More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0304 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  100 
 
 
986 aa  1956    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2193  Kojibiose phosphorylase  33.33 
 
 
780 aa  463  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0036  Kojibiose phosphorylase  36.78 
 
 
790 aa  445  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0720168  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1279  Kojibiose phosphorylase  35.6 
 
 
790 aa  443  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.192796  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2962  Kojibiose phosphorylase  36.72 
 
 
778 aa  435  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000307404  normal  0.340362 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1117  glycosy hydrolase family protein  32.15 
 
 
780 aa  429  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158926  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1437  Kojibiose phosphorylase  30.79 
 
 
788 aa  421  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217423  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0533  Kojibiose phosphorylase  36.46 
 
 
795 aa  422  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.704179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0497  Kojibiose phosphorylase  36.6 
 
 
795 aa  422  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0562  Kojibiose phosphorylase  36.6 
 
 
795 aa  422  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0403  Kojibiose phosphorylase  32.16 
 
 
781 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.10881  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  31.82 
 
 
965 aa  416  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0980  glycosy hydrolase family protein  30.82 
 
 
789 aa  409  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.966041  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14560  Kojibiose phosphorylase  31.27 
 
 
778 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000528962  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27210  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  35.25 
 
 
807 aa  389  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585996  normal  0.801027 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1809  Kojibiose phosphorylase  36.32 
 
 
784 aa  388  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3421  Kojibiose phosphorylase  35.42 
 
 
858 aa  388  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  31.12 
 
 
978 aa  385  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4347  glycoside hydrolase family protein  35.53 
 
 
804 aa  382  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138652  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3033  Kojibiose phosphorylase  36.78 
 
 
780 aa  379  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.10218  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02160  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  34.18 
 
 
825 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0241  Kojibiose phosphorylase  35.12 
 
 
800 aa  375  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1493  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  33.33 
 
 
786 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.310066  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20570  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  33.91 
 
 
843 aa  372  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.414924 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2887  family 65 glycoside hydrolase  35.29 
 
 
824 aa  372  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2817  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  34.76 
 
 
810 aa  369  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0216244  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09380  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  34.53 
 
 
848 aa  369  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2116  Kojibiose phosphorylase  34.32 
 
 
834 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2716  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  35.14 
 
 
787 aa  365  2e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5750  Kojibiose phosphorylase  36.16 
 
 
794 aa  359  9.999999999999999e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.06218  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1073  Kojibiose phosphorylase  34.55 
 
 
789 aa  359  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.15759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6405  Kojibiose phosphorylase  34.67 
 
 
784 aa  357  7.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.338097  normal  0.788674 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2513  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  35.86 
 
 
786 aa  351  4e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1472  Kojibiose phosphorylase  33.78 
 
 
790 aa  349  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0089  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  33.83 
 
 
777 aa  348  3e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472584  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0438  Kojibiose phosphorylase  33.68 
 
 
791 aa  343  8e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0525  Kojibiose phosphorylase  33.69 
 
 
791 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.659551  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1171  glycoside hydrolase family protein  34.8 
 
 
787 aa  336  1e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1188  Kojibiose phosphorylase  34.8 
 
 
787 aa  336  1e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.399982  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1198  Kojibiose phosphorylase  34.8 
 
 
787 aa  336  1e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51521  normal  0.0335974 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0531  Kojibiose phosphorylase  32.74 
 
 
781 aa  335  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4269  Kojibiose phosphorylase  31.49 
 
 
767 aa  336  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13436  hypothetical protein  34.3 
 
 
786 aa  328  3e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0422368  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0308  Kojibiose phosphorylase  32.95 
 
 
786 aa  323  8e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0258  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  34.34 
 
 
782 aa  318  2e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0054  maltose phosphorylase  27.25 
 
 
750 aa  298  3e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000286879  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1401  maltose phosphorylase  25.76 
 
 
767 aa  276  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.900484  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0398  Kojibiose phosphorylase  26.21 
 
 
755 aa  268  5e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00143976  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00420  Kojibiose phosphorylase  26.44 
 
 
780 aa  266  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1847  maltose phosphorylase  28.2 
 
 
751 aa  265  3e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0995  maltose phosphorylase  29.16 
 
 
752 aa  265  4e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0216  maltose phosphorylase  26.06 
 
 
758 aa  258  3e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000286832  hitchhiker  0.00000374663 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2869  Kojibiose phosphorylase  36.01 
 
 
760 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173251  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5087  maltose phosphorylase  34.03 
 
 
774 aa  255  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.076109  normal  0.646973 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1747  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  26.56 
 
 
778 aa  253  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05085  Trehalose/maltose hydrolase (phosphorylase)  24.74 
 
 
768 aa  251  4e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6156  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  36.89 
 
 
777 aa  251  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0140  Kojibiose phosphorylase  24.97 
 
 
763 aa  251  6e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0839  maltose phosphorylase  26.81 
 
 
710 aa  251  7e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0771265  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3917  Kojibiose phosphorylase  28.29 
 
 
748 aa  251  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.057945 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2202  Kojibiose phosphorylase  26.45 
 
 
775 aa  250  8e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.387396  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3314  Kojibiose phosphorylase  29.31 
 
 
805 aa  247  6e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0894  maltose phosphorylase  27.37 
 
 
752 aa  247  6.999999999999999e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2158  Kojibiose phosphorylase  28.21 
 
 
757 aa  245  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.848315 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1530  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  25.66 
 
 
759 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8722  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  30.84 
 
 
762 aa  243  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909698  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1203  Kojibiose phosphorylase  26.33 
 
 
807 aa  242  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204393  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0811  Kojibiose phosphorylase  26.7 
 
 
787 aa  239  2e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.427192  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1264  glycosy hydrolase family protein  27.31 
 
 
781 aa  238  4e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.353218  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2279  glycoside hydrolase family protein  27.67 
 
 
759 aa  237  9e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.7939 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2756  maltose phosphorylase  26.82 
 
 
771 aa  235  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.264043 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0190  maltose phosphorylase  25.49 
 
 
765 aa  232  3e-59  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01293  predicted hydrolase  28.47 
 
 
755 aa  229  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.940342  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2330  Kojibiose phosphorylase  27.57 
 
 
755 aa  229  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.21539  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2309  Kojibiose phosphorylase  27.57 
 
 
755 aa  229  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01304  hypothetical protein  28.47 
 
 
755 aa  229  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95805  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1431  glycosy hydrolase family protein  27.43 
 
 
755 aa  226  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1961  glycosyl hydrolase, family 65  28.47 
 
 
755 aa  225  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.756125  normal  0.752383 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0919  Kojibiose phosphorylase  31.01 
 
 
794 aa  221  3.9999999999999997e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.570777 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1194  Kojibiose phosphorylase  24.67 
 
 
787 aa  219  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0979  putative beta-phosphoglucomutase  50.71 
 
 
221 aa  218  5e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1527  glycosy hydrolase family protein  27.62 
 
 
755 aa  216  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1550  Kojibiose phosphorylase  24.11 
 
 
789 aa  215  3.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.31 
 
 
1050 aa  214  4.9999999999999996e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0038  Kojibiose phosphorylase  35.14 
 
 
761 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1281  Kojibiose phosphorylase  34.92 
 
 
761 aa  214  7.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1806  glycosy hydrolase family protein  28.8 
 
 
755 aa  213  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.769957  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2264  Kojibiose phosphorylase  29.61 
 
 
720 aa  211  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.170179  hitchhiker  0.00000128676 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20830  Kojibiose phosphorylase  26.07 
 
 
769 aa  209  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.93 
 
 
1053 aa  209  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3243  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  30.33 
 
 
749 aa  208  4e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1155  Kojibiose phosphorylase  31 
 
 
704 aa  203  9.999999999999999e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.162173  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  27.56 
 
 
1053 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.35 
 
 
1051 aa  200  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.47 
 
 
1051 aa  194  8e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  48.21 
 
 
215 aa  192  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1436  beta-phosphoglucomutase  49.24 
 
 
233 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0665793  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  47.42 
 
 
218 aa  192  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0483  trehalose and maltose hydrolase ( phosphorylase)  25.2 
 
 
769 aa  189  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0346  trehalose 6-phosphate phosphorylase  27.03 
 
 
807 aa  189  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0553991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>