95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0537 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0537  AbgT putative transporter  100 
 
 		 529 aa  1036    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.121882  normal  0.78057 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1352  AbgT putative transporter  49.51 
 
 		 519 aa  458  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000127247  normal  0.0238452 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0739  putative ion transporter  42.99 
 
 		 519 aa  409  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01141  hypothetical protein  43.11 
 
 		 519 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0389  hypothetical protein  43.45 
 
 		 519 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3120  AbgT putative transporter  43.81 
 
 		 520 aa  403  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3673  AbgT putative transporter  45.63 
 
 		 518 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004283  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter  42.37 
 
 		 519 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3449  transporter  44.25 
 
 		 512 aa  395  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3423  transporter  44.66 
 
 		 515 aa  391  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.898769 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1944  AbgT putative transporter  45.65 
 
 		 519 aa  388  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432903  decreased coverage  0.00626673 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0147  AbgT putative transporter  44.47 
 
 		 519 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0064  AbgT putative transporter  44.73 
 
 		 518 aa  386  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000877421  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0160  transporter, putative  43.18 
 
 		 519 aa  382  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2328  efflux pump component MtrF  44.02 
 
 		 516 aa  384  1e-105  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.25696  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0151  AbgT putative transporter  44.02 
 
 		 519 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0146  AbgT putative transporter  44.02 
 
 		 519 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0146  AbgT putative transporter  44.02 
 
 		 519 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3559  putative efflux pump component MtrF  43.15 
 
 		 535 aa  366  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3654  AbgT putative transporter  42.94 
 
 		 537 aa  360  3e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4208  AbgT putative transporter  43.42 
 
 		 540 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4381  AbgT putative transporter  43.42 
 
 		 540 aa  359  8e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4247  AbgT putative transporter  44.31 
 
 		 540 aa  358  9e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4058  AbgT putative transporter  42.7 
 
 		 539 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000746135  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4042  AbgT putative transporter  44.27 
 
 		 535 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3926  AbgT putative transporter  44.08 
 
 		 535 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0028  AbgT putative transporter  44.03 
 
 		 512 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.790153  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3833  AbgT putative transporter  43.53 
 
 		 535 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4057  AbgT putative transporter  44.05 
 
 		 539 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.106368  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2198  AbgT putative transporter  43.75 
 
 		 534 aa  352  7e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0156  AbgT putative transporter  42.72 
 
 		 538 aa  352  8e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.632237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0134  AbgT putative transporter  41.98 
 
 		 538 aa  351  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.722786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0094  AbgT putative transporter  44.12 
 
 		 511 aa  351  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0404  hypothetical protein  43.45 
 
 		 534 aa  349  8e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000189157  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3988  AbgT putative transporter  42.45 
 
 		 532 aa  343  5e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.025023  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002729  multidrug efflux pump component MtrF  42.18 
 
 		 528 aa  342  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.189489  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00653  putative p-aminobenzoyl-glutamate transport protein (AbgT family)  43.84 
 
 		 525 aa  340  5e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1388  putative ion transporter  43.31 
 
 		 530 aa  336  5.999999999999999e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.158074  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03248  hypothetical protein  44.42 
 
 		 522 aa  333  3e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0167  AbgT putative transporter  35.56 
 
 		 520 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.583779  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0029  AbgT putative transporter  40.5 
 
 		 506 aa  319  7.999999999999999e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13432  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2550  AbgT putative transporter  36.05 
 
 		 512 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2500  AbgT putative transporter  36.05 
 
 		 512 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.393167  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5237  AbgT putative transporter  38.03 
 
 		 514 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0018  AbgT putative transporter  34.84 
 
 		 511 aa  313  4.999999999999999e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0748  AbgT putative transporter  35.67 
 
 		 518 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0678  AbgT family protein  35.48 
 
 		 518 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01313  predicted cryptic aminobenzoyl-glutamate transporter  36.15 
 
 		 508 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1452  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  36.15 
 
 		 508 aa  293  4e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01323  hypothetical protein  36.15 
 
 		 508 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0800  putative efflux pump component MtrF  34.64 
 
 		 509 aa  293  5e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2308  AbgT transporter family  36.09 
 
 		 508 aa  292  8e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950001  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1548  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  36.09 
 
 		 508 aa  292  9e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2289  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  36.09 
 
 		 508 aa  292  9e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1983  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  36.09 
 
 		 510 aa  292  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328307 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1786  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  35.9 
 
 		 510 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21460  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter  35.66 
 
 		 585 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0400  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  33.72 
 
 		 505 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.703061  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0518  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  33.72 
 
 		 507 aa  273  6e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4202  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  32.37 
 
 		 508 aa  265  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.609868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2611  AbgT putative transporter  35.43 
 
 		 552 aa  247  4e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1508  AbgT putative transporter  34.36 
 
 		 523 aa  244  3e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1579  aminobenzoyl-glutamate transport protein  37.94 
 
 		 305 aa  171  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1577  putative efflux pump component MtrF  35.14 
 
 		 263 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01760  hypothetical protein  23.97 
 
 		 500 aa  58.2  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1143  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  22.86 
 
 		 484 aa  50.8  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.171784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1891  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  44.64 
 
 		 464 aa  48.5  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0199  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  36.92 
 
 		 505 aa  47.8  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2374  hypothetical protein  35.71 
 
 		 492 aa  46.6  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1005  hypothetical protein  35.38 
 
 		 502 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0766  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  27.66 
 
 		 477 aa  45.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.607983  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1496  hypothetical protein  35.71 
 
 		 522 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1563  hypothetical protein  35.71 
 
 		 522 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.150626 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1557  hypothetical protein  35.71 
 
 		 522 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.750418  normal  0.28282 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1502  hypothetical protein  33.93 
 
 		 520 aa  45.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.342277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2386  hypothetical protein  33.33 
 
 		 509 aa  45.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.416992  normal  0.0308106 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02223  predicted inner membrane protein  39.29 
 
 		 506 aa  44.7  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000247482  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02183  hypothetical protein  39.29 
 
 		 506 aa  44.7  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000257833  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1358  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  39.29 
 
 		 492 aa  44.7  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126812  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2480  hypothetical protein  39.29 
 
 		 506 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.434803  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2568  hypothetical protein  39.29 
 
 		 506 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.801671 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2580  hypothetical protein  39.29 
 
 		 506 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2525  hypothetical protein  39.29 
 
 		 506 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.449872 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2674  hypothetical protein  39.29 
 
 		 513 aa  44.7  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000012139  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1354  hypothetical protein  39.29 
 
 		 492 aa  44.7  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000651661  normal  0.856488 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1678  hypothetical protein  29 
 
 		 514 aa  44.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113687  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2454  hypothetical protein  39.29 
 
 		 513 aa  44.7  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2448  hypothetical protein  39.29 
 
 		 513 aa  44.7  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000669935  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2592  hypothetical protein  39.29 
 
 		 513 aa  44.7  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000045044  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1715  hypothetical protein  33.93 
 
 		 513 aa  44.7  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000685021 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3438  hypothetical protein  39.29 
 
 		 513 aa  44.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2688  hypothetical protein  39.29 
 
 		 506 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.831014 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4261  C4-dicarboxylate anaerobic carrier-like protein  37.04 
 
 		 460 aa  43.5  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3467  hypothetical protein  22.6 
 
 		 240 aa  43.5  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0456304 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0815  hypothetical protein  27.33 
 
 		 462 aa  43.5  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000488544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>