103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0359 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0359  CopY family transcriptional regulator  100 
 
 		 122 aa  241  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.666305 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  47.83 
 
 		 121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 122 aa  110  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  46.96 
 
 		 121 aa  107  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3208  CopY family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 125 aa  104  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.448139  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00935  transcriptional regulator, BlaI family protein  40.35 
 
 		 130 aa  105  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3737  CopY family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 123 aa  104  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 131 aa  103  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3585  transcriptional repressor, CopY family protein  42.86 
 
 		 124 aa  98.6  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  32.14 
 
 		 128 aa  92.8  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3882  CopY family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 122 aa  88.6  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0821415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2588  transcriptional repressor, CopY family  34.21 
 
 		 169 aa  88.2  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  32.46 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0993  beta-lactamase (penicillinase) repressor  33.91 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2407  penicillinase repressor  33.91 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1110  penicillinase repressor  33.91 
 
 		 133 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1175  penicillinase repressor  33.04 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1006  penicillinase repressor  33.91 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1078  penicillinase repressor  33.91 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3788  transcriptional repressor, CopY family  33.04 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00024943  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3223  transcriptional repressor, CopY family  31.25 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0628  copper transport repressor, CopY/TcrY family  28.21 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.922307 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1264  transcriptional repressor CopY, putative  29.06 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352624  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  33.04 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1873  transcriptional regulator  27.52 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171303  hitchhiker  0.00000000171103 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0560  transcriptional repressor, CopY family  29.06 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000680415  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2519  methicillin-resistance regulatory protein MecI  22.81 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0200801  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1547  negative transcriptional regulator - copper transport operon  28.57 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0031  CopY family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0031  penicillinase repressor  22.81 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2027  transcriptional repressor, CopY family  25.64 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129536  normal  0.867039 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0076  transcriptional repressor, CopY family  31.03 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726818  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1354  transcriptional repressor, CopY family  34 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0376  CopY family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0948  CopY family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000394556  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2069  CopY family transcriptional regulator  20.54 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.490832  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2747  CopY family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.513766  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2824  penicillinase repressor  24.11 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.167752  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0005  penicillinase repressor  23.85 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.014635  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0677  penicillinase repressor  25.42 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2354  CopY family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000228636  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1459  penicillinase repressor  23.21 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000472068  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0049  transcriptional regulator  27.42 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2422  CopY family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0381488  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0429  CopY family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2877  transcriptional repressor, CopY family  24.58 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0287  transcriptional repressor, CopY family  27.35 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.175686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3470  transcriptional repressor, CopY family  27.97 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2324  CopY family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  29.03 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0889  transcriptional regulator  22.61 
 
 		 151 aa  52  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6520  transcriptional repressor, CopY family  29.91 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.818398  normal  0.183506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  24.58 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0384  transcriptional repressor CopY  26.92 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  25 
 
 		 130 aa  50.4  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0165  transcriptional repressor, CopY family  25 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.272376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4716  transcriptional repressor, CopY family  27.83 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0722064  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2033  transcriptional repressor, CopY family  26.5 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2142  CopY family transcriptional regulator  40 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.325229 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  23.85 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3145  transcriptional regulator  22.88 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2754  transcriptional repressor, CopY family  26.05 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1648  transcriptional regulator  30.25 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645842  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4098  CopY family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.088589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2616  CopY family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.940233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1301  transcriptional repressor, CopY family  17.12 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0225104  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5182  transcriptional repressor, CopY family  23.48 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717917  hitchhiker  0.0058899 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  32.76 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  24.35 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0182  CopY family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0290  penicillinase repressor  29.47 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.837655  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0730  transcriptional repressor, CopY family  23.73 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  27.1 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3211  CopY family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  22.13 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2098  transcriptional repressor, CopY family  21.85 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.560575  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2556  transcriptional repressor, CopY family  40 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000130945  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  22.22 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  21.74 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1589  transcriptional regulator  25 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5968  transcriptional repressor, CopY family  25.21 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.930871 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4382  putative transcriptional regulator  22.88 
 
 		 126 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  23.08 
 
 		 146 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4388  transcriptional regulator, TrmB  27.35 
 
 		 125 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503101 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3133  putative transcriptional regulator  23.68 
 
 		 135 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0957082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1141  Penicillinase repressor  20.17 
 
 		 127 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  35.06 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  34.18 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9018  transcriptional repressor, CopY family  34.55 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07470  transcriptional regulator  22.69 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.717379  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3061  CopY family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>