More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0649 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0649  Pirin-like protein  100 
 
 
294 aa  601  1.0000000000000001e-171  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2913  Pirin-like  68.71 
 
 
296 aa  422  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0561  Pirin domain protein  55.99 
 
 
305 aa  326  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2143  pirin domain-containing protein  55.48 
 
 
305 aa  324  1e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0009  Pirin-like  55.63 
 
 
306 aa  324  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00543202  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0703  Pirin-like protein  56.45 
 
 
305 aa  322  3e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0219  pirin  55.63 
 
 
306 aa  322  4e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0149  Pirin-like  56.1 
 
 
305 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0566  Pirin domain protein  53.68 
 
 
307 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.660641  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0608  Pirin domain protein  54.04 
 
 
307 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.228088 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0019  putative Pirin family protein  55.63 
 
 
305 aa  317  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0734  Pirin-like  53.36 
 
 
306 aa  315  5e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0435  pirin-related protein  52.82 
 
 
290 aa  311  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0346  Pirin-like  53.87 
 
 
305 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0128  Pirin domain protein  52.58 
 
 
312 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.266704 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0185  pirin domain-containing protein  52.58 
 
 
312 aa  309  4e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0493  pirin domain-containing protein  51.94 
 
 
307 aa  308  5.9999999999999995e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4855  pirin domain-containing protein  52.58 
 
 
312 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0546  pirin domain-containing protein  52.82 
 
 
306 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266378  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0286  pirin-related protein  52.11 
 
 
306 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1965  pirin domain-containing protein  52.8 
 
 
309 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0444426  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3573  Pirin domain protein  53.47 
 
 
307 aa  302  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3641  Pirin domain protein  52.78 
 
 
307 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1889  Pirin-like  48.28 
 
 
313 aa  298  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2983  Pirin domain protein  52.1 
 
 
287 aa  294  1e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.373808  normal  0.0595027 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3489  Pirin-like  53.68 
 
 
307 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0364  pirin domain-containing protein  50.18 
 
 
318 aa  291  6e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04763  pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  49.66 
 
 
296 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2513  Pirin-like  50.35 
 
 
311 aa  285  4e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4923  Pirin domain protein  49.65 
 
 
310 aa  285  8e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.695284  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3510  pirin domain-containing protein  47.75 
 
 
314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2372  pirin domain-containing protein  48.1 
 
 
311 aa  283  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178763  normal  0.995053 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0517  pirin domain-containing protein  51.24 
 
 
293 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.858026 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0326  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  51.94 
 
 
291 aa  279  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0377  putative pirin-like protein  50.71 
 
 
289 aa  279  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3218  Pirin domain protein  50.53 
 
 
291 aa  279  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1954  Pirin-like  50.53 
 
 
293 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0828005  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2565  pirin domain-containing protein  50.53 
 
 
293 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2589  pirin domain-containing protein  50.53 
 
 
293 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437288  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2092  Pirin domain protein  46.88 
 
 
311 aa  278  9e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0731  pirin domain-containing protein  51.24 
 
 
293 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2613  pirin domain-containing protein  50.71 
 
 
293 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1805  Pirin domain protein  50.18 
 
 
296 aa  276  3e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.5163  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2484  pirin domain-containing protein  50.18 
 
 
293 aa  275  6e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0887266 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0720  hypothetical protein  50.53 
 
 
340 aa  275  9e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00526543  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5897  Pirin-like protein  50.18 
 
 
293 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.867942  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3781  Pirin-like  48.43 
 
 
294 aa  271  8.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.871122 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0744  hypothetical protein  49.12 
 
 
291 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.738482  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0640  pirin-related protein  49.29 
 
 
291 aa  271  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.524638  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2089  Pirin domain protein  48.58 
 
 
304 aa  270  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1817  pirin-like protein  47.06 
 
 
312 aa  270  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.123159  normal  0.257408 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3120  Pirin domain protein  48.81 
 
 
307 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.680161  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0252  Pirin domain protein  48.23 
 
 
289 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.175941 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0273  Pirin-like protein  48.94 
 
 
291 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.355193 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0904  pirin domain-containing protein  51.24 
 
 
293 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0233  Pirin domain protein  47.52 
 
 
289 aa  264  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0362  hypothetical protein  51.24 
 
 
293 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0654105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0907  pirin domain-containing protein  51.24 
 
 
293 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2498  hypothetical protein  51.24 
 
 
293 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.149095  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0111  hypothetical protein  51.24 
 
 
293 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.335192  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0662  hypothetical protein  51.24 
 
 
293 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.276579  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1918  pirin domain-containing protein  48.58 
 
 
297 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.883605 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5228  pirin domain-containing protein  46.5 
 
 
298 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739076  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4532  Pirin-like protein  48.41 
 
 
294 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1266  pirin domain-containing protein  48.58 
 
 
294 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0818  pirin domain-containing protein  48.93 
 
 
296 aa  259  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1367  pirin domain-containing protein  47.87 
 
 
293 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0431465 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2897  Pirin-like  47.4 
 
 
294 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1102  pirin domain-containing protein  49.82 
 
 
274 aa  257  1e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.596816  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1300  pirin domain-containing protein  47.87 
 
 
294 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.0576323 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0907  Pirin-like  47.87 
 
 
293 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1389  pirin domain-containing protein  47.87 
 
 
293 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.614726  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1634  pirin domain-containing protein  47.4 
 
 
310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1596  Pirin domain protein  46.72 
 
 
301 aa  246  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2928  pirin domain-containing protein  46.45 
 
 
304 aa  245  6.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2278  pirin domain-containing protein  46.35 
 
 
301 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263885  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1666  pirin-related protein  42.25 
 
 
290 aa  243  3e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0486523  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4570  pirin domain-containing protein  48.2 
 
 
296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203406  normal  0.316672 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2116  pirin domain-containing protein  44.37 
 
 
297 aa  238  6.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0157857  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3490  pirin domain-containing protein  41.9 
 
 
293 aa  233  4.0000000000000004e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.970505  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3027  pirin domain-containing protein  47.35 
 
 
316 aa  232  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.319772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2359  Pirin domain protein  43.94 
 
 
306 aa  231  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.355023 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0588  putative pirin-like protein  46.6 
 
 
299 aa  224  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.927348  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5556  Pirin domain protein  43.01 
 
 
304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.856561 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3696  Pirin domain protein  39.93 
 
 
300 aa  217  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.01108  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2485  pirin domain-containing protein  38.27 
 
 
286 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.110651 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1627  Pirin-like  39.52 
 
 
296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0199876 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0508  Pirin domain protein  41.88 
 
 
329 aa  211  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2988  Pirin-related protein  45.1 
 
 
254 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0421  pirin domain-containing protein  43.73 
 
 
298 aa  206  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3500  pirin domain-containing protein  38.46 
 
 
287 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.324071  normal  0.945982 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0100  Pirin domain protein  40.66 
 
 
335 aa  202  4e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3748  pirin domain-containing protein  37.82 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4177  Pirin domain protein  39.05 
 
 
293 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.630171  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1691  pirin domain-containing protein  38.32 
 
 
287 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0748863  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0663  pirin domain-containing protein  40.66 
 
 
351 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35540  Pirin-related protein  40.57 
 
 
381 aa  193  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5391  pirin domain-containing protein  41.76 
 
 
317 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5681  pirin domain-containing protein  41.76 
 
 
317 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5302  Pirin-like protein  41.76 
 
 
317 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.178895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>