40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0707 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0707  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  325  2.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.736244 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2793  hypothetical protein  48.1 
 
 		 162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.577158 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1438  hypothetical protein  46.04 
 
 		 165 aa  100  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0094  hypothetical protein  28.39 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156875  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0708  hypothetical protein  28.28 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1227  hypothetical protein  28.21 
 
 		 227 aa  67.8  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0152651 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0036  hypothetical protein  29.38 
 
 		 209 aa  67.4  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0242  hypothetical protein  28.57 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3627  hypothetical protein  25.66 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2314  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0402  hypothetical protein  26.28 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0268  hypothetical protein  26.24 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5961  hypothetical protein  26.45 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.796791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2807  hypothetical protein  23.03 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1383  hypothetical protein  24.85 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0051  hypothetical protein  24.85 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3015  hypothetical protein  25.31 
 
 		 182 aa  57  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0405  hypothetical protein  27.21 
 
 		 178 aa  57  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4048  hypothetical protein  25.49 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3373  hypothetical protein  30.67 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299059  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1101  hypothetical protein  25.77 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3314  hypothetical protein  24.39 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.467918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0077  hypothetical protein  27.22 
 
 		 204 aa  53.9  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0080  hypothetical protein  28.29 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44123  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3069  putative signal peptide protein  23.31 
 
 		 167 aa  52.4  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0091  hypothetical protein  25.32 
 
 		 167 aa  51.6  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1381  hypothetical protein  25 
 
 		 190 aa  51.2  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0267  hypothetical protein  22.7 
 
 		 175 aa  51.2  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1364  hypothetical protein  25 
 
 		 169 aa  51.2  0.000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.743667  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3484  hypothetical protein  23.65 
 
 		 227 aa  50.8  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.509717 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4170  hypothetical protein  25 
 
 		 169 aa  50.8  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107472  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3725  hypothetical protein  26.14 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3491  hypothetical protein  27.39 
 
 		 225 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.135183 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0042  hypothetical protein  23.91 
 
 		 176 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1697  putative signal peptide protein  23.49 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3614  hypothetical protein  26.75 
 
 		 227 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3291  hypothetical protein  26.75 
 
 		 227 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5420  putative signal peptide protein  28.39 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0854015 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2504  hypothetical protein  27.04 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.941504  normal  0.567566 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3345  hypothetical protein  23.08 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0027  hypothetical protein  30.25 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>