288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0365 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0365  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  100 
 
 		 236 aa  474  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.393782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2912  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  60.7 
 
 		 239 aa  274  8e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0784034  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0699  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  56.62 
 
 		 238 aa  255  4e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3160  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.13 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2972  FMN-dependent NADH-azoreductase  40.18 
 
 		 219 aa  185  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0140  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  42.72 
 
 		 229 aa  175  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.294363 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0135  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.93 
 
 		 229 aa  174  9e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5707  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.32 
 
 		 221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333359  normal  0.171433 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0330  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  47.12 
 
 		 222 aa  168  6e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.234975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3715  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.2 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.336776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1165  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.79 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.62 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.94 
 
 		 199 aa  122  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  37.74 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.74 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.81 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54120  acyl carrier protein phosphodiesterase  38.5 
 
 		 212 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.22 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.95 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4734  acyl carrier protein phosphodiesterase  38.14 
 
 		 212 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.22 
 
 		 199 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2586  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  35.87 
 
 		 202 aa  115  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2757  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.25 
 
 		 205 aa  115  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0569  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  38.1 
 
 		 212 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0973  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.1 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.83 
 
 		 202 aa  111  8.000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.38 
 
 		 199 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0560  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.99 
 
 		 199 aa  108  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.737585  normal  0.291215 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2600  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.09 
 
 		 193 aa  108  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466922 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0768  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48 
 
 		 197 aa  106  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1391  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  31.94 
 
 		 199 aa  105  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000126863  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2002  azoreductase  35.81 
 
 		 202 aa  105  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0549421  hitchhiker  0.00845677 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2242  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.48 
 
 		 202 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.679145  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  35.19 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.735887  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3545  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.73 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114749  normal  0.056833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.83 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.23 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2340  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  35.23 
 
 		 216 aa  101  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.42 
 
 		 213 aa  101  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2606  azoreductase  31.6 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  33.97 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0809  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.5 
 
 		 203 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0306  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.1 
 
 		 209 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1117  acyl carrier protein phosphodiesterase  37.5 
 
 		 216 aa  99  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0956  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.63 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3334  azoreductase  34 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7380  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  38.22 
 
 		 201 aa  96.3  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.729471  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5629  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  38.22 
 
 		 201 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254854  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5994  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  38.22 
 
 		 201 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2020  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.57 
 
 		 204 aa  96.3  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.818794  normal  0.0710371 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2008  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.68 
 
 		 207 aa  95.5  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0447  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.56 
 
 		 204 aa  95.5  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3136  acyl carrier protein phosphodiesterase  30.56 
 
 		 202 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00683712  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2721  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.04 
 
 		 207 aa  94.7  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6319  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  34.42 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1510  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.42 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2823  azoreductase  35.79 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2993  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.26 
 
 		 209 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0290  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.02 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  31.44 
 
 		 201 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6637  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.1 
 
 		 205 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  31.44 
 
 		 201 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0629  phosphodiesterase  33.16 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.936388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  30.96 
 
 		 216 aa  93.2  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5486  (acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  34.3 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125211  normal  0.0147175 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39150  azoreductase  33.5 
 
 		 202 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.63427 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2866  azoreductase  35.79 
 
 		 203 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  32.47 
 
 		 201 aa  92.8  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6977  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.8 
 
 		 232 aa  92  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.181863  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.44 
 
 		 201 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  31.44 
 
 		 201 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1679  FMN-dependent NADH-azoreductase  32.98 
 
 		 192 aa  91.3  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  31.44 
 
 		 201 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2915  azoreductase  35.11 
 
 		 203 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.03 
 
 		 214 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  31.44 
 
 		 201 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  33.03 
 
 		 214 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4469  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.16 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  31.44 
 
 		 201 aa  90.9  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.21 
 
 		 198 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.26 
 
 		 198 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3238  hypothetical protein  32.99 
 
 		 196 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  31.44 
 
 		 201 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0760  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  43.2 
 
 		 191 aa  90.1  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  31.34 
 
 		 217 aa  90.1  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  30.93 
 
 		 201 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3003  azoreductase  31.16 
 
 		 202 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.85 
 
 		 198 aa  89  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  33.17 
 
 		 201 aa  88.6  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  33.52 
 
 		 201 aa  88.6  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  33.52 
 
 		 201 aa  88.6  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  31.63 
 
 		 201 aa  88.6  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  33.52 
 
 		 201 aa  88.6  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.38 
 
 		 198 aa  88.6  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.38 
 
 		 198 aa  88.6  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  35.38 
 
 		 198 aa  88.6  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2649  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.87 
 
 		 201 aa  88.2  9e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.226705  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0023  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.7 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00721211 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  32.95 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>