More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0454 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0454  MATE efflux family protein  100 
 
 
477 aa  929    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1935  MATE efflux family protein  53.79 
 
 
460 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.18016  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3141  MATE efflux family protein  52.15 
 
 
472 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1709  MATE efflux family protein  53.77 
 
 
470 aa  434  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1298  MATE efflux family protein  52.31 
 
 
467 aa  418  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0339  multidrug resistance protein NorM, putative  46.57 
 
 
471 aa  412  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  46.57 
 
 
471 aa  412  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  47.07 
 
 
470 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2521  multi anti extrusion protein MatE  50.53 
 
 
490 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.200402 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0697  multi anti extrusion protein MatE  49.66 
 
 
468 aa  396  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.596572  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0643  MATE efflux family protein  43.14 
 
 
477 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0664  MATE efflux family protein  43.36 
 
 
472 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.253686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0676  MATE efflux family protein  43.36 
 
 
472 aa  302  9e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.441843  normal  0.0136882 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  39.6 
 
 
460 aa  301  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0033  MATE efflux family protein  43.18 
 
 
463 aa  298  1e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  40.38 
 
 
467 aa  280  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  38.27 
 
 
458 aa  272  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  37.44 
 
 
465 aa  266  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  38.8 
 
 
451 aa  263  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4308  MATE efflux family protein  39.7 
 
 
470 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  38.58 
 
 
451 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  39.07 
 
 
456 aa  261  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  37.93 
 
 
453 aa  256  7e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  37.69 
 
 
474 aa  256  8e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2967  MATE efflux family protein  37.25 
 
 
467 aa  252  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0284207 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  35.91 
 
 
472 aa  247  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  37.44 
 
 
470 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1146  MATE efflux family protein  37.45 
 
 
469 aa  247  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.890459  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2708  MATE efflux family protein  37.34 
 
 
467 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0014  putative multidrug resistance protein norM  37.39 
 
 
460 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1699  MATE efflux family protein  36.82 
 
 
462 aa  236  9e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.4571  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0255  multidrug efflux protein NorA  35.12 
 
 
461 aa  229  9e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  32.4 
 
 
457 aa  227  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  32.4 
 
 
457 aa  226  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  32.4 
 
 
457 aa  226  6e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5517  multidrug efflux protein NorA  35.42 
 
 
464 aa  226  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0797  MATE efflux family protein  34.71 
 
 
463 aa  226  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.158372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5314  multidrug efflux protein NorA  36.57 
 
 
462 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.133881 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1050  MATE efflux family protein  34.5 
 
 
462 aa  223  8e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0612  MATE efflux family protein  34.5 
 
 
462 aa  223  8e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1091  MATE efflux family protein  34.5 
 
 
462 aa  223  8e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427191  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  34.35 
 
 
468 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  34.35 
 
 
468 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  34.35 
 
 
468 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  34.35 
 
 
468 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  34.57 
 
 
464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  34.35 
 
 
468 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  32.18 
 
 
457 aa  221  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  34.35 
 
 
468 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  34.35 
 
 
468 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  30.18 
 
 
460 aa  220  3.9999999999999997e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  34.06 
 
 
462 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2212  MATE efflux family protein  34.5 
 
 
462 aa  219  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520618  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1041  multi anti extrusion protein MatE  34.35 
 
 
470 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  33.84 
 
 
462 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2943  MATE efflux family protein  33.85 
 
 
470 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223425  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4204  multi anti extrusion protein MatE  34.06 
 
 
462 aa  217  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0638116  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6069  multidrug efflux protein NorA  35.35 
 
 
462 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  30.5 
 
 
457 aa  216  5.9999999999999996e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  32.46 
 
 
457 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  30.65 
 
 
451 aa  211  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5262  multidrug efflux protein NorA  35.57 
 
 
462 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00407645  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6519  MATE efflux family protein  34.22 
 
 
466 aa  211  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  28.47 
 
 
460 aa  209  7e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1743  multidrug efflux protein  32.61 
 
 
457 aa  208  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000609014  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1966  multidrug efflux protein  32.61 
 
 
457 aa  208  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000267108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  29.28 
 
 
450 aa  209  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2376  multidrug efflux protein  32.61 
 
 
457 aa  209  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  0.0171948 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01634  multidrug efflux protein NorM  32.61 
 
 
457 aa  208  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1977  MATE efflux family protein  32.61 
 
 
457 aa  208  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000001739  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01624  hypothetical protein  32.61 
 
 
457 aa  208  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1534  multidrug efflux protein  32.61 
 
 
457 aa  208  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00445038  hitchhiker  0.00117159 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  32.18 
 
 
457 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1861  multidrug efflux protein  32.82 
 
 
457 aa  207  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000216071  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  32.18 
 
 
457 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1877  multidrug efflux protein  32.82 
 
 
457 aa  207  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154294  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  32.18 
 
 
457 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  32.18 
 
 
457 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  31.51 
 
 
466 aa  207  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0208  multidrug efflux protein NorA  35.4 
 
 
462 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0521775 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1535  multidrug efflux protein  32.18 
 
 
457 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5172  multidrug efflux protein NorA  35.57 
 
 
462 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0811  multidrug efflux protein  30.79 
 
 
425 aa  204  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  34.6 
 
 
457 aa  204  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  30.52 
 
 
458 aa  203  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02164  multidrug efflux protein NorA  30 
 
 
457 aa  202  8e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69890  multidrug efflux protein NorA  35.81 
 
 
488 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  30.35 
 
 
456 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  28.44 
 
 
454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  30.57 
 
 
462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  28.1 
 
 
454 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  29.6 
 
 
461 aa  199  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  27.29 
 
 
452 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0162  MATE efflux family protein  35.36 
 
 
486 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  27.88 
 
 
453 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  27.88 
 
 
453 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  27.88 
 
 
453 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  30.46 
 
 
457 aa  196  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  27.88 
 
 
453 aa  195  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2915  multidrug resistance protein NorM  29.54 
 
 
472 aa  194  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>