More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0260 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  100 
 
 
202 aa  403  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  51.52 
 
 
199 aa  218  7e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  42.71 
 
 
208 aa  177  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  41.92 
 
 
198 aa  174  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  43.43 
 
 
199 aa  166  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  44.44 
 
 
201 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  41.49 
 
 
206 aa  165  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  41.41 
 
 
202 aa  159  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  42.37 
 
 
205 aa  158  5e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  40.91 
 
 
202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  40.4 
 
 
202 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.79 
 
 
207 aa  148  6e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0103  putative alkaline phosphatase-like protein  47.27 
 
 
219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  44.24 
 
 
211 aa  144  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20761  DedA family alkaline phosphatase-like protein  40.43 
 
 
218 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.167528  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  35.87 
 
 
205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17501  DedA family alkaline phosphatase-like protein  43.64 
 
 
220 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1201  DedA family alkaline phosphatase-like protein  43.71 
 
 
218 aa  139  3e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0147  putative alkaline phosphatase-like protein  43.17 
 
 
219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629007  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  37.95 
 
 
214 aa  132  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.81 
 
 
202 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  36.14 
 
 
204 aa  131  6.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  36.36 
 
 
216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  33 
 
 
209 aa  127  9.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  34.34 
 
 
203 aa  122  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  34.34 
 
 
203 aa  122  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  34.05 
 
 
198 aa  121  6e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.36 
 
 
205 aa  121  7e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1525  SNARE associated Golgi protein  39.64 
 
 
228 aa  121  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365911  hitchhiker  0.00841691 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.88 
 
 
224 aa  120  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  32.21 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  38.36 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01771  DedA family alkaline phosphatase-like protein  43.65 
 
 
223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  37.21 
 
 
248 aa  119  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  39.16 
 
 
206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1717  DedA family alkaline phosphatase-like protein  39.89 
 
 
219 aa  118  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18341  DedA family alkaline phosphatase-like protein  38.76 
 
 
218 aa  118  6e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  34.3 
 
 
203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  38.55 
 
 
200 aa  115  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  36.17 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18161  DedA family alkaline phosphatase-like protein  39.89 
 
 
219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2561  hypothetical protein  38.37 
 
 
209 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  34.48 
 
 
232 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  33.33 
 
 
212 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.3 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  29.8 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18131  DedA family alkaline phosphatase-like protein  40.61 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00672405  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  35.03 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  30.69 
 
 
202 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0057  alkaline phosphatase like protein  32.84 
 
 
197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0483626  hitchhiker  0.00000117914 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5192  alkaline phosphatase like protein  32.98 
 
 
197 aa  112  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0400654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  34.22 
 
 
205 aa  111  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  33.33 
 
 
228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  34.39 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  35.33 
 
 
325 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.06 
 
 
241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  33.49 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  34.07 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2652  dedA family protein  30.65 
 
 
201 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000160491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  30.65 
 
 
201 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  33.66 
 
 
202 aa  108  5e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  30.65 
 
 
201 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  30.15 
 
 
201 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0130  hypothetical protein  32.42 
 
 
215 aa  106  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  31.19 
 
 
202 aa  106  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  37.34 
 
 
203 aa  105  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  34.15 
 
 
199 aa  105  3e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  32.52 
 
 
200 aa  105  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  29.65 
 
 
201 aa  105  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  32.73 
 
 
212 aa  105  5e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2436  dedA family protein  29.65 
 
 
201 aa  105  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243294  normal  0.259083 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2857  dedA family protein  29.65 
 
 
201 aa  105  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121771  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0079  membrane protein  38.41 
 
 
217 aa  105  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2646  SNARE associated Golgi protein  30.65 
 
 
218 aa  105  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00131391  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  33.16 
 
 
195 aa  105  6e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.76 
 
 
228 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2092  hypothetical protein  34.74 
 
 
266 aa  104  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.613654  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2571  DedA family protein  30 
 
 
201 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501826  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00380  uncharacterized membrane-associated protein  33.15 
 
 
225 aa  103  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.157749 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1053  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.52 
 
 
222 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  31.91 
 
 
213 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  32.32 
 
 
216 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  31.36 
 
 
207 aa  102  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2233  SNARE associated Golgi protein  35.08 
 
 
266 aa  102  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.300911  normal  0.0707133 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  34.78 
 
 
218 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  34.78 
 
 
218 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  34.78 
 
 
218 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.81 
 
 
201 aa  100  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  29.17 
 
 
210 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  36 
 
 
197 aa  99  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0759  SNARE associated Golgi protein  33.53 
 
 
202 aa  99  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.259781  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1537  SNARE associated Golgi protein  28.43 
 
 
200 aa  99  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2412  SNARE associated Golgi protein  33.54 
 
 
202 aa  99.4  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000349657  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2080  dedA family protein  28.88 
 
 
200 aa  99  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1898  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
200 aa  98.6  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0195021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1901  dedA family protein  32.65 
 
 
200 aa  98.2  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1864  DedA family integral membrane protein  32.65 
 
 
200 aa  98.2  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0968517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1854  DedA family integral membrane protein  32.65 
 
 
200 aa  98.2  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.359684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2048  DedA family protein  32.65 
 
 
200 aa  98.2  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2038  dedA family protein  28.34 
 
 
200 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>