More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0514 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  100 
 
 		 337 aa  684    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  75.67 
 
 		 341 aa  511  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1353  farnesyltranstransferase  73 
 
 		 337 aa  477  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.350614  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  58.2 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  56.67 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  57.49 
 
 		 336 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  58.64 
 
 		 335 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  55.82 
 
 		 336 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  57.89 
 
 		 336 aa  377  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  56.06 
 
 		 336 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  57.59 
 
 		 336 aa  376  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1115  Polyprenyl synthetase  56.57 
 
 		 337 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2950  farnesyltranstransferase  60.19 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530131  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  55.76 
 
 		 340 aa  366  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  57.72 
 
 		 340 aa  365  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  57.41 
 
 		 340 aa  364  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  55.45 
 
 		 356 aa  363  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  53.89 
 
 		 338 aa  362  3e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  57.1 
 
 		 351 aa  362  4e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2749  polyprenyl synthetase  57.32 
 
 		 345 aa  362  6e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0535555  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  55.45 
 
 		 328 aa  359  3e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4378  Polyprenyl synthetase  56.71 
 
 		 345 aa  358  5e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.399439  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  58.28 
 
 		 358 aa  358  6e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0383  polyprenyl synthetase  52.65 
 
 		 338 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.398476  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0855  polyprenyl synthetase  56.25 
 
 		 336 aa  355  3.9999999999999996e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0722  polyprenyl synthetase  56.23 
 
 		 339 aa  352  5e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  53.85 
 
 		 339 aa  349  3e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0567  Farnesyltranstransferase  56.39 
 
 		 338 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0523  Polyprenyl synthetase  55.76 
 
 		 338 aa  346  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.057969  normal  0.393199 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  56.13 
 
 		 344 aa  345  8e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0458  polyprenyl synthetase  54.52 
 
 		 338 aa  342  5.999999999999999e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.480075 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0943  octaprenyl-diphosphate synthase  54.52 
 
 		 338 aa  333  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.560813  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  52.5 
 
 		 322 aa  306  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  55.87 
 
 		 334 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2184  trans-hexaprenyltranstransferase  50.77 
 
 		 340 aa  305  1.0000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  50 
 
 		 335 aa  299  4e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  49.84 
 
 		 322 aa  298  9e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  49.39 
 
 		 333 aa  297  1e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  49.36 
 
 		 336 aa  296  5e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  46.25 
 
 		 331 aa  293  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  49.68 
 
 		 333 aa  292  5e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  49.68 
 
 		 333 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  49.68 
 
 		 333 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  45.09 
 
 		 326 aa  285  8e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  47.24 
 
 		 345 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  47.94 
 
 		 322 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  44.14 
 
 		 327 aa  280  3e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  46.44 
 
 		 323 aa  279  4e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  46.44 
 
 		 333 aa  278  7e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  47.62 
 
 		 322 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3107  polyprenyl synthetase  52.81 
 
 		 325 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  47.3 
 
 		 322 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  47.3 
 
 		 322 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  47.3 
 
 		 322 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  51.61 
 
 		 327 aa  275  8e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  47.04 
 
 		 323 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  54.26 
 
 		 323 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  45.51 
 
 		 323 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  45.37 
 
 		 323 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  46.2 
 
 		 322 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  44.58 
 
 		 323 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2959  trans-hexaprenyltranstransferase  51.84 
 
 		 325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367555  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  47.3 
 
 		 322 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  47.62 
 
 		 322 aa  273  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  45.96 
 
 		 323 aa  273  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  45.65 
 
 		 320 aa  273  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  42.5 
 
 		 322 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  45.89 
 
 		 322 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  45.06 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2517  Polyprenyl synthetase  47.08 
 
 		 322 aa  270  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2899  octaprenyl-diphosphate synthase  47.08 
 
 		 322 aa  270  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  52.69 
 
 		 327 aa  269  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  42.19 
 
 		 322 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  53.7 
 
 		 322 aa  268  7e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  44.89 
 
 		 331 aa  268  8e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  44.89 
 
 		 331 aa  268  8e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  44.89 
 
 		 331 aa  268  8e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  44.34 
 
 		 348 aa  268  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3739  trans-hexaprenyltranstransferase  44.55 
 
 		 323 aa  268  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000225438  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  44.89 
 
 		 331 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  45.57 
 
 		 322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0833  trans-hexaprenyltranstransferase  46.89 
 
 		 322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  51.16 
 
 		 323 aa  266  5e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  44.3 
 
 		 323 aa  266  5e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3068  Polyprenyl synthetase  51.31 
 
 		 325 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  43.67 
 
 		 323 aa  265  8.999999999999999e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  50.39 
 
 		 323 aa  264  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  42.72 
 
 		 322 aa  264  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3973  octaprenyl diphosphate synthase  48.84 
 
 		 323 aa  265  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3758  octaprenyl diphosphate synthase  48.84 
 
 		 323 aa  264  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000253501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3613  octaprenyl diphosphate synthase  48.84 
 
 		 323 aa  264  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000738852  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  51.09 
 
 		 322 aa  263  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  48.42 
 
 		 322 aa  263  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  47.84 
 
 		 337 aa  263  3e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  46.82 
 
 		 313 aa  263  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  45.71 
 
 		 323 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  50.74 
 
 		 359 aa  261  8.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  43.99 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  42.72 
 
 		 322 aa  260  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  40.94 
 
 		 322 aa  259  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>