111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0232 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  100 
 
 		 222 aa  427  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  52.8 
 
 		 213 aa  208  6e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  50.46 
 
 		 216 aa  181  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  44 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  48.25 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  43.8 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  39.6 
 
 		 264 aa  99.4  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  39.6 
 
 		 264 aa  99.4  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  42.14 
 
 		 193 aa  92.8  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 240 aa  92.4  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  39.85 
 
 		 210 aa  91.3  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  39.86 
 
 		 230 aa  89  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  41.55 
 
 		 235 aa  85.5  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  30.84 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  29.37 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  32.04 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  29.3 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  32.12 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  31.48 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  33.33 
 
 		 227 aa  72  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  33.79 
 
 		 261 aa  71.6  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  31.36 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  31.36 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  28.99 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  32.39 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  27.78 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  31.25 
 
 		 204 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  31.84 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  34.44 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2543  putative phage repressor  29.3 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0316  putative phage repressor protein  32.81 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00907838  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  35.86 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1643  repressor protein, putative  32.31 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2704  putative phage repressor  35.53 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1124  putative phage repressor protein  32.03 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000298454  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  33.33 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0569  phage repressor protein, putative  31.25 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.251206  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  30.06 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  34.68 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1743  putative phage repressor  41.46 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  35.25 
 
 		 284 aa  61.6  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  29.41 
 
 		 302 aa  61.6  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  27.94 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  28.9 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1409  putative phage repressor  40.65 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0696097  normal  0.123244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  33.33 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  27.85 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  31.66 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0780  putative phage repressor  30.85 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00131571  decreased coverage  0.000230988 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  35.83 
 
 		 144 aa  58.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3689  putative phage repressor  29.8 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0617  putative phage repressor  29.58 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  32.62 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  32.61 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  34.03 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  29.83 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  26.96 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0272  transcriptional regulator, putative  32.12 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.635671  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  29.83 
 
 		 256 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1549  Cro/CI family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 283 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188053 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  31.65 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  26.11 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  36.89 
 
 		 264 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  35.09 
 
 		 265 aa  52.8  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  33.07 
 
 		 237 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  39.39 
 
 		 231 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  32.28 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  28.57 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  33.6 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2335  putative phage repressor  32.48 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  unclonable  0.0000000160936 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  31.58 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  30.28 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0976  putative phage repressor  43.04 
 
 		 284 aa  49.7  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.786838  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  30.19 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  29.46 
 
 		 230 aa  49.3  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1866  putative phage repressor  30.97 
 
 		 244 aa  49.7  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  37.04 
 
 		 270 aa  49.3  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  32.82 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  24.88 
 
 		 243 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0818  transcriptional regulator  32.04 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.051861  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  28.87 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1013  DNA-binding protein  30.1 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.149474  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  33.71 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1011  putative phage repressor  31.75 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.763396  unclonable  0.00000301408 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  28.87 
 
 		 273 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  26.67 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  28.8 
 
 		 259 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  33.57 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4976  putative phage repressor  31.11 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1135  phage repressor  28.67 
 
 		 270 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  33.71 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4549  putative phage repressor  33.33 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  30.47 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  30.71 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4049  putative phage repressor  29.37 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00309972  hitchhiker  0.0000000001929 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  27.5 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  27.5 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>