More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0564 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0564  50S ribosomal protein L17  100 
 
 
139 aa  282  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684509  normal  0.93978 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1325  50S ribosomal protein L17  77.7 
 
 
140 aa  227  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.355864 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  73.72 
 
 
141 aa  208  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  71.43 
 
 
138 aa  191  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  68.89 
 
 
137 aa  185  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  70.77 
 
 
138 aa  184  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  66.42 
 
 
137 aa  182  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  63.31 
 
 
139 aa  182  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  67.91 
 
 
136 aa  181  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  65.47 
 
 
139 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  70.31 
 
 
135 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  68.99 
 
 
138 aa  177  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  65.89 
 
 
141 aa  173  8e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  65.89 
 
 
146 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  63.57 
 
 
140 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  62.14 
 
 
140 aa  170  5e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  60.74 
 
 
138 aa  169  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  59.71 
 
 
140 aa  166  7e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  66.13 
 
 
141 aa  166  8e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  65.6 
 
 
142 aa  166  8e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  65.6 
 
 
142 aa  166  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  65.6 
 
 
142 aa  166  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  60.43 
 
 
141 aa  166  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  58.99 
 
 
142 aa  165  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  65.32 
 
 
140 aa  164  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2190  50S ribosomal protein L17  61.24 
 
 
136 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.407841  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  62.9 
 
 
141 aa  162  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  62.9 
 
 
141 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  65.32 
 
 
140 aa  161  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  65.32 
 
 
138 aa  161  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2453  50S ribosomal protein L17  57.14 
 
 
138 aa  161  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0612359  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  57.14 
 
 
138 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2175  50S ribosomal protein L17  56.39 
 
 
138 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.283997 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  63.71 
 
 
140 aa  160  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  63.71 
 
 
138 aa  160  7e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  64.52 
 
 
143 aa  159  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  61.29 
 
 
140 aa  158  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2509  50S ribosomal protein L17  57.55 
 
 
139 aa  156  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.745035  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  56.12 
 
 
139 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  56.12 
 
 
139 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  62.1 
 
 
140 aa  152  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0745  50S ribosomal protein L17  60.83 
 
 
132 aa  149  8.999999999999999e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3142  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 
131 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2604  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 
131 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0276  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 
131 aa  148  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0461081 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3749  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 
131 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648028  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  61.02 
 
 
128 aa  148  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3041  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 
131 aa  148  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490666  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1951  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 
131 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3505  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 
131 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3777  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 
131 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3719  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 
131 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0303  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 
131 aa  147  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  0.0244082 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3474  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 
131 aa  147  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2732  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 
131 aa  147  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0354  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 
131 aa  147  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.341272 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0294  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 
131 aa  147  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0375  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 
131 aa  147  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  57.94 
 
 
131 aa  147  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  57.94 
 
 
131 aa  147  5e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  57.94 
 
 
131 aa  146  8e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4030  50S ribosomal protein L17  57.94 
 
 
131 aa  146  8e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544073  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  57.94 
 
 
131 aa  146  8e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0225  50S ribosomal protein L17  57.94 
 
 
131 aa  146  8e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00200452  normal  0.0638706 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1828  50S ribosomal protein L17  56.35 
 
 
126 aa  146  9e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.872331  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0363  50S ribosomal protein L17  56.35 
 
 
126 aa  146  9e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  54.01 
 
 
132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2812  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 
131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0476754  normal  0.443503 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  54.01 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  59.32 
 
 
130 aa  144  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3311  50S ribosomal protein L17  58.47 
 
 
132 aa  144  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.666345  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  57.85 
 
 
130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0627  50S ribosomal protein L17  58.33 
 
 
134 aa  144  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  57.85 
 
 
130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04495  50S ribosomal protein L17  59.35 
 
 
127 aa  144  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0341  50S ribosomal protein L17  59.32 
 
 
130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0245552 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3617  50S ribosomal protein L17  59.32 
 
 
130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201184  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0225  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 
131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000697417  unclonable  0.0000000000243576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0220  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 
131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0225  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 
131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0682368  unclonable  0.0000000000471873 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  55.04 
 
 
175 aa  143  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0239  50S ribosomal protein L17  58.47 
 
 
131 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00616795  unclonable  0.00000909756 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0781  50S ribosomal protein L17  56.45 
 
 
127 aa  143  7.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478066  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  59.32 
 
 
130 aa  143  9e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  58.82 
 
 
128 aa  143  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  57.26 
 
 
127 aa  143  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  59.32 
 
 
129 aa  143  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 
132 aa  142  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  57.26 
 
 
127 aa  143  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  57.5 
 
 
126 aa  142  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  59.32 
 
 
129 aa  143  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3498  ribosomal protein L17  56.35 
 
 
126 aa  142  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110108  hitchhiker  0.0000306031 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0985  50S ribosomal protein L17P  51.85 
 
 
132 aa  142  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200364  hitchhiker  0.00397846 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  58.82 
 
 
127 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  57.26 
 
 
127 aa  143  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  57.26 
 
 
127 aa  143  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  59.32 
 
 
129 aa  143  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  57.26 
 
 
127 aa  143  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2615  ribosomal protein L17  56.35 
 
 
126 aa  142  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.718134  normal  0.325344 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  59.32 
 
 
129 aa  143  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>