
83 aa  52.8  2e-06  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2225  hypothetical protein  55.26 
 
 
116 aa  52  3e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.528424 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1038  hypothetical protein  37 
 
 
93 aa  51.2  5e-06  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258363  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1622  excinuclease ABC subunit C  59.46 
 
 
95 aa  50.1  1e-05  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.477285 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0838  type I restriction-modification system, R subunit  40 
 
 
1210 aa  48.5  3e-05  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00714  hypothetical protein  51.35 
 
 
37 aa  47.8  5e-05  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2245  excinuclease ABC subunit C  39.47 
 
 
108 aa  47.8  5e-05  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4762  excinuclease ABC subunit C  37.84 
 
 
95 aa  47.4  6e-05  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  1.28421e-08 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0981  excinuclease ABC subunit C  36.47 
 
 
137 aa  47.4  7e-05  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16466  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0376  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 
104 aa  47  9e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.604182  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4217  excinuclease ABC subunit C  35.21 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0140  Excinuclease ABC C subunit domain protein  35.21 
 
 
166 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2665  Excinuclease ABC C subunit domain protein  35 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0964299  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0115  excinuclease ABC subunit C  38.24 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1431  GIY-YIG domain-containing protein  31.87 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00206814  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2257  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36.62 
 
 
91 aa  46.2  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13970  predicted endonuclease containing a URI domain protein  30.61 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1435  excinuclease ABC subunit C  37.18 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>