More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0261 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0261  glutathione synthetase  100 
 
 
317 aa  642    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2081  glutathione synthetase  70.25 
 
 
315 aa  457  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0573  glutathione synthetase  66.35 
 
 
315 aa  426  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230424  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3690  glutathione synthetase  55.41 
 
 
318 aa  353  2e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0298114  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0324  glutathione synthetase  54.98 
 
 
313 aa  345  4e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.581413  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4600  glutathione synthetase  54.98 
 
 
315 aa  345  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0322  glutathione synthetase  53.96 
 
 
334 aa  343  2e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.720886  normal  0.322708 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4337  glutathione synthetase  54.02 
 
 
315 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326757  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2025  glutathione synthetase  55.59 
 
 
317 aa  343  2e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0401  glutathione synthetase  53.75 
 
 
313 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0145  glutathione synthetase  55.63 
 
 
313 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0722  glutathione synthetase  53.94 
 
 
318 aa  342  4e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0319  glutathione synthetase  54.11 
 
 
313 aa  341  9e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0338  glutathione synthetase  54.78 
 
 
315 aa  340  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.541659  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0419  glutathione synthetase  52.87 
 
 
313 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1113  glutathione synthetase  54.66 
 
 
317 aa  338  9e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68632  normal  0.482887 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3126  glutathione synthetase  53.63 
 
 
314 aa  337  9.999999999999999e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0178  glutathione synthetase  54.34 
 
 
317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.232344 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0876  glutathione synthetase  53.8 
 
 
320 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0117  glutathione synthetase  54.66 
 
 
317 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.376363  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0939  glutathione synthetase  54.11 
 
 
320 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0625904  normal  0.13486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0901  glutathione synthetase  54.11 
 
 
320 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.382175 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0783  glutathione synthetase  52.41 
 
 
312 aa  335  3.9999999999999995e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0180  glutathione synthetase  53.7 
 
 
313 aa  335  5e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3546  glutathione synthetase  52.27 
 
 
315 aa  333  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1815  glutathione synthetase  53 
 
 
316 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150956  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3589  glutathione synthetase  53.65 
 
 
312 aa  333  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0462  glutathione synthetase  52.68 
 
 
314 aa  332  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2131  glutathione synthetase  51.75 
 
 
312 aa  332  6e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3960  glutathione synthetase  52.53 
 
 
316 aa  331  8e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2798  glutathione synthetase  54.29 
 
 
340 aa  331  1e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2047  glutathione synthetase  51.43 
 
 
312 aa  331  1e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00139246  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0450  glutathione synthetase  52.23 
 
 
311 aa  331  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.319329  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0361  glutathione synthetase  52.1 
 
 
315 aa  328  5.0000000000000004e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.871301  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0872  glutathione synthetase  52.53 
 
 
318 aa  328  8e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0342772  hitchhiker  0.000771754 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3016  glutathione synthetase  50.63 
 
 
316 aa  322  6e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0901  glutathione synthetase  52.43 
 
 
314 aa  318  5e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0473  glutathione synthetase  50.32 
 
 
314 aa  318  6e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.031905 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2829  glutathione synthetase  53.02 
 
 
315 aa  318  7.999999999999999e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  0.703083 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3585  glutathione synthetase  51.1 
 
 
316 aa  316  4e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.676094  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1229  glutathione synthetase  49.52 
 
 
312 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1287  glutathione synthetase  42.01 
 
 
318 aa  251  8.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0548  glutathione synthetase  43.4 
 
 
328 aa  250  3e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2670  glutathione synthetase  44.27 
 
 
312 aa  249  5e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3063  glutathione synthetase  44.27 
 
 
312 aa  249  5e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3766  glutathione synthetase  41.38 
 
 
317 aa  247  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.725262  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03573  glutathione synthetase  42.22 
 
 
316 aa  247  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4323  glutathione synthetase  41.25 
 
 
315 aa  246  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0020  glutathione synthetase  42.86 
 
 
318 aa  246  4e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002462  glutathione synthetase  41.9 
 
 
316 aa  246  4.9999999999999997e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0574  glutathione synthetase  43.22 
 
 
316 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000193905  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2975  glutathione synthetase  41.96 
 
 
319 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3342  glutathione synthetase  42.01 
 
 
319 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0838  glutathione synthetase  42.01 
 
 
319 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.014661  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0471  glutathione synthetase  42.5 
 
 
317 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4026  glutathione synthetase  42.14 
 
 
316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0220005  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0836  glutathione synthetase  41.32 
 
 
319 aa  243  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2905  glutathione synthetase  44.66 
 
 
310 aa  241  9e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0831  glutathione synthetase  42.5 
 
 
315 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03292  glutathione synthetase  39.5 
 
 
329 aa  240  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1253  glutathione synthetase  41.25 
 
 
320 aa  238  6.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.271489  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4993  glutathione synthetase  41.56 
 
 
317 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3445  glutathione synthetase  42.19 
 
 
315 aa  238  9e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00475797 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0487  glutathione synthetase  41.38 
 
 
319 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0542  glutathione synthetase  41.64 
 
 
317 aa  238  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3909  glutathione synthetase  41.38 
 
 
319 aa  238  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000043929  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3711  glutathione synthetase  41.38 
 
 
319 aa  237  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0476586  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0599  glutathione synthetase  41.56 
 
 
317 aa  237  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625296  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4135  glutathione synthetase  41.59 
 
 
316 aa  237  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3225  glutathione synthetase  41.96 
 
 
315 aa  236  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00267386  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4867  glutathione synthetase  41.56 
 
 
317 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522949  normal  0.0172859 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5043  glutathione synthetase  40.94 
 
 
317 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3973  glutathione synthetase  41.9 
 
 
316 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0689  glutathione synthetase  41.88 
 
 
315 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00688489  normal  0.665368 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5035  glutathione synthetase  41.07 
 
 
319 aa  235  9e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3333  glutathione synthetase  41.32 
 
 
315 aa  235  9e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0352151  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5309  glutathione synthetase  41.38 
 
 
316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107271  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1152  glutathione synthetase  40.88 
 
 
320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3162  glutathione synthetase  41.9 
 
 
317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00627108  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0545  glutathione synthetase  40.94 
 
 
317 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0301988  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3214  glutathione synthetase  41.67 
 
 
318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0833  glutathione synthetase  41.14 
 
 
317 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000643207  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0655  glutathione synthetase  41.67 
 
 
318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0049  glutathione synthetase  43.04 
 
 
317 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0437692 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0471  glutathione synthetase  41.67 
 
 
318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379108  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2831  glutathione synthetase  41.67 
 
 
318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.718105  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0808  glutathione synthetase  41.14 
 
 
317 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000233048  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0502  glutathione synthetase  40.68 
 
 
317 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0490  glutathione synthetase  41.67 
 
 
318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0188  glutathione synthetase  41.67 
 
 
318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.582135  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1404  glutathione synthetase  41.67 
 
 
318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3527  glutathione synthetase  40.82 
 
 
317 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0840  glutathione synthetase  40.82 
 
 
317 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00539981  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0402  glutathione synthetase  41.8 
 
 
318 aa  230  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2033  glutathione synthetase  39.43 
 
 
327 aa  229  3e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0345  glutathione synthetase  41.96 
 
 
324 aa  229  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.791895 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0294  glutathione synthetase  40.88 
 
 
317 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0410  glutathione synthetase  41.21 
 
 
318 aa  229  5e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197255  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03170  glutathione synthetase  41.74 
 
 
318 aa  228  7e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2338  glutathione synthetase  41.4 
 
 
322 aa  227  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>